SIRT7基因在胃癌中的表达及意义
2018-03-15刘衍姣李兰兰曹璋
刘衍姣 李兰兰 曹璋
【摘 要】目的:基于大数据挖掘分析SIRT7基因在胃癌组织的表达及其对胃癌患者预后的影响。方法:采用Oncomine 数据库分析SIRT7在胃癌组织中的mRNA表达情况,通过Kaplan-Meier Plotte数据库进行胃癌患者总生存期的分析。结果:在mRNA水平上,与正常胃组织比较,胃癌组织中呈低表达,但是差异无统计学意义;但是生存分析结果显示SIRT7 高表达的胃癌患者预后较差。结论:SIRT7表达在胃癌和正常胃组织中有明显差异,SIRT7过表达的胃癌患者预后较差。
【关键词】胃癌;SIRT7;预后;表达
中图分类号: R735.2 文献标识码: A 文章编号: 2095-2457(2018)35-0180-002
DOI:10.19694/j.cnki.issn2095-2457.2018.35.078
Expression of SIRT7 in Gastric Cancer and Its Clinical Significance
LIU Yan-jiao1,2 LI Lan-lan1 CAO Zhang1*
(1.Department of Pathology, Binzhou Medical Uuniversity, Yantai Shandong 264003, China;
2.Gao Qing Maternal And Child Health Care Hospital, Zibo Shandong 256300, China)
【Abstract】Objective: To analyze the expression and prognostic value of SIRT7 gastric cancer based on big data mining. Methods: The mRNA expression levels of SIRT7 in gastric cancer tissues were analyzed via the Oncomine database. Moreover, the Kaplan-Meier database was used to evaluate the effect on overall survival (OS) of patients with gastric cancer. Results: Compared with the normal gastric tissue, SIRT7 expression was lower in gastric cancer tissue Patients with high SIRT7 expression had a shorter overall survival. Conclusion: mRNA expression of SIRT7 in gastric cancer was underexpression. Patients with high SIRT7 expression had a poor prognosis.
【Key words】Gastric cancer; SIRT7; Prognosis; Expression
0 前言
胃癌是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,是全球癌症相关死亡率的第三大原因,胃癌已经是我国第二大恶性上皮肿瘤,全世界近一半的新发胃癌患者和死亡病例在中国。目前,我国胃癌患者的五年生存率是35.9%,而东亚的日本、韩国均已达到60%以上。与之比较,我国胃癌五年生存率仍处于较低水平[1-3]。胃癌的治疗方案主要包括手术治疗和放化疗,但是很多胃癌患者在确诊时已经进展到中晚期,即使进行了胃癌根治术,术后仍有较高的复发率,为社会带来了巨大的经济负担。近年,随着精准医疗概念的提出和临床推广应用,从分子水平研究胃癌的发生、发展及预后,有利于发现新的分子靶点,提供更精确的胃癌治疗方案。SIRT7是一种NAD+依赖性组蛋白去乙酰化酶,在人类多种癌组织中高表达,与肿瘤的发生、发展和病人预后具有显著相关性[4-7]。本研究采用Oncomine数据库和数据库系统性分析了SIRT7在胃癌中的表达和预后,以期为胃癌患者个体化的治疗方案的选择提供新的方向。
1 方法
1.1 Oncomine数据库分析SIRT7在胃癌组织中的表达情况
Oncomine数据库是一个癌基因芯片数据库和整合数据挖掘平台,在此数据库中可以根据自己的需求设定筛选条件。在此研究中,设定筛选条件有以下几个:(1)“Gastric Cancer”;(2)“Gene: sirt7”(3)“Data Type: mRNA”;(4)“Sample Type:Clinical Specimen”;(5)Analysis Type:Cancer vs. Normal Analysis”;(6)值设定:P value <0.01,fold change>2,gene rank=top 10%。“Clinical Outcome: Survival Status at 5 Years。筛选的结果中可以根据需要选择呈现形式,如箱状圖或柱状图,亦可显示某基因在正常与癌症组织之间表达的倍数关系、P值等。
1.2 采用数据库在线分析患者预后的影响
Kaplan-MeierPlotter 数据库(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=service&cancer;=gastric)的胃癌数据集进行在线生存分析。筛选条件如下:(1)Cancer: Gastric Cancer;(2)Gene: SIRT7;(3)Survival:Over-all Survival(OS);(4)Treatment:surgery alone。P<0.01认为差异有统计学意义。
2 結果
2.1 SIRT7在胃癌组织中的表达及预后
Oncomine数据库显示:胃癌与正常组织中SIRT7表达降低,但是差异无明显统计学意义。(图1);SIRT7基因表达对胃癌患者预后的影响分析发现,在胃癌组织中SIRT7的高表达对胃癌患者总生存期较短,与既往研究相一致,Affy ID: 218797_s_at SIRT7,Cutoff value used in analysis:584。(图2)
3 讨论
SIRT7是位于染色体17 (17q25.3)染色体端粒下区域的单个复制基因,其基因组序列跨越6.2 kb区域,SIRT7及基因编码10个外显子,外显子4最短(长71bp),外显子7最长(长237bp)[8]。人类SIRT7的开放阅读框长1203bp,编码长400个氨基酸的蛋白质,这个蛋白质的分子量大约是44.9KD,等电点9.8。SIRT7与酵母Sir2只有21%的相同,酵母Sir2是去乙酰化酶蛋白家族的创始人(至少在七种哺乳动物去乙酰化酶中)。SIRT7对酵母Sir2只有21%的认同,酵母Sir2是、乙酰化酶蛋白家族的创始人(至少在七种哺乳动物去乙酰化酶中) 。在七种哺乳动物去乙酰化酶中,SIRT7与SIRT6蛋白序列的相似性(56%)最接近,与研究最多的人类去乙酰化酶 SIRT1的相似性为39%。在SIRT7序列中,保守的催化域在90-331氨基酸(包括外显子3-9)之间[9-14]。
SIRT7 mRNA在小鼠的所有组织中普遍表达,尽管它们的表达水平不同。SIRT7在肌肉,心脏和脑等非增殖组织中表达较低,但在肝脏,脾脏和睾丸等代谢活跃组织中表达较高。老龄化小鼠心脏(23个月)显示SIRT7表达水平降低约40%。经历衰老的原代成纤维细胞不仅显示SIRT7转录水平降低,而且还显示原代成纤维细胞中复制衰老的核仁SIRT7缺失[15]。然而,随着细胞转录水平的升高,人乳腺上皮细胞中SIRT7的表达水平增加。毒胡萝卜内酯或衣霉素处理诱导的ER应激反应期间,还发现SIRT7的表达水平增加。发现SIRT7在甲状腺,乳腺,膀胱和肝细胞癌组织中上调。特异性选择用于化学抗性的癌细胞系MCF-7,Saos-2和A2780显示与原始非抗性细胞系相比SIRT7的表达降低。通常,很难将去乙酰化酶归为癌基因或肿瘤抑制因子[16]。SIRT1在癌症背景下进行了最广泛的研究,其表达模式在不同的癌症类型中有所不同。相比之下,已发现SIRT7在迄今为止所研究的所有癌症类型中都被上调,例如甲状腺癌,淋巴结阳性乳腺癌,膀胱癌,肝细胞癌和结肠直肠癌,被视为潜在的致癌基因。此外,许多研究报道,与正常对应物相比,癌细胞系中的表达水平增加,并且这些细胞系中SIRT7表达水平的降低了它们的增殖或致癌能力[17-19]。
本研究首先采用Oncomine数据库分析SIRT7在胃癌组织中的表达,结果显示:胃癌与正常胃组织中和 的 表达无明显差异。 但在zhang等研究发现人胃癌组织中具有高表达。在胃癌细胞中敲低Sirt7能够抑制细胞增殖过程和体外克隆形成,皮下移植瘤实验同样证明sirt7表达降低能够显著抑制胃癌细胞生长。Sirt7的表达水平与疾病发展阶段、转移和病人存活具有显著相关性。与数据库统计结果结果不一致,我们本次数据挖掘的mRNA水平的变化,蛋白表达的结果有待进一步验证。我们进一步通过 Kaplan-Meier Plotter 数据库分析SIRT7 在胃癌患者预后中的意义,结果表明SIRT7高表达的胃癌患者总生存期较短,与Oncomine数据库的结果似乎相互冲突。Kim等人报道了SIRT7在肝细胞癌中的致癌作用。在大量HCC患者样品以及几种肝细胞癌细胞系中,SIRT7表达水平升高。在HCC细胞系中敲低SIRT7通过降低p21的表达水平和增加细胞周期蛋白D1的水平来抑制其生长速率,从而导致G1/S进展减少。在HCC患者中SIRT7的表达增加是由于微小RNA,miR-125a-5p和miR-125b的内源性高甲基化所调控[20]。
综上所述,Sirtuin 7作为sirtuin蛋白家族的成员之一,SIRT7的高表达已在几种癌症类型中报道,并且研究结果倾向SIRT7是一种候选的癌基因,SIRT7是否也会在其他致癌基因(如突变体Ras)的背景下促进肿瘤发生的发展仍有待探索。然而,从现有的报道来看,SIRT7在胃癌发生、发展中的作用还需进一步探讨和研究。
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