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非洲猪瘟病毒衣壳五邻体顶点蛋白(H240R)原核表达及免疫原性研究

2021-12-14王国强张怡青苏运芳李玉林尚立芝毕胜利樊志浩李生涛张振强王云龙

西南农业学报 2021年9期
关键词:缓冲液抗体小鼠

王国强,张怡青,李 果,苏运芳,李玉林,尚立芝, 毕胜利,樊志浩,李生涛,张振强*,王云龙*

(1.河南中医药大学,河南 郑州 450046;2.河南省生物工程技术研究中心,河南 郑州 450002;3.郑州职业技术学院,河南 郑州 450000;4.南阳农业职业学院,河南 南阳 473000)

【研究意义】非洲猪瘟(African Swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African Swine fever virus,ASFV)引起的家猪、野猪的一种急性、热性、高度接触性动物传染病,所有品种和年龄的猪均可感染,发病率和死亡率高可达100%[1-3]。世界动物卫生组织(World Organization for Animal Health,OIE)将其列为法定报告动物疫病,中国也将其列为一类动物疫病[4]。1921年ASFV首先在肯尼亚被发现,1957年传入欧洲,1971年传入南美,2017年传至俄罗斯并向东扩算至远东地区距离我国仅约1000 km的伊尔库茨克州,2018年传入我国[5-7]。2018年8月,农业农村部通报中国首例非洲猪瘟疫情,随后病毒很快传播到全国大部分地区。至今疫情已扩散至33个省份,超过130万头家猪被扑杀,全国能繁母猪存栏数量从2018年1月的4000万头降至了2019年7月的不足500万头,造成巨大经济损失[8-9]。中国是全世界最大的猪肉生产和消费国,面对近百年来ASFV首次进入及蔓延,我们对其入侵、组装、逃逸机制及相关蛋白相关研究还很不完善,迫切需要研究清楚ASFV功能蛋白作用,尤其是结构蛋白功能,为后期有效疫苗研发和ASFV防控提供支持。【前人研究进展】ASFV是一种独特的双链DNA病毒,直径长约250~260 nm,其基因组十分庞大而复杂,含有 150~167 个开放阅读框(Open reading frames,ORFs),可编码68种结构蛋白及100多种非结构蛋白,其中一半蛋白功能未知[10-12],对其病毒入侵、宿主细胞内复制、复制传播、保护性免疫以及逃逸机制仍然知之甚少[13]。这限制了ASFV复制、毒力相关基因的鉴定,以及基因工程疫苗的研制。但是随着冷冻电镜、病毒培养、晶体结构预测分析等技术的成熟,ASFV主要结构蛋白构象、功能、病毒入侵和逃逸机制及相关蛋白逐渐清晰。冷冻电镜结构表明:ASFV具有独特、精巧而复杂的五层结构,从外到内分别是外(囊)膜(Outer membrane)、衣壳(Capsid)、内膜(Inner membrane)、内核心壳(Core shell)以及核心基因组(Nucleoid),像是一个“俄罗斯套娃”,一层层嵌套,外层衣壳保护着内层蛋白和核酸结构[14-16]。2019年中科院生物物理所饶子和团队解析了高达4.1埃的ASFV衣壳结构,包括1个主要(P72)和4个次要的衣壳蛋白质(M1249L,p17,p49和H240R),位于衣壳外层的蛋白是五邻体蛋白(Penton),位于5次轴的顶点,通过分子量估算和二级结构预测,五邻体蛋白为非洲猪瘟病毒中的H240R蛋白。H240R蛋白有240个残基,富含β链,呈现1个单一的胶冻卷曲折叠和约70个氨基酸的N端延伸,推测其在ASFV组装中具有重要作用[14]。同时,H240R蛋白作为结构蛋白,并且位于顶点,推测其在宿主体内可刺激产生强烈免疫反应。【本研究切入点】本研究选择了ASFV BA71V毒株H240R序列(登录号:NP_042812.1)为靶序列,通过密码子优化后,人工合成基因序列,利用基因工程技术构建重组载体pET28a/H,转化大肠杆菌。优化工程菌株诱导和表达条件,目的蛋白以包涵体形式表达。目的蛋白经过包涵体洗涤、亲和层析纯化和复性后,H240R蛋白成功复性,并且可以和阳性血清反应。目的蛋白和ISA201佐剂乳化后,在小鼠体内诱导了抗体产生,抗体在二免后7 d迅速升高,抗体水平持续时间较短。【拟解决的关键问题】由于尚未有报道ASFV衣壳蛋白H240R原核表达及免疫免疫原性研究,因此本项实验可为进一步研究H240R蛋白其结构和功能,以及能否诱导产生保护性应答等方面提供借鉴。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株、重组质粒和主要试剂 大肠杆菌DH5α、BL21(DE3)和质粒pET28a(+)为本实验室保存;pUC57/H载体(含ASFV H240R基因)由生工生物工程(上海)股份有限公司合成并构建;限制性内切酶NdeⅠ和XhoⅠ、T4DNA连接酶、DNA Marker(DL5000)购自宝日医生物技术(北京)有限公司,PageRulerTMPrestained Protein Ladder(10~180kDa和5~245 kDa)购自赛默飞世尔科技公司,Ni-NTA 琼脂糖纯化树脂购自美国 QIAGEN 公司;异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(Isopropyl-β-Dthiogalactopyranoside,IPTG)干粉、抗His标签抗体购自北京索莱宝科技有限公司;卡那霉素(Kan)、咪唑购自上海生工生物工程有限公司;小鼠购自郑州大学实验动物中心;ASFV阳性血清(灭活)由洛阳普莱柯生物工程股份有限公司提供;ASFV P72(135~490 aa)原核表达蛋白由河南省生物工程技术研究中心提供,其它化学试剂均为分析纯,购自国药集团化学试剂有限公司。

表1 PCR用到的引物序列

1.1.2 引物 根据合成并优化后ASFV H240R基因序列设计扩增目的序列引物,上下游引物分别加NdeⅠ和XhoⅠ酶切位点以及相应保护性碱基,引物见表1,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

1.2 试验方法

1.2.1 生物信息学分析 利用 ExPASy 在线分析工具ProtParam(http://web.expasy.org /prot- param/) 分析H240R蛋白的分子量、等电点、氨基酸组成、原子数、稳定疏水性等理化性质。利用软件分析 DNASTAR 软件中的Protean 模块,对H240R 蛋白的二级结构进行分析。使用Swiss-Model(https://swissmodel.expasy.org/)同源建模,预测H240R 三级结构。

1.2.2 重组载体构建 以pUC57/H为模板,引物ASFVH-F/R,扩增目的片段。目的片段和质粒pET28a(+)分别经NdeⅠ和XhoⅠ双酶切、回收和连接,转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞,涂布卡那霉素抗性平板,37 ℃培养10 h,挑选单克隆并扩大培养,菌落PCR、提取质粒双酶切和测序鉴定正确的质粒命为pET28a(+)/H。

1.2.3 目的蛋白表达和纯化 测序正确的重组质粒pET28a(+)/H转化大肠杆菌表达菌株BL(DE3)感受态细胞,37 ℃培养过夜,挑取单克隆于含有卡那霉素抗性的LB液体培养基中37 ℃培养3~4 h,至OD600nm值为0.5~0.7,加入异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)至终浓度0.5 mmol/L,小量分别在37 ℃(5 h)、25 ℃(10 h)、16 ℃(20 h)3种不同的温度下诱导,10 000 r/min,离心10 min收集菌体,pH 8.0,20 mmol/L Tris缓冲液(含50 mmol/L Nacl)A重悬菌体,冰浴条件下超声破碎,12 000 r/min离心10 min,收集上清和沉淀,SDS-PAGE电泳鉴定。诱导条件确定后,按照最优条件大量诱导表达,超声破碎菌体,得到包涵体沉淀。

包涵体洗涤缓冲液一(缓冲液A+10 mmol/L EDTA+体积比0.1%的NP-40)重悬包涵体,超声混匀5 min,12 000 r/min离心10 min,沉淀用包涵体洗涤缓冲液液二(缓冲液A+1 mmol/L EDTA+2 mmol/L尿素)重悬洗涤,12 000 r/min离心10 min,沉淀用缓冲液B(20 mmol/L Tris+50 mmol/L NaCl+8 mmol/L尿素)充分溶解,12 000 r/min离心10 min后,上清可作为亲和层析上样的样品。含20 mL Ni2+的柱子用5倍柱体积的缓冲液B平衡,直接上样,流速为2 mL/min,上样结束,用含100 mmol/L咪唑的缓冲液B除杂,再用含300 mmol/L咪唑的缓冲液B洗脱目的蛋白。纯化蛋白通过SDS-PAGE进行分析。

1.2.4 目的蛋白复性和鉴定 目的蛋白复性:利用梯度透析复性目的蛋白,将20 mL含8 mmol/L尿素的目的蛋白装入透析袋(截留分子量10 KDa),依次用含6 mmol/L尿素+10%甘油、4 mmol/L尿素+10%甘油、3 mmol/L尿素+10%甘油、2 mmol/L尿素+5%甘油、1 mmol/L尿素+5%甘油的缓冲液A,进行透析。最后用缓冲液A透析。透析后蛋白12 000 r/min离心10 min后,上清用超滤管(截留分子量3 KDa)浓缩,浓缩至0.8 mg/mL,0.22 μm无菌针头滤器过滤后,分装-20 ℃保存待用。

免疫印迹:将复性的H240R蛋白SDS-PAGE 电泳,湿转至PVDF 膜,用含5%脱脂奶粉的PBST溶液 37 ℃封闭 2 h,PBST 洗涤3次,每次 5 min,用抗His标签抗体作为一抗37 ℃孵育 2 h,PBST 洗涤3次,使用 HRP 标记的山羊抗鼠二抗(1∶4000) 37 ℃孵育1 h,PBST 洗涤3次,最后用 DAB 显色;斑点-酶联免疫吸附试验(Dot-ELISA):将复性的蛋白每次3 μL加在NC膜中央,ASFV P 72蛋白(145~490aa)组为阳性对照,未诱导大肠杆菌BL21(DE3)菌体裂解物为阴性,自然风干后,再次滴加,共3次,用含5%脱脂奶粉的PBST溶液 37 ℃封闭2 h,PBST 洗涤3次,用ASFV阳性血清(灭活)作为一抗37 ℃孵育2 h,PBST 洗涤3次,使用 HRP 标记的兔抗猪二抗(1∶2000) 37 ℃孵育 1 h,PBST 洗3次,最后显色。

1.2.5 目的蛋白在小鼠体内刺激产生抗体检测 随机将15只昆明鼠分为3组,阴性组(PBS)和实验组(25和50 μg),每组5只。阴性对照组用PBS和佐剂(ISA 201)乳化制备,实验组用25和50 μg复性蛋白和佐剂(ISA 201)乳化制备,制备好的疫苗于昆明鼠背部皮下多点免疫,免疫两次,间隔14 d,免疫两次,0和14 d各免疫1次。分别在免疫前(0)、7、14、21、28、35和42 d小鼠尾静脉采血。全血37 ℃放置2 h,4 ℃ 静置4 h, 4000 r/min离心7 min,分离血清-20 ℃待用。用间接ELISA检测抗体水平及消长规律,用碳酸缓冲液(pH 9.6)稀释复性蛋白,100 ng/孔4 ℃包被过夜(12 h),弃去包被液,用含5%脱脂奶粉的PBST溶液 37 ℃封闭 2 h,250 μL/孔,弃去封闭液,100 μL/孔加入待测血清(1/100稀释),设置空白对照和阴性对照,37 ℃温育30 min,PBST 洗涤5次,加入HRP 标记的羊抗鼠二抗(1∶8000) 37 ℃温育30 min,PBST 洗涤5次,加入显色剂A(H2O2)和显色剂B(TMB)37 ℃温育10 min,2 mol/L 硫酸终止,酶标仪读数。

2 结果与分析

2.1 ASFV H240R蛋白组成、理化性质及抗原表位等生物信息学分析

ExPASy 在线分析工具显示,H240R蛋白由 240个氨基酸组成,蛋白分子质量为27.7 KDa;等电点为9.40,原子组不稳定系数为 44.28,平均亲水系数为-0.086,为不稳定性亲水蛋白,无跨膜结构域。 DNASTAR 软件预测H240R蛋白表位,有13个抗原表位,抗原指数高(图1-a)。通过Swiss-Model同源建模,得到3个模型,其中与已知T4噬菌体内切核糖核酸酶结构基因结构(第86~188位氨基酸残基),预测所得H240R蛋白第86~188位氨基酸的蛋白结构,由多个α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲结构组成(图1-b)。

2.2 重组载体构建、鉴定和目的蛋白表达

PCR扩增H240R基因片段,与原核表达载体 pET-28a(+)双酶切后,构建重组质粒pET28a(+)/H,质粒利用双酶切(图2-b)和测序进行鉴定。表达菌株BL21(DE3) /pET28a(+)/H分别在37 ℃(5 h)、25 ℃(10 h)、16 ℃(20 h)3种不同的温度,0.5 mmol/L IPTG下诱导表达,目的蛋白始终以包涵体形式表达(图2-c),确定诱导表达条件为:0.5 mmol/L IPTG,37 ℃诱导表达5 h。

2.3 目的蛋白纯化和复性

工程菌株BL(DE3) /pET28a(+)/H在0.5 mmol/L IPTG,37 ℃条件下,大量诱导。超声破碎离心后的包涵体蛋白经过洗涤缓冲液洗涤和亲和层析,得到纯化的目的蛋白(图3)。纯化的变性蛋白采用梯度透析进行复性,约有60%蛋白成功复性。

2.4 目的蛋白鉴定

纯化的目的蛋白通过Wstern和DOT-ELISA进行鉴定。Wstern结果显示:复性的H240R蛋白可以抗His抗体反应,大小在33 KDa左右,与预期大小相符(图4-a)。从DOT-ELISA结果可以看出复性的目的蛋白以及ASFV P72(135~490 aa)原核重组蛋白可以和两份阳性血清反应,且复性的H240R和阳性血清反应显色明显高于ASFV P72(135~490 aa)重组蛋白,表明复性的H240R蛋白具有很好的免疫反应性(图4-b)。

2.5 目的蛋白在小鼠体内刺激产生抗体消长规律

取0、7、14、21、28、35和42 d小鼠血清,PBS稀释后(1/100),用复性H240R蛋白包被的酶标板,通过间接ELISA检测。检测结果显示:第一次免疫14 d,试验组不同剂量(25和50 μg)免疫的小鼠均产生了抗体,二免后7 d(一免后21 d),抗体迅速升高,50 μg免疫小鼠抗体水平高于25 μg,二免后14 d均达到平台期,不同剂量之间抗体水平没有显著差异,二免后21 d抗体水平开始下降(图5)。抗体水平消长情况说明复性的H240R具有很好的免疫原性,可以在小鼠体内刺激产生高水平的抗体。

3 讨 论

ASFV会导致家猪和野猪的高发病率和死亡率,对两者都具有毁灭性打击,且在经济上具有重大意义的一种疾病,目前世界范围内没有可用的疫苗,控制方法仍为在受影响的地区进行地区隔离和动物扑杀。自2018年ASFV传入我国以来,给我国生猪产业造成巨大损失,这2年间,我国ASFV的防控取得了阶段性成果,疫情发生强度和数量均呈下降趋势,关键环节病毒污染情况得到改善,养殖户生物安全意识明显提高。由于我国生猪养殖体量大,中小养殖户多,养殖环境复杂,防控形式仍很严峻,也出现了新情况:境外疫情输入风险持续存在;病毒分布依然很广,传播途径难以完全阻断,防控工作存在薄弱环节,生猪贩运活动难监管;病毒已在部分野猪群中定殖,根除难度进一步加大[17-18]。针对ASFV防控新形势,我国农村农业部调整防控策略,于2020年8月印发《非洲猪瘟常态化防控技术指南(试行版)》的通知,建立了常态化防控机制。虽然这些措施对目前ASFV防控很有必要,但从长远来看,控制疫情,稳定生猪生产,甚至根除ASFV,还是需要疫苗来完成。因此,包括我国在内的世界其他国家,对ASF疫苗和抗ASFV药物有着强烈的市场需求。

ASFV基因组十分庞大,迄今为止,已经确定了11个完整的ASFV基因组序列,开放阅读框的数量因分离株而异。开放阅读框编码超过200多种蛋白,发现编码结构蛋白就有60多种,其中很多结构蛋白参与基因组复制和病毒感染,以及逃避宿主的防御系统。如pp220、pp62、p72、p54、p30、CD2v、p10、p12、p14.5和p17。pp220和pp62是ASFV多聚蛋白前体,都属于晚期感染蛋白,这些前体蛋白可被蛋白水解酶切割成成熟的病毒体蛋白(p150、p37、p14、p34、p35和p15),成熟蛋白在病毒衣壳的组装过程中起关键作用。ASFV p54和p30是非常重要的抗原结构蛋白,P54 是 ASFV 表达的早期膜蛋白,介导细胞凋亡,被认为是主要的毒力蛋白之一,同时也介导ASFV在细胞内的转运[19-20];P30在感染后 2~4 h 产生,在病毒DNA合成开始之前就已经产生并持续表达至病毒生命周期的结束,整个感染期间均持续表达,与病毒入侵宿主细胞有关,主要有参与病毒内化的功能,p30产生的抗体可阻止病毒内吞[21-22]。p72是病毒衣壳二十面体的主要成分,约占病毒蛋白总量的30%左右,具有高度的免疫原性,在病毒感染后期的病毒衣壳形成中非常重要[23-24]。CD2v是 ASFV 外膜蛋白中唯一特征性病毒糖蛋白,类似于 T 淋巴细胞表面粘附受体 CD2,具有吸附红细胞的特性,该蛋白能够识别宿主细胞的膜蛋白并与之结合,帮助病毒粒子吸附在宿主细胞表面和侵入细胞[25-26]。然而,由于ASFV基因编码的绝大多数蛋白功能及作用机制并不清楚,对其结构蛋白、病毒组装以及针对ASFV的抑制基因、逃逸相关蛋白、感染调节因子、天然免疫应答、有效抗体等的研究欠缺,近乎空白,这限制了ASFV复制相关蛋白和毒力相关蛋白的了解,以及相关疫苗的研制。2019年10月,我国首次解析了非洲猪瘟病毒全颗粒的三维结构,发现ASFV的衣壳结构包括一个主要衣壳蛋白质(p72)和4个次要衣壳蛋白质(M1249L、p17、p49和H240R),其中位于5次轴的顶点的H240R蛋白是ASFV的一个重要蛋白,但其详细结构和功能以及是否能刺激宿主产生中和抗体仍不清楚[14]。

本实验中,H240R蛋白在原核表达系统中,始终以包涵体形式表达。目的蛋白在透析复性时,从含8 mmol/L尿素的缓冲液降低到4 mmol/L时,可很快进行,不会产生蛋白析出,而4 mmol/L尿素减低到3 mmol/L时,蛋白极易析出,透析时间要长,尿素透析浓度下降速度要缓慢。同时,复性的H240R蛋白和佐剂ISA201乳化后免疫小鼠,抗体水平达到平台期后,维持时间较短,是蛋白自身原因,还是蛋白和ISA201佐剂不是最佳配伍,需要进一步研究。ASFV冷冻电镜结构解析推测H240R蛋白在病毒组装有重要作用,其具体作用机制以及其它功能仍未知,虽然H240R蛋白在小鼠体内诱导产生抗体,但这些抗体是否含有中和抗体,能否产生中和保护也需要进一步探究。

4 结 论

本试验人工合成了H240R全基因序列,利用原核表达系统表达目的蛋白,其以包涵体形式存在。目的蛋白通过亲和层析纯化,利用梯度透析进行复性,复性后的H240R蛋白和P72(135~490 aa)蛋白以相同浓度点样做DOT-ELISA,结果显示两者均可以和阳性血清反应,H240R蛋白显色程度更强。同时,H240R蛋白免疫小鼠诱导产生了强的抗体水平,这些表明H240R蛋白具有较好的免疫原性和免疫反应性。总之,H240R蛋白是ASFV一个重要结构蛋白,对其功能进行详细和全面研究,以期能更好了解ASFV的组装、入侵宿主、以及亚单位疫苗研制提供思路。

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