浅谈犬库布病毒及检测方法
2017-06-05阳爱国
侯 巍 阳爱国 郭 莉 莫 西
(四川省动物疫病预防控制中心,四川成都 610041)
浅谈犬库布病毒及检测方法
侯 巍 阳爱国 郭 莉 莫 西
(四川省动物疫病预防控制中心,四川成都 610041)
犬库布病毒(Canine Kobuviruses,CaKoV)属于小RN A病毒科(Picornaviridae)A型爱知病毒(Aichivirus A)属。研究表明犬库布病毒(Canine Kobuviruses)与犬病毒性腹泻存在一定相关,2011年该病毒第一次在美国从患急性胃肠炎的犬中检测出[1],而后中国[2]、非洲[3]、意大利[4]、英国[5]等国家相继被发现。
库布病毒;检测
1 犬库布病毒的简史
1.1 犬库布病毒的发现及其分类
库布病毒属于小RNA病毒科中新增加的属。2011年,从美国患有急性胃肠炎的犬中检测出第一株犬库布病毒。根据基因序列分析,其距离AiV基因A和B型,因此研究人员对这些病毒命名为犬科库布病毒(CaKoV)[1]。研究证明[2]- [7],库布病毒通过被污染的食物或水粪-口途径感染,并且它们在人和动物[8][9]的胃肠炎中具有潜在的致病作用[10]。
根据基因序列分析显示,CaKoV在遗传上接近小鼠库布病毒M-5(在氨基酸水平同源性84.0%)[4]与 AiV(在氨基酸水平同源性达80.0%)[11]。根据国际病毒分类学委员会(ICTV)制定的标准(小RNA病毒科内,如果在P1、P2和P3区域氨基酸具有40%、40%和50%同源性,就可以归为一属),因此CaKoV可以被认为是来自鼠科布病毒(MuKoV 1型)和人类AiV(AiV1型)的不同基因型(CaKoV 1型),同属爱知A型[12]。
1.2 犬库布病毒的流行
犬库布病毒的国内外流行情况见表1
表1 犬库布病毒流行情况表
2 犬库布病毒基因结构
犬库布病毒是一种极小的球形病毒,直径约为 30nm,二十面体、无囊膜的单股正链 RNA 病毒。与所有的微RNA 病毒一样,CaKoV成员具有相似的基因组结构:包括 5- UTR、一个大的开放阅读框(open reading frame,ORF)、3-UTR以及Poly(A)tail。ORF编码的蛋白依次为L(非结构蛋白)、VP0、VP3和VP1(结构蛋白)、2A-2B-2C(非结构蛋白)和3A-3B-3C-3D(非结构蛋白)。
根据Genbank载录的全基因序列分析中国株CH-1,韩国株12D049,英国株UK003, 美国株US-PC0082。中国CH-1株长度为8216bp,韩国12D049株长度为8292bp,英国UK003株的长度为8213bp。
3 病毒的鉴定
3.1 病毒的培养
病毒分离培养是鉴定病原行之有效的方法,AiV可以在Vero或BS-C-1细胞上增殖并能观察到明显的细胞病变[13]。
3.2 病毒的检测
3.2.1 免疫学检测方法
2016年日本学者通过酶联免疫吸附的方法在犬的粪便中成功检测到AiV[14]。此外,报道称,有研究学者在198只狗血清样品和97只猫血清样品中检测到爱知病毒IgG抗体的,分别为74只(37.4%)的67只(69.9%),检测到的抗体最高滴度为1:2000。
3.2.2 分子生物技术
由于PCR 方法具有敏感、快速、特异及可重复性的优点,因此对于CaKoV的检测大都采用了RT-PCR 的方法。由于CaKoV的致病性及其机制尚不清楚,临床诊断也无法进行,基因检测可能是在未来很长时间内的主要检测方法见表2。
表2 检测犬库布病毒方法
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