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人工智能“解密”免疫疗法

2019-06-24韦恩·考夫(WayneKoff)

南风窗 2019年13期
关键词:免疫系统解密癌症

韦恩·考夫(Wayne Koff)

在我最近参加的纽约科学院颁奖晚宴上,詹姆斯·P. 艾利森(2018年诺贝尔医学奖得主之一)对一群着迷的观众说,他在癌症免疫治疗方面的突破性發现,并非源于对癌症的关注,而是源于他对免疫系统运作方式的数十年基础研究。

多年来,艾利森和他的同事们研究了一种可以抑制免疫系统的蛋白质。他们认识到,“阻击”这种抑制因子,可以解除对免疫系统的束缚,使其攻击和摧毁肿瘤。

对一些癌症患者来说,免疫疗法革命使曾经濒临死亡的人能够过上健康的生活。然而,免疫疗法革命仍处于起步阶段。由于一些尚不明朗的原因,许多癌症和病人(对这一疗法)根本没有反应。

科学家们越来越认同其原因部分在于,我们目前对人类免疫系统如何对抗疾病缺乏了解。在过去数十年艾滋病毒/艾滋病疫苗的研发工作里,我亲眼见证该目标迄今仍遥不可及。

这就是我相信基础研究的下一个突破,将是解码人类免疫系统如何预防和控制疾病的理由。人工智能和机器学习,将是实现这一成就的关键,正如它们正在改变我们生活的其他方面一样,它们将改变人类健康的未来。

免疫系统—由细胞、组织和器官组成的复杂网络,是人体保持健康的主要机制。无论是针对癌症、糖尿病和阿尔茨海默症等非传染性疾病,还是肺结核、疟疾和埃博拉等传染性疾病,破译免疫系统的信息,都是我们理解和抗击这些疾病的核心。

过去一个世纪,我们学会了通过疫苗来设计我们自身免疫的某些方面,但我们已经陷入了关键的僵局。我们现在面临的威胁更加阴险和复杂,每年有数百万人,特别是儿童、老年人以及生活在低收入和中等收入国家的人,死于本应被克服的疾病。

而通过充分利用免疫系统的力量,我们可以找到新的方法来对抗疾病。我们需要新的、创造性的方法,来应对跨多个学科的挑战。好消息是,这样的行动在现下是可能实现的。生物医学、工程学以及最重要的人工智能和机器学习领域的最新技术进步,为我们提供了开展这一雄心勃勃计划所需的工具。

人类免疫系统比人类基因组大数十亿倍,处理如此庞大的信息,需要强大的数据科学能力和前沿的超级计算。它还要求我们在如何进行临床研究方面,做出重大转变。

传统上,临床研究的重点是在尽可能多的个体上进行测试,收集每个受试者的有限数据。随着新的基因组学和分子生物学工具的出现,研究人员可以在单个个体上收集数百万个数据点。这将带领我们走向新模式:更少的人,更多的数据。

通过结合人工智能和机器学习来分析这些个体数据集,我们可以更好地理解人类免疫系统的分子水平动力学,并开始绘制其调控规则。在“人类疫苗项目”的早期工作中,科学家们正在使用这种方法,这可以为加速开发新的疫苗和免疫介导性疾病的疗法,铺平道路。

诸如此类的研究,开始产生前所未有的大量数据,最终将使人类免疫系统首册图集的创建成为可能。前沿超级计算的进步,可以应用到该数据库中,创建第一个基于人工智能的免疫系统模型。这些模型,将填补我们现有知识的空白,从而创造出更有效的癌症免疫疗法,以及针对许多其他疾病的诊断、疫苗和治疗方法。

我设想着这样的一个世界:科学家们可以迅速开发出对抗疾病的新方法,疫苗可以通过一次免疫为每个人提供终生保护,免疫疗法对所有癌症都有效,阿尔茨海默症也可以预防。为了使这一未来成为现实,我们必须将创造力与人工智能的不断进步结合起来,以破解人类免疫系统的密码。

本文由Project Syndicate授权《南风窗》独家刊发中文版。韦恩·考夫是非营利“人类疫苗项目”的总裁兼首席执行官。

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