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巨尾桉铜分子伴侣EuCCS基因的克隆及表达分析

2017-06-05赵艳玲姚婕

关键词:原核条带克隆

赵艳玲, 姚婕

(华侨大学 化工学院, 福建 厦门 361021)

巨尾桉铜分子伴侣EuCCS基因的克隆及表达分析

赵艳玲, 姚婕

(华侨大学 化工学院, 福建 厦门 361021)

以巨尾桉为研究对象,克隆得到巨尾桉铜分子伴侣(CCS)基因(GenBank注册号为KJ755351.1),生物信息学分析表明:EuCCS蛋白定位于叶绿体,与龙眼同源基因的一致性达到99%.巨尾桉CCS的原核表达载体pET-EuCCS在大肠杆菌细胞内可以稳定表达,超氧化物歧化酶(SOD)活检测结果表明:转化菌株的SOD酶活性比对照菌株高,说明外源基因EuCCS具有生物学活性.利用荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术分析CCS在巨尾桉中的表达特性,结果表明:在植株生长旺盛的部位,CCS表达量较大,如植株幼叶,随植株叶片慢慢衰老,CCS的表达量也随之下降;在组培苗中,叶片的CCS表达量最大,其次是茎.

巨尾桉; 铜分子伴侣; 克隆; 原核表达; 聚合酶链式反应

铜离子是细胞色素氧化酶、铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn superoxide dismutase,Cu/ZnSOD)、漆酶、赖氨酰氧化酶和多巴胺单加氧酶等所必需的辅助因子,在维持植物正常的新陈代谢及生长发育中发挥着重要作用[1].当铜离子超过一定值时,铜离子参与Fenton反应会生成大量的羟自由基,对生物体产生重金属毒害作用,所以在长期进化过程中,生物体内形成一套完整的铜代谢调控机制,分子伴侣和铜螯合剂调控细胞内和细胞外铜的转运,达到生物体内铜离子的稳态[2].铜分子伴侣(CCS)可以传递铜离子到Cu/ZnSOD中,并将其激活生成有活性的酶分子[3-7].相关研究表明:CCS在调控植物体内铜离子平衡过程中发挥着特殊作用[8-9].本文克隆了巨尾桉的CCS基因,通过初步构建该基因原核表达体系,测定该酶的活性,并通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和实时定量聚合酶链式反应(quantitative PCR)技术分析巨尾桉中CCS的表达特性,研究了该基因的基本功能特点.

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株与植物材料 pET-32a(+),E.coliJM109,BL21(DE3),巨尾桉植株为本实验室保存.

1.1.2 试剂 Takara SYBR ExScript等试剂盒和试剂采购自大连Takara公司;引物由厦门精聚公司合成.

1.2 实验方法

1.2.1 巨尾桉EuCCS基因的克隆方法 具体克隆方法参见文献[10].PCR引物为CCS1:5′-CATGGCATTTCTGAGGTCGG-3′,CCS2:5′-CTCAGACTTTGCTGGTGAC-3′.CCS目的片段与pMD-18T Vector连接,经聚合酶链式反应(PCR)验证阳性克隆子,命名为pMD-EuCCS,委托华大基因测序.

1.2.2 构建原核表达载体pET-EuCCS并诱导表达 设计引物CSS3:5′CGGATCCATGGCATTTCTGAGGT 3′,CSS4:5′CGAGCTCTCA GACTTTGCTGGTG 3′,获得亚克隆载体pMD-CCS1,用BamHⅠ 和SacⅠ 双酶切连接pET-32a(+).用质量分数为12%的SDS-PAGE蛋白电泳分析融合基因在大肠杆菌Bl21中的表达,具体方法参见文献[10].

1.2.3 IPTG诱导CCS蛋白原核表达条件与SOD酶活性测定 设计两组实验,一是加入终浓度分别为0,0.5,1.0,1.5,2.0 mmol·L-1的异丙基硫代半乳糖苷(IPTG),诱导4 h后,SDS-PAGE电泳分析;二是设置16,22,37 ℃摇床中异丙基硫代半乳糖苷诱导4 h的SDS-PAGE电泳分析.采用氮蓝四唑(NBT)检测超氧化物歧化酶(SOD)蛋白酶活,具体方法参见文献[10].

1.2.4 RT-PCR 和qPCR检测CCS在巨尾桉不同部位的表达量 巨尾桉叶片及组培苗总核糖核酸(RNA)提取,使用Takara公司的PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser去除基因组DNA,Takara公司的PrimeScript Ⅱ反转录反应,利用RT-PCR检测CCS在桉树中的表达情况.利用Takara SYBR ExScript 试剂和罗氏LightCycler 480仪器,以桉树6个样本的cDNA为模板,内参基因为巨尾桉18S rRNA(171 bp),引物设计分别为EgCCS1:5′TCATCAAGTCTTGCCTGAGC 3′,EgCCS2:5′GCTCAAGTCCACCTC AACAT 3′,Eg18S1:5′CGCGCTACACTGATGTATTC 3′,Eg18S2:5′GTACAAAGGGCAGGG ACGTA 3′.预变性:95 ℃,30 s;变性:95,℃,5 s;退火:60 ℃,20 s,40个循环,最后延伸,65 ℃,15 s,分析实时定量PCR(qPCR)数据,每个反应包括3个重复.

图1 RT-PCR扩增巨尾桉CCS基因Fig.1 Amplification products of eucalyptusCCS cDNA sequence

2 研究结果

2.1 巨尾桉CCS基因的克隆

纯化采用Trizol法大量提取巨尾桉总RNA获得信使RNA(mRNA)后,经RT-PCR扩增得到非单一条带,如图1所示.图1中:M为DNA Marker;1~3为cDNA 序列扩增条带.选择预测的960 bp左右的条带为目标条带切胶回收,克隆得到CCS基因(GenBank注册号为KJ755351.1).

生物信息学分析(数据未列出)的结果表明:CCS蛋白是定位在叶绿体中的亲水的、稳定的酸性蛋白质,该蛋白含2个跨膜螺旋,从N末端朝外由内到外进行跨膜.该蛋白主要由59.6%的无规则卷曲,29.5%的β-折叠和11.0%的α-螺旋等构成,并存在多个磷酸化位点和保守结构域,这些保守结构域的存在可能是激活SOD表达所必须的.采用MEGA 5.2对来自11种不同物种的CCS核酸序列作进化树分析(数据未列出),巨尾桉CCS与龙眼、葡萄、蓖麻处于同一分支中,与它们在进化距离上较为接近,同源性分别为99%,81%,80%.

图2 pET-EuCCS Sac Ⅰ/BamH Ⅰ双酶切验证Fig.2 Gel analysis of plasmid pET-EuCCS double digested by Sac Ⅰ/BamH Ⅰ

2.2 原核表达载体pET-EuCCS的构建与诱导表达

亚克隆获得具有SacⅠ/BamHⅠ酶切位点的pMD-EuCCS与线性载体PET-32a(+)同时双酶切,凝胶回收之后,连接产物转化E.coliBL21,SacⅠ/BamHⅠ双酶切筛选阳性质粒,命名为pET-EuCCS.

pET-EuCCSSacⅠ/BamHⅠ双酶切验证,如图2所示.图2中:M为DNA Marker;1~3为pET-EuCCSSacⅠ/BamHⅠ双酶切条带.

图3 重组CCS在E. coli BL21中表达的SDS-PAGE电泳图Fig.3 SDS-PAGE analysis of expression of recombinant pET-EuCCS in E. coli BL21

pET-32a(+)载体的N端部分分子量大约为18 ku,基因完整阅读框为960 bp,编码320个氨基酸,理论上可表达32 ku大小,加上表达系统的融合蛋白部分,预期融合蛋白大小是50 ku.经IPTG诱导之后,重组质粒表达一条大约50 ku条带,如图3所示.这与预期的表达目标蛋白一致.图3中:M为蛋白Marker;1为未诱导的空菌株;2为诱导的空菌株;3为未诱导的含pET-32a(+)的菌株;4为诱导的含pET-32a(+)的转化菌株;5为未诱导的含pET-EuCCS的转化菌株;6为诱导的含pET-EuCCS的转化菌株;箭头所示为表达的融合蛋白条带位置.

2.3 CCS蛋白原核表达条件的初步研究

在不同浓度IPTG诱导CCS蛋白表达实验中,IPTG添加量为0.5 mmol·L-1时,足以诱导CCS蛋白表达,如图4所示.图4中:M为蛋白Marker;1~5分别为0,0.5,1.0,1.5,2.0 mmol·L-1诱导4 h的蛋白表达;箭头所示为表达的融合蛋白条带.16,22,37 ℃ 的IPTG诱导含pET-EuCCS菌株都能正常表达出CCS蛋白,如图5所示.图5中:M为蛋白 Marker;1为16 ℃ IPTG诱导pET-32a;2为16 ℃ IPTG诱导pET-EuCCS;3为22 ℃ IPTG诱导pET-32a;4为22 ℃ IPTG诱导pET-EuCCS;5为37℃ IPTG pET-32a;6为37 ℃IPTG诱导pET-EuCCS.为了检测最佳的IPTG诱导时间,对16,22,37 ℃下的IPTG诱导时间进行研究.结果表明:16 ℃诱导下,9 h后,CCS蛋白表达量趋于稳定;22 ℃诱导下,6 h后,CCS蛋白表达到最大量;37 ℃诱导下,4 h后,CCS蛋白表达趋于稳定(数据未列出).

图4 不同浓度IPTG诱导对EuCCS蛋白表达的影响 图5 不同温度IPTG诱导对CCS蛋白表达的影响Fig.4 Effect of IPTG concentration on expression of recombinant EuCCS protein expression Fig.5 Effect of IPTG temperature on expression of CCS protein expression

图6 不同温度诱导菌株的SOD酶活检测Fig.6 SOD enzyme activity detection under different induction temperatures

CCS的酶活性无法直接检测,可以通过检测CCS底物Cu/ZnSOD酶活来间接检测CCS的活性.为了检测外源基因CCS诱导表达的蛋白是否具有生物学活性,利用氮蓝四唑法检测不同温度诱导菌株的SOD酶活,如图6所示.图6中:z为酶活;t为温度.由图6可知:在16,22 ℃ IPTG诱导下,转化菌株pET-EuCCS的SOD酶活性高于对照菌株pET-32a,说明EuCCS的表达可以提高大肠杆菌Cu/ZnSOD的活性;在37 ℃诱导下,SOD酶活变化不大,可能是由于表达蛋白在此温度下形成包涵体所致,包涵体中的蛋白无酶活性.

2.4 巨尾桉CCS的表达分析

巨尾桉CCS基因在组培苗根、茎、叶和植株幼叶、中段叶和老叶均有表达,如图7所示.由图7可知:组培苗叶片中的CCS表达量比根、茎更大,植株中幼叶的CCS表达量最大,之后是成熟叶和老叶.

(a) 温室苗的不同龄叶片 (b) 组培苗的不同部位图7 RT-PCR检测巨尾桉不同部位的CCS表达情况Fig.7 RT-PCR detection of CCS expression in eucalyptus

利用实时定量 PCR方法进行基因表达解析,选择18S RNA作为参比基因来对所有样品进行归一化处理,再对不同样品之间的目的基因表达量进行比较.用目的基因CCS的定量结果除以管家基因18S的定量结果得到校正值.实时定量PCR分析巨尾桉CCS基因表达,如图8所示.由图8(a)可知:用目的基因CCS校正值作柱状图,巨尾桉组培苗叶和茎中的CCS表达量较高,而根中的表达量相对较低.由图8(b)可知:巨尾桉温室苗幼叶中的CCS表达量最高,其次是成熟叶,衰老叶片中检测不到CCS的表达,可能是由于表达量太小所致,这个结果和RT-PCR的结果基本一致.

(a) 组培苗 (b) 温室苗图8 实时定量PCR分析巨尾桉CCS基因表达Fig.8 Quantitative PCR analysis of CCS relative expression in eucalyptus

3 讨论

CCS基因的功能研究的方法主要是原核表达和真核表达研究.拟南芥的CCS基因转入酵母表达体系中发现,拟南芥CCS可以激活酵母细胞中Cu/ZnSOD的表达[11],大豆的CCS基因,构建原核表达载体后转化到大肠杆菌中,也具有表达活性[6].文中巨尾桉CCS基因可以稳定地在大肠杆菌中表达,在37,22,16 ℃条件下,1 mmol·L-1IPTG诱导到4,6,12 h,可达到稳定.通过SOD酶活测定 22,16 ℃诱导下,转化菌株酶活比对照组明显升高,说明该温度下获得的EuCCS表达产物可以提高大肠杆菌的Cu/ZnSOD活性.

研究者已经对马铃薯、拟南芥等的CCS的表达特性进行了研究.在CCS表达部位的研究有将马铃薯的CCS启动子区域融合荧光素酶序列,转基因发现在马铃薯茎块和匍匐枝中CCS基因表达量最大,在根部和花部的表达量最小[4].拟南芥全长CCS基因融合绿色荧光蛋白基因的表达载体转入拟南芥后荧光蛋白集中在叶绿体内.这表明克隆得到的拟南芥CCS主要定位于叶绿体内[11].利用RT-PCR和qPCR技术研究巨尾桉的CCS基因发现,在植株生长旺盛的部位CCS表达量较大,如植株幼叶,随植株叶片慢慢衰老,CCS的表达量也随之下降;巨尾桉组培苗中叶片中CCS的表达量最大,其次是茎和根,与该基因可能定位于叶绿体表达的研究结果相呼应.

4 结束语

CCS与逆境相关的表达特性主要体现为:环境中铜离子过量时,拟南芥茎和根中CCS的表达量上升,反之则下降[12].马铃薯的CCS启动子区域包含几个同源的顺式作用因子,其中有3个和植物生长素响应有关,4个和应激响应有关.CCS可以被植物生长素、赤霉素、果糖、蔗糖、葡糖糖诱导表达,高浓度的铜离子则抑制表达[4].植物在衰老状态下,CCS的表达量也会随之增加[13].CCS是一个与逆境相关的基因,调控CCS的表达可能会提高植物的耐受逆境的能力,下一步的工作是把基因转入到植物中,研究基因的功能和调控机理,定向培育高抗植物.

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(责任编辑: 钱筠 英文审校: 刘源岗)

Cloning and Expression of Copper Chaperone or Superoxide Dismutase Gene inEucalyptusgrandis×E.ophylla

ZHAO Yanling, YAO Jie

(College of Chemical Engineering, Huaqiao University, Xiamen 361021, China)

The major pathway for activation ofCu/ZnSODrequires the CCS copper chaperone to insert copper and activateCu/ZnSODthrough oxidation of an intramolecular disulfide. TheEuCCSgene is cloned by RT-PCR fromEucalyptusgrandis×E.ophylla(GenBank Accession Number: KJ755351.1).Boinformatics analysis suggests that CCS is located in the chloroplast and the evolutionary distance between eucalyptus and longan is quite close with the identity of 99%.The strain prokaryotic expression vector pET-EuCCScan be expressed stably inE.coli, and the superoxide dismutase enzyme activityis higher than control indicating that the clonedEuCCSgene could activateCu/ZnSOD.Besides, the expression characteristics of eucalyptus CCS gene are analyzed by quantitative PCR.And the results show that theEuCCSquantity of the young leaves is relatively higher than that of the old one to greenhouse seedling and for tissue culture seedling theEuCCSis expressed higher in leaves than stem and root. Keywords:Eucalyptusgrandis×E.ophylla; copper chaperone for superoxide dismutase; clone; prokaryotic expression; polymerase chain reaction

2016-05-18

赵艳玲(1978-),女,助理研究员,博士,主要从事植物分子生物学的研究.E-mail:zhaoyl@hqu.edu.cn.

国家自然科学基金资助项目(31300497)

Q 943.2

A

1000-5013(2017)03-0374-05

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