玉米有了高分辨率三维基因组图谱

近日，华中农业大学教授李兴旺、严建兵和李国亮团队合作，首次利用Long-read ChIA-PET 技术，绘制了玉米活跃表达基因参与的高分辨率三维基因组图谱， 鉴定了基因组顺式调控元件三维互作模式，揭示了玉米三维基因组结构调控基因表达的潜在机理。 该研究成果在线发表于《自然-通讯》。

该研究利用创新的实验方法，产生了RNA 聚合酶II（RNAPII）和H3K4me3 抗体的Long-read ChIAPET 数据，成功构建了玉米精确到基因水平的三维基因组结构图谱。基于高分辨率的图谱，进一步详细展示了启动子和启动子交互基因的基本特征。 同时，研究人员将已发表的eQTL 与染色质远程交互的数据相结合， 提出三维空间的邻近为基因的表达调控提供了基础。 研究人员还发现参与染色质远程互作的DNA 顺式调控元件在农艺性状和代谢产物相关的QTL 中显著富集。 已经被验证的vgt1 和ZmCCT9 调控位点，也被检测到与目标基因存在空间邻近。

系列成果表明，玉米高分辨率三维基因组的研究对于玉米功能基因组研究、玉米复杂农艺性状研究都有重要意义。