药物化学论文投稿中常见问题分析

白进发 王俊丽 陈 静

近年来，随着药物化学的迅速发展，相关的学术稿件越来越多。但是稿件投稿过程中存在很多问题，影响了稿件的水平和质量，也影响药物化学新的科研成果及时有效发表。虽然有一些文章，对于期刊投稿中常见问题进行了分析，例如标题问题[1，2]，摘要和关键词、参考文献等问题[2-4]。还有人研究英文写作问题[5，6]、科技论文撰写规范[7]、研究生科技写作中的问题[8]及学术伦理问题[9]。另外，还有一些文章研究了医学论文写作中出现的问题[3，10-13]，但是针对化学期刊药物化学专业论文写作中的问题研究还未见报道。我们以中国化学快报（ISSN 1001-8417）为例，研究了药物化学稿件中出现的常见问题，提出了针对性建议和措施。

中国化学快报的英文名是Chinese Chemical Letters，它是1990年创刊的全英文期刊，第一任主编是我国著名药物化学家梁晓天院士，现任主编是钱旭红院士。Chinese Chemical Letters是由中国化学会和中国医学科学院药物研究所主办的月刊，它发表化学各个领域的创新性研究成果。近年来，Chinese Chemical Letters的国际影响力逐年提升，2015年的SCI影响因子（Impact Factor）为1.947，2016年的影响因子与2015年基本持平（1.932）。2017年影响因子预计可以达到2.6左右。随着Chinese Chemical Letters影响力的提高，本刊收到的药物化学稿件也逐年增多。通过调查Chinese Chemical Letters 2015—2017年328篇药物化学稿件的退稿（或大修）原因，我们对药物化学专业投稿中的常见问题进行了分析，提出了针对性建议和措施，目的是提高药物化学稿件的质量，帮助药物化学创新成果及时有效发表。

一、资料与方法

选取Chinese Chemical Letters期刊2015—2017年药物化学专业稿件中退稿（或大修）稿件328篇。根据审稿专家意见、副主编意见和编辑专业知识，按照退稿原因进行分类和分析，归纳总结并提出具体建议和措施。

二、问题与分析

（一）摘要（Abstract）的信息量不全

摘要的内容是全文的核心内容，在文献检索中起着十分重要的作用。摘要应该具有独立性和自明性，并且具有与论文同等量的主要信息，即不阅读全文，就能获得必要的信息[2，3]。但是有些论文的摘要不能体现全文的主要内容，信息量偏少，要素不全，论述方法或结果太笼统。一般情况下，摘要由目的（Objective）、方法（Methods）、结果（Results）与结论（Conclusions）四部分组成，各部分应该具体明确，并且应该给出主要的实验结果和结论。

（二）引言（Introduction）部分的设计思路不明确、重点不突出

引言部分要求重点突出，避免空泛，通过研究相关文献后直接引出需要解决的问题[3]。如何指出当前研究的不足并有目的地引导出自己研究的重要性是引言写作的一个难点和重点。引言的撰写要有一定的逻辑性，并且不能出现较多语法错误。引言一般应该与结论相呼应，在引言中提出的问题，在结论中应有解答或讨论说明。

如果作者未能在论文的引言部分就其分子设计思想提出有说服力的依据（例如药效团的拼合并非随意组合等），并且对母体药物的结构活性关系（SAR）没有给出必要的说明，给读者的印象是拼合片段的选择存在随意性，这样就会降低审稿专家对论文创新性的评价。其次，在生物活性筛选中虽然发现了一些与阳性对照药物作用强度相近的新化合物，但是作者对这些新化合物的优势或潜在优势没有提出有说服力的观点。文章的结论仅限于对实验结果的一般性概括，不能体现论文实验结果的重要性；另外，如果论文的英文写作语法错误还较多，这样的稿件一定会被退稿。例如有一篇抗菌药物合成的论文，审稿人提出：（1）在设计思路上，作者采用片段拼合方法设计新化合物，依据不充分。建议作者在分析具有明确抗菌活性化合物药效团基础上，采用结构多样的片段与药效团接合，获得新化合物。（2）英文撰写需要修改，过多重复，并且存在很多语法错误。

再例如对于4-苯氨基喹唑啉类激酶抑制剂的报道已经很多，如果还是利用该骨架进行衍生合成新化合物，关键是要能做出自己的特色。如果对于化合物的设计思想并没有给出充分的理由，对于取代基的性质和种类也没有进行详细的研究，这样的论文会让审稿专家和读者感觉化合物设计比较盲目，没有创新的设计思路。

如果根据母药或已有药物（lead compound）设计新化合物，设计思想要有事实依据，指出候选药物的不足要有文献或数据支持，不能猜想，不然审稿人就会认为设计思想的基础不可靠。如果发现化合物体外（体内）活性与化合物结构不符一定要分析具体原因，否则审稿人也会提出疑问。最终设计的化合物要向着活性更好的化合物结构靠近。

（三）结果与讨论（Results and Discussion）部分

结果与讨论部分是一篇论文的核心内容，其创新结果的体现就在此部分[7]。结果归纳总结时不能简单罗列实验数据，讨论部分要对结果进行分析、总结和提炼，要根据一定的理论基础进行论述，而不是简单重复实验结果。这部分存在的问题归纳如下。

1.合成的化合物数量少或者结构单一，无法给出明确SAR。在药物化学论文中，如果化合物的设计思想较简单，化合物结构类型单一，或者合成的化合物活性不强，这样的稿件就很容易被退稿。如果化合物数量和类型足够多，讨论中要对SAR进行深入讨论，给出比较明确的SAR关系，这将对后续相关药物的研究和结构设计有很大指导作用。下面结合稿件中容易出现的问题及评审专家对一些稿件的评审意见具体分析如下。

例如一篇文章设计合成了6-Aryloxyoxazolo[5，4-d]pyrimidi-7（6H）-ones系列化合物，虽然在100μg/mL水平上测定了其真菌抑制率，但是并没有进行结构活性关系研究，给出的只是初步实验结果，审稿专家建议作者进一步进行SAR研究后，优化设计新一轮化合物并测定生物活性后重新投稿。有的论文虽然合成的化合物数量足够多，但是化合物设计方面还有需要进一步完善的地方。例如一篇关于抗HIV活性化合物的论文，审稿专家给出了这样的评价：“本文最大的亮点是甲基的引入，主要设计思想是形成新的范德华作用力，这一发现对该类NNRTI的结构设计具有重要研究价值。但是本文有以下几点可完善之处：（1）对耐药株的高活性是先导物GW878248的一个突出的优点。本文中的化合物是否仍保留了该类化合物对耐药株的较高活性？亦即新增加的甲基是否会影响化合物构象的柔性从而影响其对耐药株RT结合口袋的适应性？建议增加相关分子对接的证据或对耐药株的活性数据，以便于讨论。（2）先导物C环上有一个甲基，主要设计意图为阻断酰胺的代谢。而本文系列化合物中没有保留该甲基，但是又没有说明具体原因。另外，Linker上的甲基是否也有这一考虑，建议一并进行说明。”

有些论文合成的化合物比较多，但是总结的结构活性关系仍然不够完整，主要原因是对不同取代基的考察不够深入。例如对一篇关于激酶抑制剂论文审稿专家建议：R2的取代基不只局限于Cl、F，还要考察氰基、甲氧基、乙酰氨基、甲基、三氟甲基等，除非作者能够说明前者的必要性；希望R1取代基也能增加2-F，3-F；另外，建议补充所有未测定活性化合物的PI3Kγ酶活性，并以酶活性的结构讨论SAR关系。

2.新化合物没有13C NMR谱数据。目前合成的新化合物审稿专家一般要求给出13C NMR谱数据，因为只有1H NMR数据不能完全证明结构的正确性。另外还需要给出高分辨质谱（HRMS）数据，这些谱学数据结合化合物常规的形态、熔点和红外光谱数据才可以证明化合物结构的正确性。如果化合物具有旋光性，其光学异构体的结构也要用基于手性试剂化学反应和核磁共振（NMR）的Mosher法、光谱法（如圆二色谱）等相应的方法确定[14]。例如对一篇药物合成论文的目标化合物合成及结构确证方面，审稿专家提出如下意见：文章利用独一味素（lamiophlomiol）A/B的混合物在浓盐酸催化下与醇类化合物缩合得到相应C1位醚类化合物，但从作者在附件材料（Supporting information）中所提供的结构表征数据尚不足以确证C1位醚基的构型，C6位形成的羟基构型也是存在疑问的？作者有何证据证明C6羟基朝平面上方？6，7-位环氧基在浓盐酸中开环是否可能在C6位氯代？根据作者所提供的一维1H NMR和13C NMR数据尚不能确定目标物的结构以及取代基的构型。因此，本文目标物的结构尚存在一些疑问。另外，结构表征数据也不完整，缺少比旋度及熔点数据。

3.药物活性测试时无对照品或对照品不合适。如果药物化学论文中化学合成部分没有太多亮点，并且合成的化合物生物活性较低，这样的稿件在初审时就会被退稿。合成的新化合物要有明显的生物活性（IC50值，EC50值等）。生物活性实验时，每个化合物浓度至少平行做三遍，这样才能得到测量的平均值并给出测量值的标准偏差（SD）。另外，很关键的一点是化合物的生物活性测试时一定要有对照品，并且要选择适合其研究内容的对照品。例如一篇关于抗转录病毒化合物的论文审稿专家给出了这样的审稿意见：这篇稿件合成了一系列2，2-dimethyl-1，3-dioxolane衍生物并评价了它们抑制人类鼻病毒3C蛋白酶的活性。整篇稿件既没有解决有趣的化学问题，也没有提出创新的方法设计抗转录病毒药物。化合物活性实验结果显示只有化合物7d显示出一定活性（IC50=13.22µmol/L），但是并没有对照药品的活性数据。其次，该稿件的模型研究显得非常肤浅并且没有给化合物的结构优化过程提供可靠的支持。除了必须有合适的对照品外，生物活性评价时选择的评价方法也要根据化合物的研究内容选择合适的生物活性评价方法，保证对化合物的评价准确、可靠。例如审稿专家对一篇稿件的生物活性评价提出了如下建议：生物活性评价部分，建议采用直接针对EGFR的分子水平的评价方法，以排除化合物对细胞毒性、膜通透性等复杂因素造成的假阳性现象。

另一篇关于黄酮类衍生物氧钒配合物的抗糖尿病研究的论文，审稿人指出虽然合成了许多化合物，但是化合物结构单一，另外建议在体内生物活性测试时要增加阳性的II型糖尿病药物同时测定，确保生物活性测试更加完整、准确。

具有抗肿瘤药物活性的化合物作为抗菌药物研究时，有的审稿专家认为合成的化合物不仅要测定抑制格兰仕阳性菌（gram-positive bacterial strain）的活性，还要测定抑制格兰仕阴性菌（gram-negative bacterial strain）的活性。另外还要排除化合物本身的细胞毒性对抗菌活性的影响。

4.从天然产物中分离的新化合物结构新颖性及绝对构型问题。从天然产物中分离得到的新化合物结构要新颖，并且要确定化合物的绝对构型。化合物的绝对构型最好通过电子圆二色谱（ECD），X-衍射，或者基于手性试剂化学反应和核磁共振（NMR）的Mosher法等确定绝对构型[14]。另外，所分离的新化合物要有一定的生物活性（抗癌、抗菌、抗炎等等）。

如果从天然产物中分离得到的新化合物的结构类似化合物在天然产物研究中已经报道，新化合物结构的新颖性一般，结构鉴定的难度不大，就不能满足高水平化学期刊对天然产物化合物论文的要求。其次，从天然产物中分离得到的新化合物一定要确定绝对构型，否则这样的天然产物论文也很难被接受。最后，如果对新化合物未进行任何生物活性筛选评价，其潜在应用价值就无法体现，那么对读者和后续研究的吸引力就不足，这样的论文也会被退稿。

三、结论与建议

通过上面的实例归纳和分析，我们认为一篇优秀的药物化学论文的摘要应该具有独立性和自明性，具有与论文同等量的主要信息，要给出主要的实验结果和结论。引言部分一定要重点突出，通过研究相关文献后直接引出需要解决的问题。在引言中提出的问题，在结论中应该有解答或讨论说明。药物化学论文中合成的化合物要有一定的数量和结构多样性，这样才能总结出明确的结构活性关系（SAR）。其次，新化合物要提供13C NMR谱学数据及其他相关谱学数据，以确保合成的化合物结构正确。化合物的活性测试时要选择合适的对照品和选择适合的生物活性测试方法，以排除干扰，保证活性实验结果准确、可靠。从天然产物中分离得到的新化合物结构要有一定的新颖性，其绝对构型要用合适的方法确定，最好还要有生物活性实验结果，对读者和后续研究提供参考。本文虽然是以Chinese Chemical Letters期刊为例研究了药物化学专业稿件中出现的问题，提出了针对性建议和措施，但是根据药物化学专业论文的特点，本文研究结果对提高化学期刊药物化学专业论文的撰写质量，推动论文及时有效发表具有借鉴作用。