云南德宏地区一例虎纹蛙气单胞菌的分离鉴定
2017-02-25张瑞海赵汝梅张书光
张瑞海赵汝梅张书光
(1.盈江县动物疫病预防控制中心,云南盈江 679300;2.德宏州动物疫病预防控制中心,云南芒市 678400;3.昆明理工大学津桥学院,云南昆明 650101)
云南德宏地区一例虎纹蛙气单胞菌的分离鉴定
张瑞海1赵汝梅3张书光2*
(1.盈江县动物疫病预防控制中心,云南盈江 679300;2.德宏州动物疫病预防控制中心,云南芒市 678400;3.昆明理工大学津桥学院,云南昆明 650101)
目的:确诊虎纹蛙的致病菌。方法:采用平板分离法从死亡虎纹蛙肝脏中分离出1株细菌,通过表型、16s-rRNA的PCR扩增、测序鉴定。结果:分离菌的测序结果为气单胞菌,16s rRNA序列同源性分析结果表明分离菌与气单胞菌的同源性为99%。结论:虎纹蛙所患细菌病为胃肠炎,细菌病原为气单胞菌。
气单胞菌 分离 鉴定 16s-rRNA
虎纹蛙(Rana tigrina Wiegmann)隶属于两栖纲无尾目蛙科蛙属,广泛分布于中国、印度、尼泊尔、锡金、孟加拉、斯里兰卡、泰国、印度尼西亚及菲律宾等热带和亚热带地区。虎纹蛙共有4个亚种,中国仅分布1 亚种,即 虎纹蛙,目前已被列为国家二级保护动物,主要分布于我国东南和南部各省,河南和陕西南部也偶有分布。云南的陇川、盈江、勐腊、河口、金平、屏边、石屏和元江等地均有分布。
气单胞菌在细菌分类学上属于弧菌科(Vibrionaceae)气单胞菌属(Aeromonas),是多种鱼类均可感染的病原细菌,且感染后的病型也表现很复杂,同时存在多种不同的免疫血清型。其中有的不仅可致鱼病,还可引起人的感染发病。陈怀青等报道嗜水气单胞菌引起鲤科鱼暴发性传染病,朱家新报道嗜水气单胞菌引起牛蛙暴发性疾病,韩名竹等报道嗜水气单胞菌引起甲鱼出血性败血症。近年来,有关气单胞菌引发养殖鳗鲡的细菌性败血症也多有报道,最常见的由致病性嗜水气单胞菌 Aeromonas hydrophila引起的鳗鲡败血症表现为体表充血乃至溃烂、血性腹水、胃内积水、肠炎、肝脾等组织败血等系列严重病变,每年都能引起养殖鳗鲡的大批量死亡。
1 材料与方法
1.1 材料
病料由云南德宏某个体养殖户送检;细菌基因组DNA提取试剂盒(DP2001)和Ex tag酶购自大连宝生物技术有限公司。
1.2 引物
根据已知参比序列设计细菌通用引物,上游引物PF:5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,下游引物PR:5’-AAG GAG GTG ATC CAG CC-3’,扩增目的片段大小为1500bp左右,由大连宝生物技术有限公司合成。
1.3 菌株的分离与纯化
采取虎纹蛙的肝脏病料,涂布于LB平板上,置于恒温培养箱37摄氏度培养12~16h后观察细菌生长情况。挑取单个典型菌落,进行纯培养后分别进行革兰氏染色及菌种保存。
1.4 16s-rRNA鉴定
1.4.1 16s-rRNA测序
将分离菌株接种LB液体培养基中,37℃培养10h,用试剂盒按说明书方法提取基因组DNA。用细菌通用引物pF、pR、扩增16s-rRNA,PCR扩增体系为50μL,反应条件为95℃ 5 min;94℃30 S,55℃ 1 min,72℃ 1.5 min,30个循环;72℃ 10 min。扩增产物送到大连TaKaRa公司测序。
1.4.2 16s-rRNA测序结果比对
将测序结果提交至GenBank进行比对。下载同源性最高的序列,用本地软件DNAMAN将测序结果与下载序列进行同源性比对。
2 实验结果
从样品中分离到1株细菌,命名为A1。
2.1 菌落特征
LB平板上菌落为光滑,灰白色,半透明,隆起,湿润,圆形的菌落(如图1):
图1 菌落特征
2.1.1 形态特征
革兰氏染色后光镜下检查,红色、杆状、两端顿圆、无鞭毛,无荚膜,无芽孢,革兰氏阴性细菌。其镜检特性见图2:
图2 革兰氏染色形态
2.2 16s-rRNA鉴定
2.2.1 分离菌的16s-rRNA基因
提取分离菌株的基因组DNA,利用细菌16s-rRNA通用引物PCR扩增,得到约1.5 kb大小的目片段,扩增产物凝胶电泳结果(见图3)。
张瑞海(1967-),男,云南德宏人,盈江县动物疫病预防控制中心工作.
张书光(1988-),男,河南三门峡人,云南农业大学预防兽医学专业研究生,德宏州动物疫病预防控制中心工作。