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基于文献计量学的氮沉降对土壤微生物影响的可视化分析

2021-06-22于美佳叶彦辉段少荣韩艳英

安徽农业科学 2021年9期
关键词:土壤微生物文献计量学可视化分析

于美佳 叶彦辉 段少荣 韩艳英

摘要 [目的]為了解国内氮沉降对土壤微生物研究的方向和热点。[方法]选取2005—2019年CNKI数据库中文核心期刊、硕博论文和Web of Science(WoS)核心合集收录的相关文献为数据样本,基于文献计量学的可视化分析,以知识图谱为研究载体,通过Excel、CiteSpace等分析软件为工具,对所选数据进行关键词的聚类分析,同时绘制各类相关数据分析以及图谱。[结果]从发表年份来看,我国氮沉降对土壤微生物研究较晚,始于2005年,一直到2015年左右才达到峰值状态,核心期刊近些年保持平稳状态,硕博论文从2016年发文达到峰值之后,逐渐回落。SCI论文除2009、2012、2016年有轻微下降外,从总体上看保持上升趋势。从关键词来看,在核心期刊和硕博论文中,土壤微生物与土壤呼吸有紧密联系。“碳”(carbon)、“多样性”(diversity)和“生物”(bioma)一直是SCI论文中氮沉降对土壤微生物的研究热点。从研究作者来看,我国氮沉降对土壤微生物研究领域的核心作者形成了以卢明珠、方华军、曹子铖和徐梦等人、商帅帅、王春梅和李俊青等人、向元彬、周世兴和黄从德等人为联系的作者合作关系图谱。发表SCI论文最多的作者是Donald R Zak,Stefan Scheu和Stefan Scheu发文量紧随其后。从研究机构来看,中国科学院大学在氮沉降对土壤微生物领域研究发文量最多,从硕博论文来看,东北师范大学最多。SCI论文发文量排前2位的主要是Chinese Acad SCI和Chinese Acad SCI University,说明中国的科研机构就氮沉降对土壤微生物研究较广泛。[结论]近些年的研究热点与未来发展有可能是生物多样性、荒漠草原、常绿阔叶林和磷脂脂肪酸等研究。SCI论文中显示出的未来研究热点可能是细菌群落和有机碳的研究。

关键词 氮沉降;土壤微生物;文献计量学;CiteSpace;可视化分析

中图分类号 S058 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2021)09-0230-07

doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2021.09.062

Abstract [Objective] To understand domestic nitrogen deposition on soil microbial research direction and hotspot. [Method] Database of CNKI from 2005 to 2019 Chinese core journals, Thurber papers and Web of SCIence(WoS)core collection of relevant literature were selected as the data samples. Based on the visual analysis of literature metrology, we used knowledge map as the research carrier. Keywords clustering analysis of the selected data was selected through the analysis software tools such as Excel, CiteSpace. At the same time, all kinds of related data analysis and mapping were carried out. [Result] From the aspect of year of publication, the research of nitrogen deposition on soil microorganisms in China was relatively late, which started in 2005 and did not reach its peak until 2015. The core journals maintained a stable state in recent years, and the master and doctoral papers gradually declined after reaching their peak in 2016. Except for a slight decline in 2009, 2012 and 2016, SCI papers generally maintain an upward trend. From the aspect of key words, soil microorganisms are closely related to soil respiration in core journals and master and Doctoral dissertations. “Carbon”, “diversity” and “bioma” have been the research sites of soil microorganisms by nitrogen deposition in SCI papers. From the aspect of study author, the core authors of the research field of nitrogen deposition on soil microorganisms in China formed a cooperative relationship map of authors with Lu Mingzhu, Fang Huajun, Cao Zicheng, Xu Meng, Shang Shuaishuai, Wang Chunmei and Li Junqing, Xiang Yuanbin, Zhou Shixing and Huang Congde as human contacts. Donald R Zak is the author of the most SCI papers, followed by Stefan Scheu and Stefan Scheu. From the aspect of research institutions, the University of Chinese Academy of Sciences has published the most papers on nitrogen deposition in the field of soil microorganisms, and from the perspective of Master and doctoral theses, northeast Normal University has the most papers. Chinese Acad SCI and Chinese Acad SCI University rank the top two in the number of SCI papers published, indicating that Chinese scientific research institutions have conducted extensive researches on soil microorganisms regarding nitrogen deposition. [Conclusion] Recent research hotspots and future development may be biodiversity, desert steppe, evergreen broad-leaved forest and phospholipid fatty acids. The future research hotspot shown in SCI papers may be the research of bacterial community and organic carbon.

Key words Nitrogen deposition;Soil microorganisms;Bibliometrics;CiteSpace;Visual analysis

化石燃料的燃烧、化肥的生产和使用以及畜牧业集约化经营等人类活动向大气排放了大量的氮化物,并不断向陆地和水生生态系统沉降[1]。随着我国社会经济的发展,氮沉降量可能还会继续升高[2]。我国是世界三大氮沉降集中区域之一,仅次于欧洲和美国,1961—2000年我国活性氮的排放从1.4×1010 kg/a升至6.8×1010 kg/a,预计在2030年将上升至1.05×1011 kg/a[3]。因此,氮沉降引发的一系列全球问题会越来越受到人类广泛关注。

土壤微生物有适合自己的土壤氮环境,过量的氮沉降会对土壤微生物造成一定程度的影响,可以改变土壤微生物群落结构组成,甚至可以改变一些微生物的生物功能[4]。随着过量的氮沉降输入和氮饱和的出现,微生物群落的结构和功能将会发生改变,过高的氮沉降会减少微生物量,降低物种多样性[5-8]。氮添加对土壤微生物的影响还要考虑到施氮量、类型、季节以及微生物种类等因素。

氮沉降对土壤微生物的影响一直是科研人员研究的重点,所以相关的文献计量学统计分析很有必要。文献计量学就是以文献体系和计量特征作为研究的对象,运用数学、统计学等计量方法,研究文献的分布、数量、变化和管理,进一步探讨科学技术的某些结构、特征和规律的一门学科[9]。笔者采用文献计量学的研究方法,借助Excel、Origin和CiteSpace等对2005—2019年氮沉降对土壤微生物在知网和WoS收录的文献进行统计,通过统计出的文献,探寻氮沉降对土壤微生物的规律、分布以及未来走向,为今后土壤微生物对氮沉降的响应研究提供参考。

1 数据来源与研究工具

1.1 数据来源

该研究的中文核心数据库选自中国知网(China National Knowledge Infrastructure,简称CNKI),搜索中国知网官网,进入高级检索页面,首先在期刊栏勾选核心期刊,然后选择硕博论文。时间选择2005年1月1日—2019年12月31日,检索字段勾选“主题”,检索主题词为“氮沉降”和“土壤微生物”,进行检索。去除无效信息以及人工纠错后,将2005—2019年我国氮沉降对土壤微生物影响的所有文献进行筛选统计,最后统计出核心期刊154篇,硕博论文181篇。

英文SCI(Scientific Citation Index)数据库来自Web of Science(WoS)核心合集为数据来源,时间跨度为2005—2019年,搜索主题(Topic)为“nitrogen deposition“和“soil microorganism”。下载文件格式选择“纯文本文档”,以便为后续分析做准备,筛选统计出英文文献216篇。检索日期为2020年7月31日。

1.2 研究工具

借助Excel、Origin以及可视化处理软件CiteSpace,用Excel软件对检索数据进行合并、去重统计进行分析[10]。CiteSpace是由美国德雷赛尔大学陈超美博士开发的信息可视化分析软件,具有开放性、可视化性等特征[11],适用于多元、分时、动态的复杂网络分析,能够显示特定知识点在一定时期的研究布局和前沿领域,是梳理知识结构的重要工具[12]。该研究以可视化分析为载体,从整体上把握氮沉降对土壤微生物的影响,梳理未来研究热点问题,为今后的深入分析研究提供参考。

2 结果与分析

2.1 发文情况

每年的发文情况可以清楚直观地表明我国氮沉降对土壤微生物影响情况[13]。如图1所示,我国氮沉降对土壤微生物影响的相关文献大致呈现逐年增加趋势。在核心期刊论文方面,一共有154篇。其中2005—2010年我国关于氮沉降對土壤微生物影响方面的发文保持平稳增长;2011—2012年保持平稳状态,即每年6篇核心期刊的发文量;2013—2015年再次呈近乎直线增长态势,其中2015年发文量最多,达21篇;2016—2019年,除2017年有轻微波动外,其他年份保持每年发文20篇的平稳发展。国内以“氮沉降”和“土壤微生物”为关键词发表在核心期刊的文献始于2005年,薛璟花等[4]“氮沉降增加对土壤微生物的影响”发表在《生态环境》期刊上,开创了中国氮沉降对土壤微生物领域研究的新纪元,为今后中国进一步研究相关研究作出了理论依据。

在硕博论文方面,氮沉降对土壤微生物研究领域发文量一共有181篇。2005—2008年除了2005和2008年发文量是空白之外,其余每年各有1篇发文;2009—2016年,硕博论文发文量呈现出增加趋势,其中2016年发文量达到顶峰,有30篇;2017—2019年,发文量又趋于下降态势。国内以“氮沉降”和“土壤微生物”为关键词发表在硕博论文始于2004年,荣兴民[14]研究了王朗国家级自然保护区森林土壤养分与微生物的分异特征,为王朗自然保护区土壤微生物种群研究提供指导意见。该研究的2005—2019年时间段内,第1篇硕博论文为2006年,万宏伟[15]研究了内蒙古高原成熟和退化羊草草原群落物种功能特性与土壤微生物量C、N、P对氮素添加的响应,进一步解释了氮素添加对草地生态系统的影响,对今后研究氮沉降对陆地生态系统响应有借鉴意义。

在英文论文SCI方面,氮沉降对土壤微生物研究领域发文量共有216篇。2005—2019年中,除2009、2012、2016年发文有轻微下降之外,从总体上看保持上升趋势。2005年Johnson等[16]揭示了土壤微生物氮磷循环。2005—2007年发文量都保持5篇/a,2008年论文土壤急剧增加到10篇,2009—2010年又开始缓慢下降,但幅度不明显。2011—2015年,除2012年小幅度下降之外,其他年份都保持稳步上升趋势。2016年小幅回落之后,从2017年开始一直到2019年,发文量又开始保持上升趋势,2019年发文量骤增,达到31篇/a。2019年Zhang等[17]研究表明,随着未来大气氮沉降量的增加,微生物对沉降NH4+和NO3-的选择性利用可能会增加森林土壤NO3-的潜在损失,特别是在中国,近年来大气沉降NH4+/NO3-有所下降,这对未来进一步研究氮沉降对土壤微生物的影响有一定启示性意义。

2.2 研究状况

文章中的关键词表达了论文主题以及核心观点[18],以“关键词”为切入点了解我国氮沉降对土壤微生物影响的研究进展对今后进一步研究很有意义。通过CitesSpace 5.7.R1对154篇核心期刊的关键词进行可视化分析,见图2a。在CNKI以Refworks格式导出并保存,WoS中以纯文本导出。在CiteSpace中设置时间段为2005—2019年,时间切片为1 a,节点类型为keyword,TopN=50,TopN%=10%,共得到243个节点、554条关系连线,网络密度为0.018 8,Q值为0.696 6,大于0.500 0,S值为0.807 3,大于0.500 0,图谱结果可信。节点数表示关键词个数,边数是关键词之间的连线数,文字大小与出现频次成正比,字体越大,出现频次越多,连线粗细代表紧密程度[19]。通过知网自带可视化分析对181篇硕博论文关键词进行聚类分析,得到关键词聚类图谱,见图2b,归纳分析得出2005年以来我国氮沉降对土壤微生物影响研究的高频词,见表1。通过CitesSpace 5.7.R1对216篇SCI论文的关键词进行可视化分析,见图2c。在CiteSpace中设置时间段为2005—2019年,时间切片为1 a,节点类型为keyword,TopN=50,TopN%=10%,共得到353个节点、1 963条关系连线,网络密度为0.0316,Q值为0.427 1,略小于0.500 0,S值为0.745 9,大于0.500 0,图谱结果基本可信。

2.2.1 期刊论文关键词分析。

从图2a和表1可以看出,氮沉降对土壤微生物研究在微生物群落组成方面研究更多。倪壮等[20]对南亚热带常绿阔叶林土壤微生物群落研究发现,南亚热带地区氮添加增加会改变土壤微生物的群落组成,且施氮的影响具有明显的季节差异,进而可能影响这些微生物驱动的关键生态过程,真菌与细菌比率也会随施氮水平增加而减少[21]。

2.2.2 硕博论文关键词解释的研究现状。

从图2b和表1可以看出,土壤呼吸是氮沉降对土壤微生物研究的分析热点与纽带。王泽西等[22]通过对亚高山林的土壤微生物和土壤呼吸施氮监测发现,对土壤呼吸各指标和土壤微生物碳氮都有极显著的影响,施氮能促进土壤全呼吸、自养呼吸、异养呼吸通量和土壤微生物生物量碳氮的增长。不同浓度梯度氮沉降处理对土壤微生物和土壤呼吸的影响不同,低氮处理对林分根生物量密度有促进作用,同时显著提高了土壤微生物量,从而增强土壤呼吸温度敏感性[23]。高氮处理下土壤微生物量增量降低,而其微生物活性下降[24],导致土壤呼吸温度敏感性降低。在氮输入对土壤呼吸的利弊方面,试验认为氮输入促进了植物生长,增加了生态系统初级生产力和凋落物量,这些改变增加了根和土壤微生物活动所需的碳源,为土壤呼吸提供更多的物质基础[25]。但Mo等[26]认为,氮沉降降低了根系生物量和土壤微生物量碳,从而导致土壤呼吸速率降低。Zhu等[27]在内蒙古半干旱草原的研究发现,氮沉降通过影响地下生物量从而对土壤呼吸速率产生影响。

2.2.3 SCI论文关键词解释的研究现状。

从图2c和表1可以看出,“碳”(carbon)、“多样性”(diversity)和“生物”(bioma)一直是SCI論文中氮沉降对土壤微生物的研究重点。Sun等[28]通过对含有微生物群落和土壤有机碳组成的青藏高原亚高山针叶林增温和施氮发现,气候引起的土壤变暖可能会增加土壤CO2排放,但这种影响可能很大程度上抵消同时增加N沉积亚高山针叶林。Zhou等[29]对盆栽试验10个月的大气氮沉降试验发现,NH+4/NO-3为2/1时,提高土壤酶活性和微生物碳氮量,施氮降低了土壤微生物活性,改变了土壤细菌群落。众多文献表明,SCI论文中氮沉降对土壤微生物的研究多集中在微观领域研究。

2.3 研究作者

研究作者共现图谱表明氮沉降对土壤微生物领域研究的核心作者与关联作者合作关系,核心期刊的研究作者更能体现作者合作关系。通过CitesSpace 5.7.R1,对154篇核心期刊的发表作者进行可视化聚类分析,生成氮沉降对土壤微生物研究作者的共现图谱,见图3a,共得到265个节点,567条关系连线,Q值为0.947 3,大于0.500 0,S值为0.638 9,大于0.500 0,图谱结果可信。形成了以卢明珠、方华军、曹子铖和徐梦等人、商帅帅、王春梅和李俊青等人、向元彬、周世兴和黄从德等人为联系的作者合作关系图谱。对216篇SCI论文的发表作者进行可视化聚类分析,生成氮沉降对土壤微生物研究作者的共现图谱,见图3b,共得到357个节点,401条关系连线,Q值为0.977 8,大于0.500 0,S值为0.696 3,大于0.500 0,图谱结果可信。

发表核心期刊论文在8篇以上的作者分别是卢明珠、方华军、曹子铖、徐梦、商帅帅、程淑兰、王春梅、耿静、李俊青和向元彬。其中,卢明珠在氮沉降对土壤微生物研究的发文量最高,达16篇;方华军发文量仅次于卢明珠,为15篇。发表SCI论文最多的作者是Donald R Zak,达9篇,Stefan Scheu和Stefan Scheu发文紧随其后,有4篇(表2)。这些专业领域的研究者,为氮沉降对土壤微生物领域研究作出了突出贡献,有利于今后相关问题研究的进一步探讨。

2.4 研究机构

研究机构反映了科研实力和学术方向。借助CitesSpace 5.7.R1对154篇核心期刊的研究机构进行聚类分析,见图4a,共得到164个节点,175条关系连线,Q值为0.826 7,大于0.500 0,S值为0.559 1,高于0.500 0,图谱结果可信。从图4a可以看出核心期刊的研究机构,分别形成了以中国科学院、四川农业大学和北京林业大学为核心的研究机构。一般来说,硕博论文联合培养较少,饼状图更能体现研究机构占比情况,通过知网可视化分析对181篇硕博论文进行分析,见图4b。从图4b可以看出,东北师范大学在氮沉降对土壤微生物研究方面培养人才较多,共发表硕博论文21篇,占总数的11.6%,北京林业大学紧随其后。借助CitesSpace 5.7.R1对216篇SCI论文的研究机构进行聚类分析,见图4c,共得到254个节点,396条关系连线,Q值为0.776 5,大于0.5,S值为0.612 5,高于0.500 0,图谱结果可信。其中中国科学院(Chinese Acad Sci)发文量最多,达44篇;发文第2多的为中国科学院大学(Chinese Acad Sci University),达18篇以上。

根据2005—2019年核心期刊发文情况分析可知,排名前10的研究机构见表3。中国科学院大学在氮沉降对土壤微生物领域研究的发文量达到26篇,是该领域发文数量最多的研究机构。中国科学院二级学院发文量较多的有地理科学与资源研究所、资源与环境学院、研究生院和沈阳应用生态研究所。除此之外,福建师范大学地理科学学院、北京林业大学环境科学与工程学院、北京建筑大学建筑结构与环境修复功能材料北京市重点实验室和北京林业大学林学院发文量也遥遥领先。核心期刊发文量在前10名的研究机构一共发文有153篇,占总发文量的99.4%,说明氮沉降对土壤微生物研究的科研机构分布特别集中,以中科院及相关科研机构为主。SCI论文发文量在排前2位的主要是Chinese Acad Sci和Chinese Acad Sci University,说明中国的科研机构关于氮沉降对土壤微生物研究较广泛。除此之外,发文量排在前10名的还有Gottingen University(哥廷根大学)、Minnesota University(明尼苏达大学)和Michigan University(密歇根大学)等。这说明氮沉降对土壤微生物研究已经成为世界热点研究话题,共同深入探讨形成机理对揭示其中的未来影响很有启示性意义。

2.5 研究热点

CiteSpace的Timezone选项可以依据关键词图谱说明不同时段的研究热点,如图5a所示。从前沿态势图谱可以看出,最开始的氮沉降对土壤微生物研究始于2006年,曹裕松等[30]首次在森林层面进行研究,结果表明模拟氮沉降对湿地松林表土碳释放过程有非常强的抑制作用,且随着氮处理浓度的升高而加强。纵观时区态势图谱,在2005—2019年氮沉降对土壤微生物研究的最右端发展趋势与热点有:生物多样性、荒漠草原、常绿阔叶林和磷脂脂肪酸等。这些热点关键词可以作为今后该领域的前沿讨论方向。近些年,通过分子手段进行微观分析逐渐成为研究热点话题。黄静等[31]通过模拟氮沉降和增温对荒漠草原土壤细菌群落组成和多样性等影响进行试验,以了解气候变化对荒漠草原土壤细菌群落组成和多样性的影响。关于常绿阔叶林的文献众多,如郑裕雄等[32]在季节方面的研究,周世兴等[33]通过施氮和降水结合的试验。磷脂脂肪酸相关研究在近些年很热,高士杰等[34]利用静态箱-气相色谱法研究土壤呼吸组分和磷脂脂肪酸方法研究微生物群落丰度和群落结构的改变,微生物呼吸的降低反映了土壤有机质分解速度的降低,促进土壤碳的积累,进而氮促碳汇。

从图5b可以看出,就SCI论文研究热点而言,从2005年就开始了土壤微生物群落(Soil microbial community)的研究,研究人员通过对发生在海岸鼠尾草灌丛植被的南加州草本入侵和施氮,分析了这些变化对土壤微生物群落的影响[35]。近些年,SCI论文开始着重研究细菌群落(fungal community)和有机碳(organic carbon)的研究。2019年,Li等[36]对湿地森林微生物群落進行研究,发现在中性土壤pH环境中,pH波动是细菌和真菌丰度和多样性的主要影响因素。真菌的多样性更依赖于土壤中固相组分的种类和相对含量,而不是细菌。Fang等[37]通过5年模拟氮磷添加在田间养分调控试验发现,氮沉降通过改变土壤微生物群落和酶活性,抑制了氮沉降对森林有机碳分解的积极作用,而施氮会提高土壤磷的有效性,可能会增加森林有机碳的积累,说明今后在微观群落和土壤有机碳研究可能成为热点话题。

3 结论与建议

纵观氮沉降对土壤微生物研究历程,土壤呼吸、土壤养分与土壤酶活性是与之联系密切的热点。该研究通过Excel统计、CNKI可视化和CiteSpace软件,分析了2005—2019年氮沉降对土壤微生物领域发表的154篇核心期刊论文、181篇硕博论文和216篇SCI论文,从一定角度揭示了氮沉降对土壤微生物领域的研究情况,有助于分析今后该领域的积极

发展。

①发表年份。我国氮沉降对土壤微生物研究较晚,始于2005年,一直到2015年左右才达到峰值状态,核心期刊近些年保持平稳状态,硕博论文在2016年发文达到峰值,之后逐渐回落,说明硕博研究氮沉降对土壤微生物研究有一定研究空间。SCI论文除2009、2012、2016年有轻微下降之外,从总体上看保持上升趋势。

②关键词。在核心期刊和硕博论文中,土壤微生物与土壤呼吸有紧密联系。“碳”(carbon)、“多样性”(diversity)和“生物”(bioma)一直是SCI论文中氮沉降对土壤微生物的研究热点。

③研究作者。我国氮沉降对土壤微生物研究领域的核心作者形成了以卢明珠、方华军、曹子铖和徐梦等人、商帅帅、王春梅和李俊青等人、向元彬、周世兴和黄从德等人为联系的作者合作关系图谱。发表SCI论文最多的作者是Donald R Zak,Stefan Scheu和Stefan Scheu发文紧随其后。

④研究机构。从核心期刊来看,中国科学院大学在氮沉降对土壤微生物领域研究发文量最多,从硕博论文来看,东北师范大学最多。SCI论文发文量在排前2位的主要是Chinese Acad SCI和Chinese Acad SCI University,说明中国的科研机构对氮沉降对土壤微生物的影响研究较广泛。

⑤研究热点。2005—2019年,核心期刊论文中,近些年的研究热点与未来发展有可能是生物多样性、荒漠草原、常绿阔叶林和磷脂脂肪酸等研究。SCI论文中显示出的未来研究热点可能是细菌群落(fungal community)和有机碳(organic carbon)的研究。

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