宁乡猪肉质相关Myo6基因多态性研究
2020-05-08曾勇波马海明
曾勇波,马海明
(1 宁乡市动物疫病预防控制中心,湖南 宁乡 410600;2 湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
宁乡猪原产于湖南省宁乡县的流沙河及草冲一带,原名为流沙河猪或草冲猪。宁乡猪形成的历史悠久,其体型特征是“丝颈葫芦肚,耳薄嘴筒齐,稀毛现薄皮,鱼尾后脚直,奶头一斩齐,四脚要撒蹄”以及“乌云盖雪银颈圈”。宁乡猪体型中等,体质疏松细致,体躯呈圆筒状,毛色为黑白花,基本色调是四肢、肋腹及颈下的下部为白色,头和臀部呈黑色。肌球蛋白6(Myosin 6,Myo6) 属于肌球蛋白家族,Myo6 基因与肉质性状有密切的关系。本研究旨在筛选宁乡猪肉质性状遗传标记,以期为该标记应用于宁乡猪的保种选育提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 样品采集
从196头宁乡猪和167头大白猪(共计363头)耳部取小块组织样品,以供提取DNA,所采样品在-20℃下保存。
1.2 DNA提取及聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增
基因组DNA提取按常规酚-氯仿进行。Myo6基因SNP位点PCR-RFLP-XbaI的PCR扩增条件为:95℃2 min(预变性),95℃30 s(变性),59℃30 s(退火),72℃30 s(延伸),40个循环。
2 结果与分析
Myo6基因A/G位点的基因频率和基因型频率见图1。PCR-RFLP-XbaI多态性的分布情况如表1所示。
由表2可知,这两个猪种的遗传纯合度都在0.5以上,且比较接近。宁乡猪的有效等位基因数低于大白猪的。从多态信息含量上看,这两个猪种的多态信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)在0.25~0.5之间,属于中度多态。
3 讨论与结论
PCR-RFLP-XbaI多态性在宁乡猪和大白猪中G基因均为优势等位基因,其基因频率分别为0.576 5和0.691 6;经适合性卡方检验,可知不符合孟德尔遗传分离定律,其原因可能与样本数有关。大白猪和宁乡猪在该基因位点具有遗传多态性,并且具有较高的遗传变异。