全流程病理样本追踪和管理系统的使用体会
2020-11-03包春娟
李 丽,陈 菲,包春娟,包 骥,朱 琨
为提高科研病理实验室开放平台的工作效率和实现病理样本的全面追踪,四川大学华西医院病理研究室与赛默飞世尔科技共同研发了一套适用于科研病理实验室的全流程病理样本追踪和管理系统(以下简称PathTraq)。PathTraq覆盖科研病理实验室样本处理的每个流程,确保进入实验室的每个样本都能被及时正确地处理。2017年3月病理实验室试运行PathTraq,经不断更新完善能真正实现病理样本从进入实验室到完成制片,样本每个处理流程的操作时间、操作人员、操作仪器都能完整地记录到PathTraq,并通过二维码实现包埋盒和玻片打号系统与PathTraq无缝连接,实现按需打印,有效避免流程中过多的人为操作带来的差错,有效提高工作效率及准确性[1]。现将本实验室两年来PathTraq的使用体会介绍如下。
1 材料与方法
1.1 材料与仪器设备PathTraq系统,架构在云平台上,云平台海量的存储空间可以满足PathTraq数据的长期存档。赛默飞全套病理设备(包括取材台、包埋盒打印机、脱水机、包埋机、冷台、石蜡切片机、冷冻切片机、玻片打号机、全自动HE染色机及免疫组化染色机、封片机)及数码摄像头、与病理设备相连接的电脑6台、二维码扫描枪6把。
1.2 PathTraq流程
1.2.1病理申请 本院各科研项目课题组的老师及研究生在本病理实验室管理员的允许下申请到登录PathTraq系统的账号。当课题组有实验动物组织样本需送检时,登录PathTraq系统进行科研病理申请,申请成功后可获得唯一的病理申请二维码。
1.2.2样本登记 病理实验室接收样本的老师通过胸牌号登陆PathTraq系统,扫描病理申请二维码并核对送检样本信息,核对无误后即可在样本登记界面完成样本登记。每个病理申请二维码完成样本登记后即可生成匹配的唯一病理号。
1.2.3取材工作站 各课题组送检的复杂无序的科研组织样本包埋盒编号经PathTraq简化成有规律的编号(病理号+蜡块流水号+取材部位的信息),取材部位的信息需送检者登录PathTraq取材界面输入。PathTraq系统根据取材记录自动打印包埋盒,每个包埋盒上均有唯一的二维码,彻底取代使用PathTraq前包埋盒上无序的手工编号(图1)。
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1.2.4脱水工作站 操作者登入PathTraq系统进入脱水界面,扫描当日需脱水的组织包埋盒二维码,匹配对应的脱水机,然后点击开始脱水,第二天脱水结束时,在脱水界面点击脱水结束。PathTraq系统能够追踪每个样本的脱水状态,包括开始时间、结束时间、操作技术员等信息。
1.2.5包埋工作站 操作者登入PathTraq系统进入包埋界面,扫描包埋盒二维码,系统自动提示样本的详细信息,方便包埋时核对,如有异常能够及时发现。若发现包埋的组织块数与取材记录的组织块数不符、组织缺失,可以进行包埋备注,并致电送检者到现场确认。
1.2.6切片工作站 操作者登入PathTraq系统进入切片界面,扫描蜡块二维码,系统显示蜡块详细信息,并自动打印玻片,从源头杜绝捞错片的情况发生。若发现组织内含线头或脱水不全等异常问题及时进行切片备注,组织内含线头及时与送检者确认,脱水不全操作者要告知实验室负责人,以便找出脱水不全的原因,及时解决,保证切片质量。
1.2.7染色封片 操作者登入PathTraq系统进入染色界面,扫描玻片二维码记录染色封片的操作人、操作时间。
1.2.8制片确认 操作者登入PathTraq系统进入制片确认界面,集成二维码批量扫描仪,能够大批量、自动、快速地扫描玻片。支持手动添加样本,并完成制片确认操作。
1.3 PathTraq功能
1.3.1查询工作站 送检者登入PathTraq系统进入查询界面,输入病理号或送检者姓名进行查询。一旦查询到已制片确认,送检者可以到病理实验室取走石蜡组织块及其染色的所有玻片。病理实验室工作人员不需花时间电话告知送检者样本已处理结束。
1.3.2统计报表 其常用统计功能可以满足常规工作量统计(各操作步骤、染色项目、每位工作人员的月度工作量),便于病理实验室的绩效评估,提高技术人员的工作积极性。
2 结果
PathTraq系统在本病理实验室运行2年多,经上万个样本测试,从样本进入实验室、样本登记、取材、脱水、包埋、切片到染色完成(常规HE染色、特殊染色、免疫组化染色及免疫荧光染色等),目前全流程病理样本追踪系统(图2)涵盖上述所有操作环节。每个步骤的操作时间、操作人员、操作仪器及操作程序都能完整地记录到追踪系统,避免实验过程中人为差错,一旦出错系统也能及时追踪,同时保证实验操作的规范化和标准化。
图2 全流程病理样本追踪和管理系统操作界面
3 讨论
科研病理实验室是面向全院有科研项目课题组开放的病理技术平台。送检组织主要来源各课题组实验动物(如大鼠、小鼠、兔、狗等),每次送样常常是几组实验动物样本,实验室未使用PathTraq系统前各课题组同期送检样本的包埋盒编号凌乱无规律,并且课题组解剖动物时习惯性把送检组织先放入手工书写包埋盒再放入固定液,这样操作不利于组织固定[2]。使用PathTraq系统后严格要求先固定组织再在取材工作站按需打印包埋盒取材,规范操作后不但有效提高组织的固定效果并且每批送检样本有唯一的病理号,让无序的蜡块有序化,从而有效提高工作效率。送检组织常常除了做常规HE染色外,同时还需增加特殊染色、免疫组化、免疫荧光或凋亡检测等,PathTraq能按需打印所有染色的切片彻底取代手工书写,不但提高了工作效率且能有效避免手工书写导致的差错。由于实验室没有配专业的实验病理诊断医师,所以科研病理实验室样本制片确认后就跟各课题组交接,由课题组完成阅片采图等后续工作。希望未来实验室能配专业的实验病理诊断医师承担科研实验病理阅片工作,共同提高科研水平。
病理实验室运行PathTraq系统的优点如下:(1)整个流程通过二维码实现病理样本和病理切片的全程追踪,使得病理流程更加有序、高效;(2)系统无缝连接病理实验室包埋盒打号系统和玻片打号系统,实现按需打印,提高工作效率及准确性;(3)自动包埋盒打印和玻片打印功能可有效杜绝手写标签带来的字迹模糊难以辨别的问题,从而减少病理样本人为的出错率;(4)每个步骤的操作时间、操作人员、操作仪器及操作程序都可以追踪,责任到人,有利于病理实验室的质量管理及绩效评估,从而提高技术人员的工作积极性;(5)查询功能除了满足各课题组查询病理实验进度,还为各课题后续保存蜡块切片提供方便;(6)统计报表可以满足日常工作量统计(各操作步骤、染色项目、每位工作人员的月度工作量等)。
PathTraq系统亦存在不完善处,其在特殊染色、免疫组化、免疫荧光染色等非常规HE染色方面有待提高设备的兼容功能;在实验室仪器设备管理、试剂耗材出入库管理等方面也有待进一步完善,真正实现病理实验室开放平台无纸化管理,有效提高实验室的制片质量及工作效率。
目前PathTraq系统能适应国内科研院校病理实验室的实际工作需要,并能显示出优于传统科研病理实验室的一些优势,对提高科研病理技术人员工作积极性及规范病理技术操作有一定帮助。