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牧医所揭示不同尾型中国绵羊品种群体遗传差异

近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所利用高密度单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）芯片数据对我国不同尾型的地方绵羊品种进行了有效群体大小估计、全基因组长纯合片段（ROH）扫描及高频ROH基因组区段鉴定，检测出不同群体特有和共有的ROH基因组区段，为保护和开发利用我国地方绵羊品种、深度挖掘功能基因提供了重要参考。相关成果发表在《畜牧与生物技术杂志（Journal of Animal Science and Biotechnology）》（IF＝5.032）上。

据相关人员介绍，良好的近交控制是畜禽遗传改良和畜牧业可持续发展的重要保障。传统的利用系谱信息评估近交（FPED）在实际应用中存在系谱信息难收集、错误率高、历史近交被忽略等问题。随着全基因组测序和基因芯片等成本的降低，利用分子信息评估近交成为研究的热点。研究人员利用高密度SNP芯片数据（600k）对大尾寒羊、阿拉泰羊、呼伦贝尔羊、草原短尾羊和西藏羊等不同尾型的五个绵羊品种进行了连锁不平衡检测、有效群体大小估计、观测杂合度和期待杂合度近交系数计算（FHOM），基于ROH进行了全基因组近交系数计算（FROH）。结果显示，多种遗传多样性评估结果与FROH评估结果几乎一致。特别是基于ROH检测到大尾寒羊群体最高的平均近交水平达到0.0808，并且具有最高比例的ROH片段（0.037），表明该群体近世代有效群体小、近交程度高，与大尾寒羊的群体现状相吻合。此外，研究人员基于不同群体内高频ROH区域，筛选出了与群体特征一致的重要经济性状基因，例如与绵羊尾部脂肪沉积相关的PDGFD、HOXA10基因，与生长发育相关的TNNI1、CSRP1、EEF1A2基因。

蜜蜂单倍体雄性和二倍体雌性胚胎发育的lncRNA调控机制研究被揭示

近日，中国农业科学院蜜蜂研究所蜂产品质量与风险评估创新团队揭示了lncRNA调控的蜜蜂单倍体雄性和二倍体雌性胚胎发育机制，填补了单倍体二倍体昆虫胚胎发育调控机理的空白，为进一步评估危害因子影响蜜蜂胚胎发育奠定理论基础。相关研究成果发表在《细胞与发育生物学前沿（Frontiers in Cell and Developmental Biology）》上。

据相关人员介绍，蜜蜂是单倍体二倍体生物，受精卵（二倍体）发育为雌性，未受精卵（单倍体）发育为雄性。胚胎发育是一个转录程序高度协调转变的过程，当前研究多集中于对受精卵发育的解析，天然的单倍体未受精卵如何协调其基因组激活与调控尚不清楚。长链非编码RNA（lncRNA）在单倍体二倍体生物胚胎发育中的调控功能也鲜见报道。

研究者分别采集了产卵后24、48、72小时的雌雄蜜蜂胚胎。在合子基因组激活（ZGA）过程中，二倍体雌性和单倍体雄性胚胎转录本差异显著，雌性胚胎出现三波典型的ZGA表达高峰，而雄性胚胎的基因组激活明显较弱且被延迟。值得注意的是，研究发现了数千个随三个ZGA高峰而表达增强的lncRNA，其中73%是从内含子区域转录，65%是雌性蜜蜂胚胎特有。另外，研究还发现了雄性单倍体胚胎中特异表达的lncRNA，其中包括被研究过但并未报道与胚胎发育相关的Nb-1。以上发现提出了新的发育调控模型：内含子编码了数千个lncRNA，这些lncRNA的表达被ZGA触发且具有二倍体胚胎特异性，在蜜蜂单倍体二倍体胚胎发育的基因表达调控中发挥潜在功能。