肿瘤蛋白翻译控制1的反义RNA 1在肺癌中的表达及其对肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
2022-04-04张龙王瑞赵佳
张龙,王瑞,赵佳
肺癌早期缺乏明显临床症状,易复发和转移,五年生存率依然较低[1-3]。探究肺癌发生发展的分子机制可为其治疗提供分子靶点[4-6]。肿瘤蛋白翻译控制1(TPT1)的反义RNA 1(TPT1-AS1)是一种在胃癌[7]、上皮性卵巢癌[8]等肿瘤中表达升高的长链非编码RNA(lncRNA),其促进这些肿瘤的发展进程。然而,TPT1-AS1 能否影响肺癌的发生发展还未知。Starbase 生物信息软件预测显示,TPT1-AS1 可能与微小RNA-671-5p(miR-671-5p)结合。miR-671-5p在肺癌组织中表达下调,可作为肺癌诊断的生物标志物[9]。本研究以TPT1-AS1/miR-671-5p轴为切入点,探究了肺癌发生发展的分子机制,报告如下。
1 资料与方法
1.1 一般资料46 例肺癌组织和对应癌旁组织取自于2017 年1 月至2018 年12 月在信阳市中心医院确诊并行手术治疗的肺癌病人,其中男28 例,女18例,年龄(63.25±8.76)岁;肺腺癌21 例,肺鳞癌25例。纳入标准:(1)经病理确诊为非小细胞肺癌病人;(2)术前未进行放疗、化疗。病人知情同意,本研究符合《世界医学协会赫尔辛基宣言》相关要求。
1.2 试剂A549 细胞系,中国科学院上海细胞库;BCA 蛋白检测试剂盒、RPMI 1640 培养基、Annexin V-FITC/PI 细胞凋亡试剂盒、MTT 和LipofectamineTM2000 试剂盒,北京索莱宝;PCR 实验相关试剂盒,大连宝生物工程有限公司;胎牛血清,浙江天杭;引物序列、TPT1-AS1小干扰RNA(si-TPT1-AS1)和过表达载体(pcDNA-TPT1-AS1)、小干扰RNA阴性序列(si-NC)、空载体(pcDNA)、TPT1-AS1野生型(WT)和突变型(MUT)荧光素酶报告载体、miR-671-5p 模拟物(mimcs)、抑制剂阴性序列(anti-miR-NC)、miR-671-5p抑制剂(anti-miR-671-5p)、模拟对照序列(miR-NC),上海吉玛制药技术有限公司;蛋白质印迹实验所需抗体,美国Santa Cruz公司。
1.3 实验方法
1.3.1 实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表达组织中总RNA 经Trizol试剂提取后,逆转录互补DNA(cDNA),行PCR扩增。扩增程序:先设置温度为95 ℃,进行预变性处理,时间为10 min。然后95 ℃条件下变性30 s,之后设置温度为58 ℃进行退火,时间为30 s;最后再设置温度为72 ℃进行延伸,时间为30 s,循环此过程,共35 个循环。引物序列见表1。2-ΔΔCt法计算组织中TPT1-AS1 相对GAPDH、miR-671-5p 相对U6 的表达量。
表1 引物序列
1.3.2 细胞培养和转染 用完全培养基(含10 %FBS的RPMI 1640培养基)培养A549细胞。将A549细胞接种于6 孔板中,每孔接种细胞数为1×105个。培养12 h 后,将LipofectamineTM2000 试剂分别与si-NC(si-NC 组)、si-TPT1-AS1(si-TPT1-AS1 组)、pcDNA-TPT1-AS1(pcDNA-TPT1-AS1 组)、pcDNA(pcD-NA组)、共转染si-TPT1-AS1与anti-miR-NC(si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组)、si-TPT1-AS1 与anti-miR-671-5p(si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 组)混合均匀,取100 μL 混合液缓慢加至6 孔板中,孵育细胞6 h。然后利用RT-qPCR 法检测细胞中TPT1-AS1 或miR-671-5p表达,验证转染效果后用于后续实验。
1.3.3 双荧光素酶报告基因实验 将A549 细胞接种于6 孔板中,每孔接种细胞数为1×105个。培养12 h 后,将LipofectamineTM2000 试剂分别 与TPT1-AS1-WT 和miR-671-5p mimic(或miR-NC)、TPT1-AS1-MUT 和miR-671-5p mimic(miR-NC)混合均匀,取100 μL 混合液缓慢加至6 孔板中,孵育细胞6 h。然后收集细胞细胞并裂解,3 500 r/min 离心10 min。取20 μL 上清液,将其与100 μL 1×萤火虫或海肾荧光素酶反应工作液混合均匀,检测萤火虫或海肾的荧光强度。细胞荧光素酶活性=萤火虫荧光强度/海肾荧光强度。
1.3.4 MTT 检测细胞增殖 将各组转染细胞接种于96 孔板中,每孔接种细胞数为2.5×104个。同时设对照组:接种未进行转染的A549细胞。培养24 h后,取5 g/L 的MTT 加至各孔(20 μL/孔),将细胞孵育4 h。弃培养基,加二甲基亚砜(150 μL/孔),反应5 min,振荡均匀。将96 孔板放入酶标仪检测卡槽中,设置λ 为490 nm,测各孔吸光度(A)值。存活率(%)=A实验组/A对照组×100%。
1.3.5 Transwell 检测细胞迁移和侵袭 迁移:取100 μL 各组转染细胞加至Transwell 小室上室,每室细胞数为1.0×104个。另取500 μL 完全培养基加至下室。培养24 h 后,弃培养基,将下室细胞依次固定、染色后,显微镜观察,拍照并计数。侵袭:将Matrigel 基质胶均匀地铺在Transwell 上室,待其干燥后,按照迁移实验的步骤操作。
1.3.6 蛋白印迹法检测细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、基质金属蛋白酶(MMP)-2 和MMP-9 蛋白表达 各组细胞中总蛋白经RIPA 试剂提取后,用BCA法定量,然后用SDS-PAGE实验分离。将分离蛋白转至PVDF膜,用5%脱脂奶粉封闭1 h。于4 ℃冰箱中分别用CyclinD1(1∶800)、MMP-2(1∶1 000)、MMP-9(1∶1 000)和GAPDH(1∶1 500)一抗孵育,过夜后洗膜。再置于山羊抗兔二抗(1∶5 000)中,37 ℃孵育1 h。加显影液显影,曝光拍照。
1.4 统计学方法用SPSS 22.0 软件进行统计学分析。实验数据均符合正态分布,以表示。癌旁组织和癌组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表达量的比较采用配对t检验;肺腺癌组和肺鳞癌组TPT1-AS1和miR-671-5p表达量的比较及荧光素酶活性检测结果的比较用独立样本t检验;对照组、si-NC 组、si-TPT1-AS1 组、si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组 和si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 细胞存活率、迁移数和侵袭数及CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白表达的比较均先用单因素方差分析,然后再用LSD-t检验进行组间两两比较。肺癌组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表达的相关性采用Pearson 相关性分析。差异有统计学意义以P<0.05表示。
2 结果
2.1 TPT1-AS1 和miR-671-5p 肺癌组织中的表达46 例肺癌病人癌组织中TPT1-AS1 表达量为1.88±0.12,较癌旁组织TPT1-AS1 表达量1.01±0.08显著升高(t=38.37,P<0.05);癌组织中miR-671-5p表达量为0.45±0.04,较癌旁组织中miR-671-5p 表达量1.01±0.06显著降低(t=46.14,P<0.05)。
2.2 不同病理分型肺癌组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p 的表达将46例肺癌病人分为肺腺癌组(21例)和肺鳞癌组(25 例)。肺腺癌组、肺鳞癌组病人的癌组织中TPT1-AS1 表达量分别为1.87±0.14、1.89±0.11,miR-671-5p表达量分别为0.47±0.05、0.45±0.04。两组间TPT1-AS1 和miR-671-5p 的表达比较均差异无统计学意义(tTPT1-AS1=0.54,P=0.590;tmiR-671-5p=1.51,P=0.139)。
2.3 肺癌组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p 表达的相关性Pearson 相关性分析显示,肺癌组织中TPT1-AS1 和miR-671-5p呈负相关(r=-0.63,P<0.05)。见图1。
图1 肺癌组织中肿瘤蛋白翻译控制1(TPT1)的反义RNA 1(TPT1-AS1)和miR-671-5p表达的相关性(线性方程:y=-0.230 65x+0.888,P<0.05)
2.4 肺癌细胞中TPT1-AS1 靶向调控miR-671-5pTPT1-AS1 与miR-671-5p 核苷酸序列的结合位点见图2。共转染TPT1-AS1-WT 与miR-671-5p 的A549 细胞荧光素素酶活性为0.42±0.06,较共转染TPT1-AS1-WT 与miR-NC 的A549 细胞荧光素素酶活性(1.04±0.07)显著降低(t=20.18,P<0.05);共转染TPT1-AS1-MUT 与miR-671-5p 的A549 细胞荧光素素酶活性为0.99±0.06,与共转染TPT1-AS1-MUT与miR-NC 的A549 细胞荧光素素酶活性1.00±0.05比较差异无统计学意义(t=0.38,P=0.706)。si-TPT1-AS1 组A549 细胞中miR-671-5p 表达水平显著高于si-NC 组[(1.81±0.09)比(1.05±0.05),t=22.15,P<0.05],而pcDNA-TPT1-AS1 组A549 细 胞 中miR-671-5p 表达水平显著低于pcDNA 组[(0.40±0.05)比(1.01±0.11),t=15.15,P<0.05]。
图2 TPT1-AS1与miR-671-5p的核苷酸序列结合位点
2.5 各组细胞增殖、迁移和侵袭能力比较si-TPT1-AS1 组A549 细胞存活率、迁移数和侵袭数较si-NC 组均显著降低(P<0.05)。si-TPT1-AS1+antimiR-671-5p组A549细胞存活率、迁移数和侵袭数较si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组均显著升高(P<0.05)。对照组与si-NC 组、si-TPT1-AS1 组与si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组各检测指标比较差异均无统计学意义(P>0.05)。见图3、表2。
表2 各组细胞存活率及迁移和侵袭细胞数/
表2 各组细胞存活率及迁移和侵袭细胞数/
注:①与si-NC组比较,P<0.05。②与si-TPT1-AS1+anti-miR-NC组比较,P<0.05。
2.6 各组细胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表达水平比较CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 蛋白在si-TPT1-AS1组A549细胞中的表达量较si-NC组均显著降低(P<0.05)。CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白在si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 组细胞中的表达量较si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组均显著升高(P<0.05)。对照组与si-NC 组、si-TPT1-AS1 组与si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 蛋白表达量比较均差异无统计学意义(P>0.05)。见图4、表3。
表3 各组细胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表达水平/
表3 各组细胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表达水平/
注:si-NC 为小干扰RNA 阴性序列组,si-TPT1-AS1 组为TPT1-AS1 小干扰RNA 组,si-TPT1-AS1+anti-miR-NC 组为TPT1-AS1 小干扰RNA 与抑制剂阴性序列共转染组,si-TPT1-AS1+anti-miR-671-5p 组为TPT1-AS1 小干扰RNA 与miR-671-5p 抑制剂共转染组,CyclinD1 细胞周期蛋白D1,MMP-2基质金属蛋白酶-2,MMP-9基质金属蛋白酶-9。①与si-NC组比较,P<0.05。②与si-TPT1-AS1+anti-miR-NC组比较,P<0.05。
图4 各组细胞中CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表达
3 讨论
TPT1-AS1 位于13 号染色体,其异常表达与多种肿瘤的发展进程密切相关。研究显示,TPT1-AS1是结肠癌组织中表达上调的lncRNA,与病人预后不良密切相关,其通过上调细胞中VEGFA的表达促进肿瘤血管生成和转移[10];TPT1-AS1 宫颈癌中TPT1-AS1 呈高表达,敲减TPT1-AS1 可通过负调控miR-324-5p 抑制宫颈癌细胞的恶性行为及上皮间质转化过程,进而阻碍宫颈癌的发展进程,TPT1-AS1 有可能成为宫颈癌治疗的分子靶标[11]。本研究结果显示,肺癌组织中TPT1-AS1的表达水平显著高于对应的癌旁组织,与相关报道结果一致[12],这提示TPT1-AS1可能参与肺癌的发生发展。
本研究通过下调肺癌细胞中TPT1-AS1 的表达发现,下调TPT1-AS1 可引起肺癌细胞增殖活性、迁移及侵袭能力均显著降低,这提示下调TPT1-AS1可能有利于延缓肺癌的发展进程,对改善肺癌病人预后具有积极作用。CyclinD1 对细胞增殖起促进作用,这与其促进细胞周期由G1 期向S 期转变有关[13]。MMP-2 和MMP-9 是能够降解细胞外基质的基质金属蛋白酶家族成员,对肿瘤细胞迁移和侵袭起促进作用[14]。本研究数据显示,下调TPT1-AS1降低了肺癌细胞中与增殖、迁移及侵袭相关的蛋白CyclinD1、MMP-2 和MMP-9 的表达,与相关报道结果一致[15-16],这进一步从蛋白水平说明下调TPT1-AS1 能够抑制肺癌细胞的恶性行为,TPT1-AS1 有可能成为肺癌治疗的分子靶点。
为了探究下调TPT1-AS1 抑制肺癌细胞恶性行为的分子机制,本研究证实了TPT1-AS1能够靶向结合并负调控miR-671-5p,这与肺癌组织中TPT1-AS1与miR-671-5p 表达呈负相关的结果一致。研究显示,miR-671-5p 是乳腺癌[17]、食管鳞状细胞癌[18]、胃癌[19]等肿瘤组织中表达降低的miRNA,其作为抑癌基因对这些肿瘤的发展起抑制作用。但也有报道称,miR-671-5p 在透明细胞肾细胞癌组织中呈高表达,发挥促癌基因作用促进该肿瘤细胞的恶性行为[20]。这表明miR-671-5p 在不同的肿瘤中发挥的作用不同。本研究显示,肺癌组织中miR-671-5p 表达下调,与Nymark 等[9]报道的结果一致,提示miR-671-5p 在肺癌中也起抑癌基因作用。此外,本研究利用恢复实验发现,miR-671-5p 表达的下调导致下调TPT1-AS1 对肺癌细胞恶性行为的抑制作用显著降低,与相关研究结果一致[21],进一步提示TPT1-AS1 通过靶向miR-671-5p 影响肺癌细胞恶性行为,但其具体作用的miR-671-5p的靶基因还有待探究。
综上所述,肺癌组织中TPT1-AS1 表达升高,miR-671-5p 表达降低,且两者呈负相关;下调TPT1-AS1导致肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭性受到抑制,这可能与下调TPT1-AS1 引起细胞中miR-671-5p 的表达上调有关,TPT1-AS1/miR-671-5p轴可能为肺癌的治疗提供了新靶点。但本研究仅通过体外细胞实验探究了TPT1-AS1 靶向miR-671-5p 对肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响,接下来将通过裸鼠移植瘤实验在体内观察TPT1-AS1/miR-671-5p 轴对肿瘤生长和转移的影响,同时对miR-671-5p 靶基因及下游信号通路进行探究。
(本文图3见插图4-2)
图3 Transwell检测细胞迁移和侵袭(结晶紫染色×200)