羊口疮病毒B2L基因密码子优化及截短表达
2018-10-16范峻豪刘春羽温永俊张七斤
张 静,范峻豪,刘春羽,赵 一,温永俊,张七斤
(内蒙古农业大学兽医学院,内蒙古呼和浩特 010018)
羊口疮(ORF)是由羊口疮病毒(ORFV)感染山羊和绵羊引起的一种急性、接触性传染病,人偶有感染。本病以羊口唇、乳房等处的皮肤和粘膜形成红斑、丘疹、脓疮、溃疡和结痂等为主要特征[1-2]。ORFV全基因组大小为135~139 kb,为双链线性DNA病毒,基因组包含131个基因,其中B2L基因位于基因组的左末端。病毒在宿主细胞内增值时,B2L基因在病毒DNA尚未开始复制时便大量转录翻译42 ku大小的蛋白。该蛋白是ORFV外囊膜的主要成分,可强烈刺激宿主免疫系统产生免疫应答[3-4]。
本研究截短表达了ORFV B2L基因,并依照大肠杆菌密码子偏好进行密码子优化,使其在原核表达系统中进行融合表达,纯化出高浓度重组蛋白,为后续建立ORFV血清学检测方法提供了重要的抗原物质,尤其是为建立ORFV间接ELISA方法奠定了物质基础。
1 材料与方法
1.1 主要试剂
Ni-NTA Agarose亲和纯化柱、Binding Buffer和Elution Buffer:购自生工生物工程(上海)有限公司;180 ku蛋白预染 Marker:购自Thermo公 司;Anti-His Mouse mAb、100 ku蛋 白 预 染Marker:购自全式金生物技术有限公司;Anti-Mouse IgG:购自SIGMA;PVDF膜:购自Bio-Rad;蛋白上样缓冲液、SDS-PAGE凝胶配制试剂盒、BeyoECL Plus:购自上海碧云天生物技术有限公司;BL21(DE3)感受态细胞:购自天根生化科技(北京)有限公司。其他试剂均为标准化学分析纯试剂。
1.2 主要仪器
Trans-Blot SD半干转印槽:美国Bio-Rad公司;Alph Imager HPr凝胶成像系统:美国Protein Simple公司;双垂直蛋白电泳仪:中国百晶生物公司;脱色摇床:中国五相仪器仪表公司。
1.3 B2L蛋白截短及密码子优化
运用DNA Star中的Protean软件,分析B2L蛋白的亲水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指数;根据分析结果截取抗原指数高、亲水性好、可塑性好的片段进行截短表达和密码子优化;将优化好的片段送吉林库美生物有限公司进行合成,然后连接到pET32a(+)表达载体上,再转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中。
1.4 重组蛋白表达
将重组菌划线接种于含Amp+的LB固体培养基37 ℃过夜培养,将过夜菌挑单菌落接种于3 mL含氨苄抗性的新鲜 LB液体培养基,摇菌培养12 h;按1%的比例将纯化培养的菌液接种于200 mL含Amp+的新鲜LB液体培养基,37 ℃ 200 r/min震荡培养;用分光光度计测A到0.6时,加入IPTG诱导;将菌液12 000 r/min离心10 min,弃上清,用Binding buffer洗涤2次,然后重悬,于冰浴中进行超声破碎(具体以超声菌液清亮为止);将超声裂解菌液4 ℃ 12 000 r/min离心10 min,分离上清和沉淀;将沉淀用尿素溶解,经过SDS-PAGE电泳测定,并且以未诱导菌为阴性对照。
1.5 重组蛋白纯化
将Ni-NTA Agarose亲和纯化柱加入5 mL Binding Buffer平衡10次,将蛋白加入平衡好的Ni-NTA镍柱填料中,在冰上结合30 min;收集流穿液,加5 mL Binding Buffer洗涤1次,收集洗涤液,加Elution Buffer 5 mL洗1次,收集洗脱液。
1.6 重组蛋白Western-blot鉴定
将经SDS-PAGE电泳的蛋白条带转印到PVDF膜上,电压14 V 1 h;用5%脱脂乳室温封闭2 h,然后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在膜上加入Anti-His Mouse mAb为一抗(1∶4 000稀释),4 ℃过夜孵育,第2天用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;再将膜放入1∶5 000稀释的Anti-Mouse IgG中孵育1 h,取出膜后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在PVDF膜上加ECL显影液,放于荧光显色仪中显色。
2 结果与分析
2.1 B2L蛋白截短及密码子优化
2.1.1 B2L蛋白截短 利用DNA Star中的Protean软件,分析B2L蛋白的亲水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指数等,选取抗原指数高、亲水性好、可塑性好的片段进行截短表达。分析结果见图1-A,截取的目的蛋白氨基酸序列见图1-B。
图1 B2L蛋白的生物信息学分析
2.1.2 B2L蛋白截短基因的密码子优化 根据大肠杆菌的密码子偏好进行密码子优化,用E.coli Codon Usage Analyzer 2.1在线软件分析优化结果。结果显示(图2),优化后的密码子适应指数(CAI)为1,且无稀有密码子。CAI是反映编码区同义密码子与密码子最佳使用相符合的程度,取值范围在0~1之间,越高表明该基因的密码子使用偏好性越强[7-8]。
图2 密码子优化分析结果(CAI为1)
2.3 重组蛋白SDS-PAGE分析
将重组表达载体转入大肠杆菌BL21(DE3)感受态中,经条件优化,最终确定37 ℃ IPTG终浓度为1 mmol/L诱导培养3 h后表达的效果最佳。SDS-PAGE检测结果见图3。从结果中可以看出,诱导的pET32a(+)-B2L重组菌超声后上清及沉淀中的30 ku附近出现清晰条带,而未诱导的PET-32a-B2L重组菌在这一位置没有这一条带,因此认为B2L重组蛋白得到了成功表达。
图3 SDS-PAGE检测结果
2.4 重组蛋白纯化
将诱导表达得到的B2L蛋白经镍柱亲和层析后收集到的流穿液、洗涤液和洗脱液,分别取20 µL进行SDS-PAGE电泳,可以看出流穿液和洗涤液中也有 重组蛋白存在,但洗脱液中的重组蛋白单一,因而认为重组蛋白得到较好的纯化(图4)。
图4 SDS-PAGE电泳结果
2.5 重组蛋白Western-blot检测
Western blot结果见图5。纯化的蛋白在30 ku附近出现1条清晰条带,而未诱导的重组菌和诱导的空表达载体菌没有出现目的条带,表明重组蛋白在大肠杆菌中成功表达。
图5 Western-blot结果
3 讨论
目前,羊口疫广泛流行于全球各羊养殖国家或地区,且发生频率逐年上升,流行范围逐渐扩大,特别是我国黑龙江、新疆、内蒙古、西藏、青海、吉林等养殖地区,近年频频暴发羊口疫疫情[5],给养羊业造成了一定的经济损失,同时鉴于国内缺乏相关检测试剂盒,故应给予羊口疫更高的关注。本试验通过PET-32a(+)表达载体构建截短B2L重组表达质粒,获得了可溶性ORFV B2L蛋白,为将来建立间接ELISA检测ORFV抗体提供了物质基础,更为准确诊断ORF和流行病学调查提供了简便快捷的方法[6-7]。
为了提高B2L重组蛋白的产量,在试验中通过对B2L基因优化及截短,可以使蛋白得到更好的表达,且不失B2L蛋白的免疫原性。又通过表达条件的摸索和优化,使用最佳条件,37 ℃ IPTG终浓度1 mmol/L,诱导表达3 h,最终蛋白得到了大量表达。