美国«Emerging Infectious Diseases»2022年第4期有关人兽共患病论文摘译

P707 巴西埃及伊蚊城市综合监测作为虫媒病毒传播早期预警系统//AndréS.Leandro,Wagner A.Chiba de Castro,Renata D.Lopes,et al.

虫媒病毒流行病学缺少及时有效疫情警报信号的监测系统。我们综合了2017—2020年巴西伊瓜尔市昆虫学、流行病学和昆虫病毒学数据设计了一个综合监测系统。我们在整个城市覆盖了3 476个蚊媒容器,每2个月对容器进行检查并计算5个指标,包括传统调查幼虫的房屋指数(HI)与布雷图指数(BI),容器指数(TPI),以及成蚊密度(ADI)和成蚊叮咬指数(MII)。我们在容器里采集到的活体成年伊蚊中筛查到了登革热病毒、寨卡病毒和基孔肯尼亚病毒。成蚊捕获指标(TPI、ADI、MII)预测暴发水平高于传统的幼虫调查指数(HI和BI),我们能够在每一轮容器检查后36 h内绘制出虫害水平的分级统计图。定位自然感染的蚊媒为当地公共卫生官员确定干预应对领域的优先次序提供了及时的参考依据,防止病毒暴发。

P725 印度乌纳奥在艾滋病病毒暴发调查中发现的丙型肝炎病毒的系统发育分析//Arati Mane,Sunitha Manjari Kasibhatla,Pallavi Vidhate,et al.

2017—2018年印度北部乌纳奥区一次HIV 暴发调查中发现研究对象HCV 抗体高流行率。我们对HCV 样本的NS5B和核心基因的部分序列进行分型。我们观察到无论HIV 合并感染状态如何,病毒载量和HCV 序列均无关联,所有HCV 分离株均属于3a基因型。NS5B 系统发育中分离株的单系聚类表明疫情是由单个分离株或其近缘后代引起的。NS5B基因核苷酸替换率为6×10－3位点/年,核心基因核苷酸替换率为2×10－3位点/年。估计分离株最近的共同祖先的时间(t MRCA)是2012年,与此次疫情的时间线一致,可能原因是在寻求医疗保健时暴露于不安全注射。HIV-HCV 合并感染表明,需要进行系统监测和综合方法,将丙型肝炎检测和HIV 检测结合起来,以便早期发现和及时干预以阻止传播,加强医疗服务系统,增强社区能力,将分子分析作为实用的公共卫生工具。

P734 巴西献血者SARS-CoV-2 lgG 血清流行率作为COVlD-19 疫情监测指标//Daniel Gonçalves Chaves,Ricardo Hiroshi Caldeira Takahashi,Felipe Campelo,et al.

在大流行时期,不同来源的数据可以反映疾病流行过程不同方面的变化。血清流行病学调查可构成一致的流行演变。我们评估了2020年3—12月来自巴西7个城市7 837个献血者的SARS-Co V-2 IgG 血清流行率。我们基于已报告的SARS-Co V-2病例数和献血者血清学结果调整了模型一个输入值,输出了隐藏变量估计值,如SARS-Co V-2 日传播率和已报告、未报告病例的累积发病率。我们研究可通过调查献血者血清学样本获得城市人口累积发病率。这种方法可延伸应用在其他传染病。

P743 透析患者接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗4个月后对新冠变异株的免疫反应减弱//Alex Dulovic,Monika Strengert,Gema Morillas Ramos,et al.

血透患者是SARS-Co V-2 高危人群且病死率高,因此是最先接种SARS-Co V-2疫苗的人群。研究高危血液透析患者和健康捐赠者的德国队列接种2针疫苗后3周抗体反应的分析已经发表,我们使用干扰素-γ释放试验和多重免疫球蛋白(IgG)检测方法进一步评估该队列接种BNT162b2 疫苗(辉瑞公司和Bio NTech共同研发)4个月后血清和唾液中的细胞和体液免疫反应。通过血管紧张素转换酶2受体结合域竞争实验,我们深入比较疫苗诱导IgG对4种SARS-Co V-2变异株(Alpha、Beta、Gamma和Delta)的中和能力。与接种2 针疫苗后3 周对比,接种2针后6周对原始SARS-Co V-2分离物和变异株的细胞和体液反应大大减少,一些透析患者甚至未检测到B细胞或T 细胞反应。

P751 印度古吉拉特邦SARS-CoV-2早期传播动力学基因组流行病学//Jayna Raghwani,Louis du Plessis,John T.McCrone,et al.

由于许多COVID-19 高发国家基因组取样有限,阻碍了对SARS-Co V-2 基因组流行病学的研究。因此,关于病毒遗传多样性的产生和全球分布的重要问题仍然存在。我们调查了印度古吉拉特邦COVID-19第一波疫情期间SARS-Co V-2传播动力学,揭示疫情最严重地区之一的病毒传播情况。通过整合20个州的病例数据和434份全基因组测序样本,我们重建了古吉拉特邦SARS-Co V-2传播动力学和空间传播。我们的研究表明国际区域连接、人口密度是古吉拉特邦疫情暴发的主要原因。我们检测到上百条的病毒传播链,其中大多数涉及国际旅游。在古吉拉特邦,病毒传播主要从人口稠密区域向临近低密度人口区域传播,这表明中心城市不同程度地影响病毒传播。

P786 美国乔治亚洲孤星蜱中分离的中原病毒//Yamila Romer,Kayla Adcock,Zhuoran Wei,et al.

美国乔治亚洲报道了1例人暴露白尾鹿感染中原病毒(Heartland virus,HRTV)的死亡病例,因此2018—2019年在血清阳性白尾鹿和人类感染病例住所附近的26 个采样点开展蜱虫调查。我们对9 294只美洲钝眼蜱(一种孤星蜱)分为949个混合样本(不分性别与蜱龄,按所在地划分),通过非洲绿猴肾细胞(Vero E6)分离病毒和病毒逆转录PCR 扩增,对病毒分离或PCR 阳性的样本进行全基因组测序。有3 个样本检测到HRTV 阳性(最低感染率0.46/1000 蜱),未检测到Bourbon病毒(也可由美洲钝眼蜱传播);细胞培养证实HRTV 在2个样本中存在;全基因组测序表明样本中分离的3 株HRTV 高度同源,但与之前分离的HRTV 基因序列不同(见表1)。从美洲钝眼蜱分离到的HRTV病毒株及基因特征表明美国存在该病毒。临床医生和公共卫生专业人员应了解这种新发的蜱传病原体。

表1 2019年乔治亚洲普特南县和琼斯县美洲钝眼蜱样本HRTV阳性

P812 加拿大安大略省输入性恶性疟原虫耐药性分子监测//Ruwandi Kariyawasam,Rachel Lau,Eric Shao,et al.

多位点的单核苷酸多态性与恶性疟原虫耐药性相关。我们研究了2008—2009 年、2013—2014 年和2017—2018年3个时期加拿大输入性疟疾病例中恶性疟原虫耐药性标志物的流行情况。我们分析了atpase6(pf ATPase6)、pfcrt(氯喹耐药转运蛋白)、cytb(细胞色素b)、dhfr(二氢叶酸还原酶)、dhps(二氢膦酸合成酶)、mdr1(多耐药蛋白)和mdr1拷贝数,以及kelch13(13号染色体上的kelch蛋白基因)单核苷酸多态性。随时间的推移,我们观察到dhfrS108N 和dhpsA613T 的突变基因型增加,而mdr1 N86Y、mdr1 D1246Y、pfcrtK76T 和pfcrt74-75的突变基因型减少,未发现kelch13突变。氯喹耐药性突变随时间推移越来越少,这反映了非洲旅行者氯喹压力的降低,普罗胍耐药性突变随着时间的推移而增加。少量基因型证实了感染的异质性,可能导致治疗失败或复发。

P820 美国2020年新冠大流行期间门诊药房数据显示结核病例减少//Kathryn Winglee,Andrew N.Hill,Adam J.Langer,et al.

我们分析了一个药房数据集(IQVIA),2020年新型冠状病毒病大流行期间美国国家结核病监测系统(NTSS)报告的结核病例数比2016—2019 年平均病例数减少了20%。我们检验了结核药物分配数据与NTSS结核病例数之间的相关性,并使用季节性自回归综合移动平均模型来预测2020年的病例数。2016—2019年,结核药物治疗数据的趋势与NTSS数据的趋势相关。根据以往趋势,2020年结核病处方数和病例数比预期要少,在4—5月,这一降幅尤其大。IQVIA 数据与NTSS 一致,表明2020年病例大幅下降并非发生严重漏报,但不排除诊断不足或实际下降。了解2020年结核病例数下降背后的机制将有助于为大流行后结核病例数的可能反弹做好规划。