口蹄疫病毒荧光RT—PCR检测试剂盒的筛选
2018-09-10凌洪权黎朝燕杨泽林谢建华董春霞黄恒钟小艳吴昌义
凌洪权 黎朝燕 杨泽林 谢建华 董春霞 黄恒 钟小艳 吴昌义
摘要:为了及时、准确地诊断口蹄疫疫情,避免误诊而造成重大的经济损失,我们对5个不同生物技术有限公司(分别以A、B、C、D、E代替)生产的口蹄疫病毒通用型、O型、A型、Asia1型荧光RT-PCR检测试剂盒进行了试验对比,最终从通用型和3个分型试剂盒的灵敏性、交叉反应、反应体系、反应条件、反应速度、操作简便性等方面筛选出了B公司的试剂盒相对优于其他4个公司的试剂盒。
关键词:口蹄疫;试剂盒;筛选
中图分类号:S852.65 文献标识码:B doi:10.3969/j.issn.2096-3637.2018.04.004
口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)属于微RNA病毒科(Picornaviridae)、口蹄疫病毒属(Aphthovirus)的单股正链RNA病毒,含有7个型(O、A、C、Asia1、SAT1、SAT2、SAT3)和多种亚型[1]。能够感染多种偶蹄动物,造成严重的经济、政治和社会问题[2-3]。在我国以及非洲和亚洲的许多国家流行,其传播速度快、感染率高,严重影响当地畜牧业的发展以及动物产品的国际贸易[4-5]。该病被世界动物卫生组织(OIE)列为必须通报的动物疫病,也是我国一旦发生必须上报的一类动物传染病之首[6]。本试验通过对5个生物技术有限公司提供的口蹄疫病毒试剂盒进行比较,旨在为及时、准确地处理口蹄疫疫情提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 抗原
口蹄疫病毒A型抗原、O型抗原、Asia1型抗原购自国家口蹄疫参考实验室中国农业科学院兰州兽医研究所。
1.2 试剂
口蹄疫病毒通用型荧光RT-PCR检测试剂盒、口蹄疫病毒O型荧光RT-PCR检测试剂盒、口蹄疫病毒A型荧光RT-PCR检测试剂盒、口蹄疫病毒Asia1型荧光RT-PCR检测试剂盒购自 A、B、C、D、E 5个公司。
1.3 核酸提取试剂盒
核酸提取试剂盒(磁珠法)购自天隆科技生物技术有限公司。
1.4 方法
依据《口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测方法》GB/T 22915-2008。
2 结果
2.1 口蹄疫病毒通用型荧光RT-PCR试剂盒检测结果表(见表1)
2.2 口蹄疫病毒O型荧光RT-PCR试剂盒检测结果表(见表2)
2.3 口蹄疫病毒A型荧光RT-PCR试剂盒检测结果表(见表3)
2.4 口蹄疫病毒Asia1型熒光RT-PCR试剂盒检测结果表(见表4)
2.5 口蹄疫病毒通用型、O型、A型、Asia1型荧光RT-PCR试剂盒结果评比表(见表5)
评分和灵敏性指标:
操作简便性:配制反应体系时,几种同类试剂盒比较,最便捷得3分,中等得2分,最差得1分。
反应体系一致性:每个公司4种试剂盒配制体系时各个成分的量完全一致得3分,3种一致或2、2一致得2分,只有2种一致得1分,全都不一致得0分。
反应条件一致性:通用型与3种分型试剂盒的反应条件完全一致得3分,3种一致或2、2一致得2分,只有2种一致得1分,全都不一致得0分。
交叉反应:无交叉反应且增长趋势好者得3分、增长趋势一般者得2分、增长趋势平缓者得1分;有交叉反应者得0分。
灵敏性:首先淘汰有交叉反应者,再根据CT值与平均值比较,CT值越小或越接近平均值且增长趋势越好者灵敏性越高。
经过对5个公司口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测试剂盒的比较,筛选出B公司的试剂盒相对于其他4个公司的试剂盒操作简便、通用型与3个分型能在同一台荧光PCR仪上同时完成(即反应条件一样)、各个分型试剂盒无交叉反应、灵敏性较高等优势,因此B公司的试剂盒是首选。
3 讨论
口蹄疫诊断技术包括口蹄疫病毒的微量补体结合试验、食道探杯查毒试验、反转录一聚合酶链反应(RT-PCR),病毒中和试验、液相阻断一酶联免疫吸附试验、病毒感染相关抗原(VIA)琼脂凝胶免疫扩散(AGID)试验(适用于检测各种不同样品中的口蹄疫病毒抗原或抗体)[7]以及口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测方法(适用于动物及其动物产品中口蹄疫病毒的检测)[8]。确诊口蹄疫疫情时,一般都是检测样品中是否含有口蹄疫病毒,因此RT-PCR或荧光RT-PCR方法较为常用。RT-PCR方法相对比荧光RT-PCR方法较为复杂、耗时也长,所以荧光RT-PCR方法是确诊疫情的首先方法。
由于口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测试剂盒有诸多的优特点,因此市场上荧光检测试剂盒犹如春笋般的涌现出来,生产厂家较多,但是检测效果各异。为了准确地诊断疫病,在选用不同公司的试剂盒之前一定要做试验比较,不能盲目地根据价格的高低而轻易选购,否则误诊会造成更大的经济损失。
参考文献
[1] 刘庆军,张永光.口蹄疫病毒基因组结构及其功能[J].动物医学进展,2005, 26(5):1-5.
[2] Thomson G R, Vosloo W, Bastos A D S.Foot and mouth disease in wildlife [J].Virus Research,2003,91(1):145-161.
[3] Grubman M J, Baxt B.Foot-and-mouth disease.[J].British Journal of General Practice the Journal of the Royal College of General Practitioners, 2001, 51(466):417.
[4] Sobrino F, Domingo E.Foot-and-mouth disease in Europe.FMD is economically the most important disease of farm animals.Its re-emergence in Europe is likely to have consequences that go beyond severe alterations of livestock production and trade.[J].Embo Reports, 2001,2(6):459-61.
[5] Domingo E,Baranowski E,Escarmís C,et al.Foot-and-mouth disease virus[J].Comparative Immunology Microbiology & Infectious Diseases,2002,25(5-6):297.
[6] Baxi M K, Baxi S,Clavijo A, et al.Microarray-based detection and typing of foot-and-mouth disease virus.[J].Veterinary Journal,2006,172(3):473-481.
[7] 王莉娟,徐天刚,赵云玲,等.口蹄疫诊断技术研究进展[J].中国畜牧兽医, 2005,32(3):41-44.
[8] 罗长保,鱼海琼,林志雄.应用荧光RT—PCR技术检测口蹄疫病毒[J].中国兽医杂志, 2003,39(12):31.