肺泡灌洗液二代测序对肺部感染性疾病的诊断价值
2019-02-25李德经
李德经
无锡市人民医院呼吸与危重症医学科,江苏 无锡 214023
肺部感染性疾病的诊断和治疗是呼吸内科最常见的疾病之一,当肺部感染性疾病的病原体诊断不够明确时,往往不能够针对性的采取药物进行治疗,将会耽误到患者的病情的治疗,治疗不够及时会引起患者的死亡[1]。肺部感染性疾病主要包括支气管、肺间质、终末气道等多个结构的感染,临床表先多样,感染的病原体的种类也多样,影像学表现也多,往往不能通过一些辅助检查和临床表现来确定患者所感染的病原体。尤其,对于一些本就有基础疾病和免疫功能存在问题的患者来说,往往同时合并有多种病原体的感染,更加大了临床诊断和治疗的难度。随着临床检验水平的提高,肺泡灌洗液二代测序成为肺部感染性疾病的诊断的重要的手段,能够较准确的诊断出病原体,为临床提供了很大的帮助[2]。特此,笔者回顾性分析43例肺部感染性疾病患者的临床资料。详见下报道。
1 资料与方法
1.1 一般资料 回顾性分析2018年4月-2019年6月期间我院收治的肺部感染性疾病的患者的临床资料总计43例,43例患者中,男性患者33例,女性患者10例。年龄为25-68岁,平均年龄(52.7±4.9)岁。43例患者中,白细胞增高23例,C反应蛋白增高35例。所有患者经过影像学(胸部螺旋CT)和血液生化的检查均确诊为肺部感染,根据社区获得性肺炎治疗的方案进行治疗,症状为得到明显的控制,治疗效果不佳,仍有进一步发展的趋势。所有患者的抗结核杆菌均为阴性,排除合并有基础的肺部基础疾病,如支气管扩张、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘等等,未进行呼吸机支持治疗,无其他系统的严重疾病,无艾滋病[3]。患者及家属本人均知情同意本次研究。
1.2 方法 43例患者入院后先维持生命体征,进行对症治疗。之后进行检查,常规进行血常规、尿常规、抗体以及病毒咽拭子的检查。采集患者的肺泡灌洗液,分为两份,一份进行二代测序,另一份进行涂片以及培养[4]。记录病原体的检出情况。
1.3 统计学方法 数据统计应用SPSS 18.0,计数计量资料应用χ2(%),均数比较采用t检验;计数资料数据以例数(构成比)表示,比较采用卡方检验。P<0.05为有统计学意义。
2 结果
2.1 肺泡灌洗液二代测序(mNGS)的结果 在本次送检的43例标本中,检测出病原体38例(88.4%),单一病原体感染:其中检出病毒5例(11.6%),支原体5例(11.6%),流感嗜血杆菌3例(7.0%),铜绿假单胞菌3例(7.0%),副流感嗜血杆菌:2例(4.7%),肺炎链球菌2例(4.7%),屎肠球菌2例(4.7%),大肠杆菌2例(4.7%),曲霉菌2例(4.7%),结核分枝杆菌2例(4.7%),鲍曼不动杆菌2例(4.7%),其他6例(13.9%),未检出5例(11.6%)。混合感染:副流感嗜血杆菌+卡氏肺虫孢子1例(2.3%),副流感嗜血杆菌+病毒1例(2.3%)。
2.2 血清支原体抗体检测与mNGS的灵敏度和特异度比较见表1。
表1 两种检测方法敏感度和特异度比较(%)
3 讨论
肺部感染是呼吸科最常见的疾病,可发生在无基础疾病的健康人中,也可发生在许多合并有基础疾病的患者中。尤其,当一些危重病人,免疫力极度低下,合并出现肺部感染时,往往治疗很困难,患者可同时合并有多种病原体的感染,使得治疗难度大大加大[5]。肺部感染性疾病的病原体不能明确的诊断时,往往抗生素的选择不具有针对性,治疗效果不理想,容易产生耐药性,易发展成重症肺炎,耽误治疗,可引起严重的并发症,甚至造成死亡。mNGS还可判断有无合并其他病原体的感染,减少误诊率和漏诊率。肺泡灌洗液二代测序(mNGS)作为一类质量较高的检测方法,其检测原理是通过获取病原体的大量序列信息,来进行判断,为临床提供准确的信息。对比常规的血液、痰培养有敏感度和特异性高的优点,为临床医生提供治疗的思路,为临床的救治赢得了宝贵的机会,但是二代测序仍存在一定的局限性,容易受到污染菌和正常定植菌的影响,使得结果收到一定的干扰。因此提高序列分析的准确度,序列的覆盖度是提高二代测序的关键。另一方面,一些病原体由于其结构,核酸序列不易被提取,成本也非常高,对于很多病原体的序列判断仍存在很大的空缺。但是,相信随着测序的技术水平不断地提高,其诊断水平一定会有很大地提高,为临床带来更多的价值。
综上所述,肺泡灌洗液二代测序是是肺部感染性疾病的病原体检测的重要的检测方法,能够较为准确地检测出病原体,有助于个性化地使用抗生素,减少耐药性的发生,缩短病程。但是,对于一些病原体检出率仍不高,需要与临床上其他的检测方法共同进行运用,取长补短,提高诊出率。