美国《Emerging Infectious Diseases》2020年第11期有关人兽共患病论文摘译
2021-03-26林志龙
P2543 关于新生儿败血症的微生物暗物质问题//Shamim A. Sinnar, Steven J. Schiff
新生儿败血症(NS)每年导致75万名婴儿死亡。及时的诊断并使用与致病菌相匹配的抗菌药物能有效治疗NS,但对大多数疑似NS患儿的血液培养未能检出致病病原体。我们将这些未能被培养检出的可疑病原体称为微生物暗物质。鉴于血培养的低检出率,许多非培养基技术正在被探索用于诊断NS,包括PCR、16S扩增子测序和全基因组测序。然而,这些较新的技术很少能在全球范围内被推广和持续应用。为了减少全世界因NS引起的死亡,一种可能的方法是在发病人群中找到病原体。由于病原体的传播方式可以在空间和时间上发生变化,因此可以建立计算模型,按地区和季节预测引起NS的病原体。这种方法有助于为患者提供最佳治疗方案,减少NS导致的死亡,提高抗菌药物管理水平,直到有效诊断方案在全球范围内得到推广。
P2549 两次大流行、一个挑战—利用结核病实验室分子检测能力快速发现COVID-19病例//Susanne Homolka, Laura Paulowski, Sönke Andres,等
在许多情况下,正在流行的冠状病毒病(COVID-19)与其他重大的公共卫生威胁相类似,特别是结核病。利用结核病分子诊断基础设施(近年来在世界范围内得到了很大的发展)对COVID-19病例的发现可能是有益的。我们分析了使用结核病诊断和研究的基础设施进行严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)检测的可能性。我们通过调整12个质量体系基本框架去适应COVID-19和TB的检测,重点关注质量控制。我们的结论是,特别是在资源匮乏的条件下,结核病诊断基础设施原则上可被扩展用于SARS-CoV-2检测。结核病研究的基础设施还有助于SARS-CoV-2的测序,以研究全球病毒的进化和多样性。但是,结核病和SARS-CoV-2检测都必须遵循质量管理的基本原则,以确保有效结果和尽量减少生物安全危害,并且必须始终确保结核病诊断服务的连续性。
P2586 从生物安全3级实验室中移除管制病原样本的验证方法//Alexandria E. Kesterson, John E. Craig, Lara J. Chuvala,等
美国联邦政府管制病原计划规定,美国境内所有研究实体必须严格评估实验室方案,对从防护区域移走的样品充分灭菌。我们验证了使用无菌过滤和甲醇去除下列管制病原的操作步骤:兔热病杆菌、类鼻疽假单胞菌、鼻疽假单胞菌、鼠疫耶尔森菌和炭疽杆菌。我们以甲醇处理鼻疽假单胞菌进行了验证。这些验证再次确认样品在实验室之间转运时,安全方案使研究人员保持样品充分完好。
P2598 文莱不同场所SARS-CoV-2的传播分析//Liling Chaw,Wee Chian Koh, Sirajul Adli Jamaludin,等
我们报告了严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)在文莱不同场所中的传播情况。最初的一组SARS-CoV-2病例为19名在马来西亚参加塔布里·扎马特集会的人,导致出现52例本地传播病例。发病率最高的情形出现在随后于文莱举行的一次宗教集会(14.8%)和与会者家庭中(10.6%)。有症状患者的家庭发病率(14.4%)高于无症状者(4.4%)和有前驱症状者(6.1%)的家庭发病率。工作场所和社交场所的发病率<1%。我们的分析强调,SARS-CoV-2的传播因环境、行为和宿主因素而异。我们要识别潜在的超级传播事件的危险信号,特别是长时间暴露在封闭场所的密集人群,近期有到SARS-CoV-2感染活跃地区旅行的人,以及他们的群体行为。我们提议用不同的检测策略来应对不同的传播风险。
P2607 泰国使用个人防护措施与感染SARS-CoV-2风险的病例对照研究//Pawinee Doung-ngern, Rapeepong Suphanchaimat, Apinya Panjangampatthana,等
我们评估了个人防护措施对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染的有效性。我们的病例对照研究包含在泰国的211例冠状病毒病(COVID-19)病例和839例对照者。病例被定义为接触COVID-19患者后被检测出SARS-CoV-2阳性的的无症状感染者;对照组是从未检测出阳性的无症状接触者。与接触期间不戴口罩相比,始终戴口罩与SARS-CoV-2低感染风险呈独立相关;在接触过程中间断戴口罩并不能降低感染风险。我们发现所戴口罩的类型与感染并不是独立相关,而且在接触中一直戴着口罩者更可能保持社交距离。与COVID-19患者保持1米以上的距离、密切接触时间≤15分钟以及勤洗手均与低感染风险呈独立相关。我们的研究结果是鼓励坚持戴口罩、洗手和保持社交距离以预防COVID-19。
P2617 SARS-CoV-2在长途飞行中的传播//Nguyen Cong Khanh, Pham Quang Thai, Ha-Linh Quach,等
为了评估严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)在飞行中的传播力,我们调查了一组病例,他们来自一趟10 h商业航班上的乘客。受影响的人是乘客、机组人员及其密切接触者。我们对217名乘客和机组人员的行踪进行追溯,并对他们进行面谈、检测和隔离。在感染SARS-CoV-2的16人中,坐在商务舱的乘客有12人(75%)包含出现症状者(发病率62%)。坐得近与感染风险增加密切相关(RR:7.3,95%CI:1.2~46.2)。我们没有发现其他传播方式的强有力的证据。在长途飞行中,可能是1名有症状的乘客在机上传播导致了一大群聚集病例,见图1。感染SARS-CoV-2的乘客的流行病学和临床时间轴见图2。预防航空旅客感染SARS-CoV-2的指导原则应考虑乘客个人的感染风险、旅行人数和飞行时间。
图1 2020年3月2日从英国伦敦飞往越南河内的越南航空公司54次航班上,后来证实感染了SARS-CoV-2的乘客座位分布图。
图2 2020年3月2日从英国伦敦飞往越南河内的越南航空公司54号航班上证实感染了SARS-CoV-2的乘客的流行病学和临床时间轴。