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干旱胁迫状态下植物电信号特征分析与研究

2019-11-06周敏姑剧飞儿孙振豪许景辉

西安理工大学学报 2019年3期
关键词:吊兰电信号小波

周敏姑,剧飞儿,孙振豪,许景辉

(1.西北农林科技大学 旱区节水农业研究院,陕西 杨凌 712100;2.西北农林科技大学 生命科学学院,陕西 杨凌 712100;3.西北农林科技大学 水利与建筑工程学院 陕西 杨凌 712100)

植物电信号是植物生长变化过程中的主要生理信号[1]。它不但反映植物自身的生长状况,还反映植物生长的环境状况,因此,研究植物电信号能从植物与环境的耦合关系上揭示植物生境信息,为农业生态和植物生理研究服务。随着信号采集和处理技术的发展,很多学者对植物的电信号进行了研究。Volkov等[2]研究通过PCP、FCCP等多种刺激对植物电信号的影响,表明植物电信号是植物组织和器官中远距离信息传递的最快途径。李峤等[3]通过三种菊科(Asteraceae)植物电信号的分析,利用短时Fourier变换,认为其电信号均为微伏级低频信号。张晓辉等[4]利用小波去噪和STFT算法,分析芦荟电信号是一种毫伏级,频率分布在5 Hz左右的低频信号。这些研究揭示了植物电信号的一般规律,但对植物电信号变化与环境因素之间的相关性研究甚少。

本文在分析植物电信号特征的基础上,研究植物电信号所具有的特性及其与环境水因子间的相关关系,利用机器学习的方法建立植物电信号特征和环境水胁迫的分析模型,通过吊兰(Chlorophytum Comosum)、红景天(Sedum Rosea)等观赏植物的电信号变化,进行水胁迫程度的检测,研究环境因素对植物电信号影响的一般规律。

1 试验方法与材料

1.1 信号采集系统

本研究选用成都泰盟科技有限公司设计生产的BL-420F生物机能实验系统来采集植物电信号。由计算机、BL-420F系统硬件、TM-WAVE生物信号软件三部分组成。采用METER公司生产的ECH2O土壤含水量监测系统,由Em50系列数据采集器和5TE土壤水分传感器组成。BL-420F型生物机能实验系统工作原理图见图1。

图1 生物机能实验系统工作流程图

由于植物电信号微弱、低频的特点[5],空间中电磁场、电磁辐射以及周围设备电磁噪声均会对信号的采集造成极大干扰,有可能湮没植物电信号[6-8]。因此将待测植物放入130 cm×120 cm×120 cm屏蔽箱中,测量过程中屏蔽网接地,以消除外界影响[9]。

1.2 试验对象及方法

试验分别采集吊兰和红景天两种观赏性植物在缺水时(水胁迫)以及水分充分时的电信号,通过滤波算法,建立植物电信号采集系统,完成信号数据的处理和存储工作。采集的植物电信号用MATLAB软件进行降噪处理,通过人工神经网络,针对不同含水量下的吊兰和红景天的电信号进行学习和训练,实现两种植物水胁迫程度的识别和判断。从而实现基于植物电信号特征的植物生长实时监测[10-12]。

将待测植物体以及生物实验机能系统放于屏蔽箱内,测量过程中屏蔽箱可靠接地,以消除外界对植物电信号的影响[13]。实验外部环境温度25 ℃,空气湿度是45%^50%,光照强度5 000 lx。选择生长良好的叶片,将植物电信号采集传感器的金属铂丝插于同一叶片上,保证铂丝完全没入且未穿透叶片。为了消除电极极化现象,电极插入30 min后,再对植物电信号进行测量,以保证信号的稳定性。试验系统采样频率设置为100 Hz(0.01 s),高通滤波频率设置成0.053 Hz,低通滤波频率设置成500 Hz。利用BL-420F型生物机能实验系统采集土壤含水量为12.5%时的吊兰叶片电信号,信号取样7 681个数据点。为了提高电信号的准确性,试验运用小波去噪和滤波器滤波去噪两种方式,对采集的原始信号进行了处理[14]。

1)小波去噪。分别选择bior2.4、coif3、db4、haar、sym2五个小波函数对上述采集的信号进行3尺度小波分解,采用软阈值去噪。见图2。

2)滤波器滤波去噪。分别采用均值、中值滤波、无限冲激响应(IIR)滤波器、有限脉冲响应(FIR)滤波器对吊兰电信号进行去噪。去噪后的信号见图3。

从图3看出,滤波器滤波去噪后,造成植物电信号的信号失真,信号幅值范围由原来的2.3μV左右压缩到1μV左右范围,且信号包络线趋于平整,而植物电信号是有突变并且是无规则的[15]。对比图2和图3可知,小波去噪除了平滑原有电信号外,保留了信号的许多细节信息。因此本试验选用小波去噪进行电信号处理。通过不同小波基去噪处理还发现,使用 db4、haar等小波基分解奇异信号,去噪效果较好,如果用sym8,coif3等小波基来分析,则会使信号的奇异点部分变得平滑,使降噪后的信号畸变较大,出现一定程度的失真,去噪效果不佳[16]。

信噪比(SNR)是反应去噪效果的重要参数[17],SNR的表达式[18]为:

(1)

图2 小波去噪结果图

图3 滤波去噪

表1 db4和haar小波信噪比

Tab.1 Db4 and Haar wavelet signal to noise ratio

小波db4haarSNR/dB89.826389.6142

从表1看出,两种小波信噪比差距不大,db4去噪略高,其余性质来看,对称性相似,滤波长度db4更长,因此实验选择db4小波去噪。从降噪结果看,小波去噪更适用于植物电信号的降噪处理,而选择db4小波作为基函数,对采集的信号进行3尺度分解,为本实验的最优去噪方法。

2 植物电信号特征分析

在测量环境温度25℃,空气相对湿度50%,光照强度5 000 lx时,对吊兰在干旱(土壤含水量5.15%)、适宜(土壤含水量12.5%)和潮湿(土壤含水量23.6%)三种状况下的植物电信号进行测量和分析,寻找环境水胁迫程度与电信号特征值之间的相关关系。

分别对吊兰电信号进行小波去噪处理,时域波形见图4。

图4 三种状态下的原始信号

基于db4的小波去噪处理后,信号图形见图5。

从三种水胁迫状态下的时域波形可以看出,随着含水量变化,三种状态下的植物电信号变化具有一定随机性,其幅值变化也有一定不稳定性。因此对三种状态共计23 043个信号采用统计分析方法。三种状态下吊兰电信号的统计数据见表2。

图5 三种状态下的db4小波去噪

表2 三种水胁迫状态下,吊兰电信号的统计参数

Tab.2 Three water stress statistical parameters for spider plant electrical signals

环境水胁迫程度最大值/μV最小值/μV平均值/μV方差/μV2标准差/μV干旱6.35-13.69-3.2318.654.32适宜-2.01-5.87-3.270.140.37潮湿-2.08-5.87-3.510.160.39

表2表明,吊兰电信号最大在几微伏,属于微伏级。表中信号的方差都小于20μV2,说明正常情况下植物电信号的功率很低,证明植物电信号本身是一种微弱信号[19]。

对于吊兰类喜水植物,环境水胁迫程度的变化对其植物电信号时域波形影响较大[20],主要表现在:随土壤含水量变大,电信号均值在逐步下降;适宜土壤含水量下,电信号幅值在-2.0μV左右,干旱在6μV左右,潮湿在-2.1μV左右,可观察到土壤含水量偏离正常值都会使电信号幅值发生化,干旱时会有明显增大,潮湿时和适宜时变化不大。

对相关信号进行Fourier变换,其频域波形见图6。

图6 三种状态下的频域波形

图6表明,对于吊兰类喜水植物,土壤含水量的变化对其植物电信号频域波形影响较大,主要表现在:当其含水量较为充足时(适宜或者潮湿),其频率集中在0^10 Hz之间,以5 Hz最为突出;含水量不充足(干旱)时,其频率范围大大缩短,主要分布在0 Hz左右。

对7 681个采样点计算功率谱,其功率谱波形见图7。从图7看出,植物电信号的功率谱大部分集中在15 Hz以下,15 Hz附近的谱峰值已经非常低,基本在-50dB。信号的绝大部分功率谱集中在大概2~5 Hz频率附近,处于-30 dB级别,这说明植物电信号不仅低频而且信号能量极弱,是一种典型的生物电信号。在干旱状态下,同频率下,谱峰值会略高于正常状态下的峰值。

图7 三种状态下的功率谱波形

采用短时Fourier变换(STFT)对其植物电信号进行了相应的频谱分析,其中短时Fourier变换中窗函数采用Kaiser窗函数,时域宽度为360数据点,其结果见图8。

图8橙黄色表示能量较高的部分,蓝色表示能量低。由图8分析可得,吊兰电信号的短时Fourier变换频谱明显在15 Hz以下,大多不超过10 Hz,频谱能量大多集中于2~5 Hz以及以下。另外随着环境水胁迫程度的增高,频谱能量集中的频率会呈现向高频方向的发展趋势,即干旱程度越高,频谱能量集中区域的频率越高。

3 基于神经网络的植物电信号识别模型建立

使用MATLAB的神经网络工具箱,以BP神经网络进行信号的训练和识别[22]。BP神经网络隐含层节点为50个。以小波去燥后抽样的4 000个点,选择70%的数据作为训练集(Training),15%的数据作为测试集(Testing)和15%的数据作为验证集(Validation),其中训练集和验证集主要用于BP算法的最优化选择模型的建立,而测试集用来给出最终模型的性能指标。训练结束后,生成训练模型的MSE和R曲线,见图9。

图8 STFT变换频谱图

从图9(a)中可以看到,三条MSE曲线几乎完全重合,而且呈现下降趋势,说明随着训练的进行,输出的预测值与实际值误差越来越小,并且训练形成的算法在训练集、验证集和测试集的表现趋同,识别系统非常稳定。

从图9(b)中来看,R值曲线在三个数据集中的正确率均超过99%,并且三个数据集的正确率差异不大,可以作为吊兰这种植物的电信号对于环境水胁迫程度的识别和预测模型,可以应用于实际农业种植中植物的检测工作。因此,以BP神经网络为基础的监督式机器学习在植物电信号的识别和预测模型建立方面,有一定的应用价值。

图9 MSE和R值曲线图

4 结 论

1)在采集植物电信号的基础上,对于不同降噪作了明确的分析和对比,选取了最适合植物电信号的“db4”3层小波去噪,同时对去噪后的信号进行了时域、频域和时频域的相关分析,验证了植物电信号微弱、低频、非线性和随机性,探寻了特征值与土壤含水量的相关关系。

2)探索了BP神经网络在植物电信号与土壤含水量直接相关关系的最优算法,建立了植物电信号与土壤含水量的识别和预测模型,实现对植物环境水胁迫程度的预测和识别。

3)植物电信号是一种复杂的信号,探寻信号的特征参数与外界环境变化的相关关系将在智能农业领域起到重要作用。

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