蚕种质资源共享平台信息系统设计
2018-05-14张月华钱荷英孙平江
张月华 钱荷英 孙平江
摘要应用 ASP(active server page) 技术,通过 Access 数据库设计和构建了蚕种质资源共享平台信息系统,网址为http://www.cnsilkworm.com/。介绍了蚕种质资源信息共享系统是集成数据库技术和网络技术构建的基于 B/S 结构的动物种质资源数据标准化管理和共享发布的平台,系统中建立了家蚕、柞蚕和蓖麻蚕等动物的数据库,数字化了800多份种质的信息。并指出信息系统主要包括蚕种质资源数据管理、数据检索、共享信息发布等功能模块,实现了蚕种质资源数据库共建、信息共享。
关键词家蚕;柞蚕;蓖麻蚕;种质资源;数据库;数据标准
中图分类号S-058文献标识码
A文章编号0517-6611(2018)08-0193-03
Information System Design of Silkworm Germplasm Resources Sharing Platform
ZHANG Yuehua1,2,QIAN Heying1,2,SUN Pingjiang1,2 et al(1.Jiangsu University of Science and Technology, Zhenjiang,Jiangsu 212003;2.Sericultural Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhenjiang,Jiangsu 212018)
AbstractApplying ASP(active server page) technology,the Information System of Bombyx mori Germplasm Resources Sharing Platform through Access database was designed and constructed, and the meshwork which URL is http://www.cnsilkworm.com/ was issued through internet.The paper introduced that the silkworm germplasm resources information sharing system was a platform based on B/S structure of animal germplasm resources data standardization management and sharing release,which integrated database technology and network technology construction,established the data of Bombyx mori,Antherea pernyi and Attacus ricini,digitized the information of 800 germplasms.The system function modules mainly included data management,data retrieval and sharing information release of silkworm germplasm resources.The building of data bank and information sharing of silkworm germplasm resources can be realized by the unified and standardized management of silkworm germplasm resources data.
Key wordsBombyx mori;Antherea pernyi;Attacus ricini;Germplasm resources;Database;Data standard
基金項目现代农业(蚕桑)产业技术体系建设专项(CARS-18-01A)。
作者简介张月华(1961—), 男,山西忻州人,副研究员,硕士生导师,从事家蚕遗传育种和家蚕分子生物学研究。*通讯作者,研究员,硕士生导师,从事家蚕遗传育种和家蚕分子生物学研究。
收稿日期2017-12-08
随着科学技术的不断发展,信息技术已经成为社会经济发展的主导技术,信息已成为较物质和能量更高级的资源。许多动植物数据库的开发[1-5]以及资源信息平台的建设[6-9],不仅提供了信息资源的分布情况,而且为采取各种有效的措施对资源进行合理有效的配置提供了坚实的基础。蚕种质资源是我国优势和特色的遗传资源,但长期以来我国蚕种质资源数字化、信息化程度低。为实现蚕种质资源收集、保存和利用的信息化、现代化以及蚕种质资源信息共享,通过对中国农业科学院国家蚕种质资源保存中心以及全国蚕业科研机构现在所保存的蚕种质资源资料的收集、整理和更新,在已经构建的家蚕品种资源数据库的基础上[10-11],建立了蚕种质资源数据库信息共享网络,网址为http://www.cnsilkworm.com/。网站以蚕种质资源数据库为核心,应用ASP(active server page)技术,通过Web数据库实现蚕种质资源信息的浏览、查询,以及动态地对种质资源的管理,实现了蚕种质资源的信息共享。数据库主要包括家蚕、柞蚕和蓖麻蚕种质资源数据库,可提供蚕种质资源的护照信息、形态特征、生物学特性及经济性状和蚕不同时期的形态图片等。
1信息网络设计
1.1网站设计
蚕种质资源网络信息系统通过 Internet 以 http://www.cnsilkworm.com/ 网址发布。首先使用Dreamwaver 进行前端 UI 设计,“数据服务”栏目中的各蚕种数据是通过 ASP(全称active server pages)技术动态提取 Access 数据库中的数据表信息。高级查询功能是按照所输入的查询条件,以 ASP 标记语言的形式嵌入到 HTML 文件中并发送到服务器端,在服务器端处理所需请求并发回整合后的数据,显示在客户端浏览器的只是 ASP 执行结果所生成的页面,具有交互性强、安全快捷、查询灵活的特点。ASP技术简化了 Web 程序开发,支持动态 Web 设计。
安全性是網络信息系统建设的一个重要方面。为确保系统安全,普通用户只能浏览种质信息,而不能修改。只有管理员在输入用户名、密码的情况下,才可以对种质数据进行管理。例如,对于只有管理员才能进入的页面,如果普通用户没有通过用户名和密码的合法验证而直接调用,系统便会重定向到口令验证页面,从而消除直接调用密码验证后文件的可能性。
3.3数据浏览和检索
种质资源浏览采用加大数据显示量,每个页面上显示5个字段,分别是资源平台号、种质资源编号、种质资源名称、种质资源外文名和品种性状。每个页面上显示20条种质,通过点击品种性状可以进入具体的种质信息(如茧层率、解舒率和化性等)显示页面。在显示具体信息的页面,信息分为7个部分:基本信息、形态特征、生物学特性、品质特性、抗逆性、多媒体信息和其他特征特性。
蚕种质资源网络信息系统提供了7个蚕种质资源数据库,对这7个数据库都可以进行多条件的查询,条件间以and或or进行组合。查询的方式主要有>、<、=和模糊查询4种。如输入“茧丝长>800 m,解舒率>75%”进行查询。
3.4系统管理
系统管理包括用户管理、数据管理、信息管理和系统维护等。用户管理指添加用户信息、分配用户权限和删除用户信息;数据管理指被授权的高级用户及系统管理员对资源数据进行的添加、修改和删除等操作。
4结语
Web数据库在当今世界信息管理和信息共享中起着重要的作用,越来越多的资源通过网络进行共享访问。Web数据库与普通数据库一样,也是个数据存储库或信息库,可以通过查询语言或API接口编程来访问它[12]。流行的Web数据库访问的技术有CGI,ASP,PHP和JSP。ASP以其交互、动态、简单、高效等特点成为以NT为服务器的Web应用的首选开发环境,正越来越多地被全世界的Web应用开发者所接受和使用[13-14]。这样,通过Web数据库,尽可能地整合现有的种质资源,便可以实现种质资源的共享,为广大育种工作者提供方便。
动植物种质资源是作物育种和生物学研究的重要物质基础,提高资源信息服务的质量可以更有效地为科技活动提供优质的研究材料和数据信息,提高种质资源利用效率,实现资源共享,为科技创新与结构调整提供强有力的科技支撑[15-17]。但必须看到,由于缺乏一个有效的信息渠道,育种工作者不能了解、获得需要的种质,因而一些育种目标不能实现。因此,如何有效地利用育种专家手中的种质资源,实现种质资源的共享,便成为一个亟需解决的问题。Web数据库的出现为这个问题提供了一个解决方案。
蚕种质资源共享平台信息系统的设计,不仅可实现蚕种质资源的共享,引导和改变蚕农行为,同时有助于蚕业生产部门与蚕业信息系统数据库有机联结起来,为蚕业各生产和管理部门传输信息,使得各部门加强联系,达到信息共享,提高工作效率。有效利用现有的家蚕种质资源,实现种质资源共享,提供准确、可靠、可获得的种质资源信息,能够帮助育种家更快选育优良的家蚕实用性品种。
参考文献
[1]
王新超,刘振,姚明哲,等.中国茶树初级核心种质取样策略研究[J]. 茶叶科学,2009,29(2):159-167.
[2] 陈旭,廖康,张太红,等.新疆野生果树资源数据库系统的设计与实现[J].中国农学通报,2008,24(11):328-331.
[3] 徐坤.宁夏野生食用植物资源的调查与信息数据库的建立[J].中国野生植物资源,2009,28(4):35-38.
[4] 赵新新,吕德国,乔燕春.基于web的山楂种质资源信息系统建设[J].现代农业科学,2009,16(4):159-160,187.
[5] 邱宝利,任顺祥,吴建辉,等.我国昆虫种质资源的现状及其资源数据库的建立[J].广东农业科学,2005(3):5-7.
[6] 吴南,章莉,王丹萍,等.家养动物品种资源数据库信息共享网络的建立[J].畜牧兽医杂志,2004,23(5): 53-54.
[7] 陈伟,兰国玉,杨清华,等.基于Web的热带作物种质资源共享平台的开发研究[J].高等农业教育,2007(2):39-41.
[8] 陈众,周立志,窦月芹.安徽省生物物种资源信息平台的构建[J].现代农业科技,2007(24):210-211.
[9] 郭常莲,强彦,孙然.山西省自然科技资源共享平台信息系统分析与设计[J].山西农业科学,2009,37(11):77-79,82.
[10] 张月华,徐安英,李木旺,等.家蚕品种资源数据库的构建[J].蚕业科学,2004,30(3):296-299.
[11] 徐安英,李木旺,张月华,等.家蚕种质资源研究进展[J].中国蚕业,2003,24(4):83-86.
[12] 刘健宏.基于Internet的种质资源数据库平台建设研究[J].农业网络信息,2006(12):81-82,99.
[13] 栾生,李斯深.基于ASP技术的小麦种质资源信息系统的设计和实现[J].计算机与农业,2003(6):9-12.
[14] 雷波,曹艳,李晓.基于JSP技术的四川小麦种质资源信息系统的设计和实现[J].贵州农业科学,2009,37(10):242-245.
[15] 杨欣,蔡士宾,张勇,等.江苏农业种质资源中期库信息管理系统的初步设计[J].江苏农业科学,2009(5):291-293,294.
[16] 杨欣,张勇,林静,等.江苏农业种质资源信息服务系统的设计与构建[J].农业网络信息,2008(6):27-30.
[17] 陈立波,刘磊,李志勇,等.苜蓿种质资源标准化数据库建立的探讨[J].牧草与饲料,2008,2(3):3-6.