HIV-1感染者外周血长链非编码 RNA NEAT1和MALAT1水平检测及其与疾病进展的关系*
2021-11-26农委信
文 /农委信
艾滋病为全世界范围内严重公共卫生问题,依据国家卫健委网站消息得出,截止至2020年,全球艾滋病病毒感染者约有4000万,每年新增艾滋病病毒感染者约为200万。为此,早期检出并配合相应阻断治疗,可有效降低艾滋病患病人数。同时,寻找一种有效生物标志将其用于早期艾滋病诊断具有十分重要意义[1]。长链非编码RNA归为一类不具有翻译蛋白质功能、长度超出200个核苷酸的非编码RNA(In-cRNA),广泛参与机体内几乎所有生理、病理过程,可在表观遗传、转录水平以及转录后水平等多个层面上调节基因表达。同时,In-cRNA被证实可稳定机体外周血,表达水平可作为疾病早期诊断、预后评价。研究指出[2],In-cRNA与HIV-1感染中作用关系紧密,对HIV-1感染患者外周血T细胞系中的In-cRNA改变,发现NEAT1在HIV-1感染靶细胞过程中发挥着重要作用,转录后调控病毒表达及活化,并证实与HIV-1感染关系密切。MALAT1又称之为NEAT2,为迄今为止发现少数与病毒感染相关In-cRNA之一[3]。目前为止,IncRNA在HIV-1感染患者体内变化作用尚无报道。本文就HIV-1感染患者中两种In-cRNA变化水平进行以下综述,现报道如下。
1 HIV-1感染者外周血长链非编码 RNA NEAT1和MALAT1结构特点
1.1 NEAT1
NEAT1作为一种新的调控分子,NEAT1在固有免疫应答中发挥着重要调控作用。NEAT1为人类第11号染色体上的多发性内分泌瘤病I型转录位点转录而来。NEAT1基因主要编码2个转录本,即NEAT1-1、NEAT1-2。2个转录本均位于亚核体paraspeckles,为共享相同启动子,但具有不同的3,端处理机制。亚核体paraspeckles确切功能尚不清晰,对其研究得出,与黄体、乳腺形成及骨髓分化关系紧密。Paraspeckles内含有多种蛋白因子,包括SFPQ、p54nrb、RBN14和p54nrb,并参与到paraspeckles形成及形态位置,敲除或敲低NEAT1导致paraspeckles的分解[4]。Paraspeckles通过核保留RNA并调控基因表达,在其中发挥着至关重要作用。经过这种机制paraspeckles及其家族成员可在多个生物学过程中起着调控基因表达作用。
1.2 MALAT1
MALAT1编码基因定位在染色体11q13.1,转录本序列长约8kb,归属为基因间转录本。在转录后水平,两个内源RNA酶-Rnase P和Rnase Z可修饰MALAT1。初生的转录产物MALAT1在其多聚腺苷酸位点上游几百碱基处形成tRNA样三叶草二级结构,上述结果可被Rnase P特异识别,Rnase P结合三叶草结构后,可迅速与上游段剪切,形成大小为7072nt的MALAT1成熟转录本和近3,端小转录本两个片段。小转录本被转运至胞浆,经Rnase Z剪切加工,在CCA添加酶辅助作用下,其3,端加上CCA臂后可形成大小为61nt胞浆成熟tRNA样转录本,称之为Rnase Z-associated small cytoplasmic RNA,后续转送至细胞质。研究指出[5],RNA转录后修复,通过剪切、加帽等可增加RNA功能多样性,但masc RNA功能迄今未知。因此,对其功能上,无法将masc RNA与MALAT1联系紧密。MALAT1的5,端未存在帽子结构,不参与蛋白质翻译,3,没有ploy尾,但其是一个非常稳定的IncRNA,最新研究得出,因3,末端形成三螺旋结构。研究指出[6],MALAT1 3,末端形成三螺旋结构,并保护MALAT1 3,端免受3,-5,核酸外切酶的剪切,并维持MALAT1完整性。
2 HIV-1感染者与外周血长链非编码 RNA NEAT1和MALAT1关系
研究指出[7],NEAT1、NEAT2与恶性肿瘤发生、免疫应答调控、肺结核感染以及免疫系统疾病治疗关系紧密,对其治疗进程存在一定联系。研究指出[8],在肺结核患者中,血清中NEAT1、NEAT2表达水平检测,结果显示,患者水平异常升高。研究指出[9],乳腺癌患者中NEAT1处于高表达状态,且与肿瘤细胞增殖、集落形成关系紧密,表明NEAT1与乳腺癌发生相关。部分学者指出[10],对临床HIV-1感染患者中,NEAT1水平同样处于高表达水平,而NEAT1降低则促进病毒产生,主要机制是增加了HIV-1 mRNA从细胞核到胞质转运及出核。当病毒载量较高的未接受治疗HIV-1感染者中,NEAT1表达水平显著高于正常水平,对接受治疗且病毒复制被有效抑制的HIV-1感染者中,NEAT1表达水平接近正常水平,上述结果证实,HIV-1复制可促进靶细胞中NEAT1表达。MALAT1则作为最早发现与人类疾病相关联Inc RNA之一,早期被广泛用于非小细胞肺癌患者中。研究指出[11],对免疫系统疾病患者,当患者免疫力越低,则MALAT1表达异常增加,与疾病发展、转归相关,下调MALAT1表达能够提高巨噬细胞清除病原菌能力。研究指出[12],对未接受治疗HIV-1感染者中,MALAT1水平较高,对接受治疗HIV-1感染者中水平偏低,血浆MALAT1水平改变不显著。MALAT1同样与其他病毒感染相关,如非典感染者肺组织中MALAT1高表达。目前对HIV-1感染者MALAT1高表达相关机制尚不明确,仍需进一步研究。
3 HIV-1感染者中外周血长链非编码 RNA NEAT1和MALAT1与疾病进展关系
研究指出[13],NEAT1和 MALAT1在HIV-1感染中主要作用为抑制病毒RNA出核,对调控基因表达为Inc RNA的重要作用之一。因此,Inc RNA可能未参加HIV-1前病毒活化过程。目前相关研究指出[14],NEAT1、MALAT1与前病毒DNA有一定关系,与某些Inc RNA通过转录因子NFAT作用,间接调控HIV-1前病毒表达,进而指出,Inc RNA与HIV-1潜伏感染形成相关。目前所得出研究结果得出[15],NEAT1、MALAT1表达与HIV-1感染关系紧密,对疾病进展起着重要影响,但目前对其作用机制尚未完全阐明,仍需进一步深入分析。血浆NEAT1水平与CD4+T细胞数量呈现正相关,提示NEAT1水平可作为HIV-1感染某一个潜在生物学标志。由于目前临床对NEAT1、MALAT1与HIV-1感染相关研究较少,对其结论尚无大数据支持,但多数研究得出,免疫性疾病、肿瘤疾病发生发展与NEAT1、MALAT1关系密切。
4 小结
随着国内检验学技术不断发展,高通量测序及基因芯片技术应用,对基因诊断上应用越来越广泛。目前In-cRNA指出与疾病发生、发展关系紧密。NEAT1、MALAT1表达异常与疾病形成关系紧密。但目前临床多数研究仅在NEAT1、MALAT1表达与肿瘤疾病发生发展关系紧密。随着后续对NEAT1、MALAT1表达相关研究不断深入,并不断拓展至免疫性疾病,HIV-1感染中,NEAT1、MALAT1在疾病进展中发挥一定作用,且血浆中NEAT1可作为潜在HIV-1感染病程进展生物标记物。