地球生物基因组计划展望

2015年11月，23位生物学顶级科学家策划了一个生物学领域的登月计划，地球生物基因组计划（Earth BioGenome Project，EBP），旨在用10年时间对地球上所有真核生物（约150万种物种）进行测序、分类和表征，估计耗资高达47亿美元。2018年4月24日，24位跨学科科学家组成的工作小组在PNAS期刊发文概述对EBP的科研展望。

十年路线图

EBP计划分三个阶段完成。第一阶段（3年），在每个科（总计约9300个）中至少详细解读一个代表性成员的基因组序列；第二阶段（3年），在每个属（总计约15万个）中选一个物种进行较为粗略的测序；第三阶段（4年），完成对剩下物种的粗略测序。

机遇与挑战

样品采集：制定凭证标本收集的全球战略、完整保存标本以进行高质量的基因组组装是目前面临的主要挑战。这需要博物馆、植物园、动物园和水族馆等以实现和保护生物多样性为使命的机构积极参与。

运算和数据科学：存储序列数据、组装基因组序列、将相关物种的基因组与注释对应起来等相关的运算挑战已解决；目前学术超算机中心已接近后期所需运行规模，但在效率、准确性和应用于复杂基因组方面有待进一步改良；新的计算工具和分析方法也需要新的架构、算法和软件等来提高质量、效率，降低成本，并实现数据分析、大数据可视化和数据共享等。

信息获取和利用共享：为确保遗传资源的合理记录和共享惠益的合规获取，EBP将促进基因和基因组资源利用的下游监控和追踪，并为满足国家和国际层面的需求，开发获取和惠益共享承诺的相关系统。

丁陈君（中国科学院成都文献情报中心）编译自

http：//www.pnas.org/content/115/17/4325

原文标题：Earth BioGenome Project：Sequencing life for the future of life