甘肃甘南藏族人群21个非CODIS基因座的遗传多态性
2017-01-12臧丽丽雷亮王涛陶晓岚聂笑联刘贤海
臧丽丽,雷亮,王涛,陶晓岚,2,聂笑联,刘贤海
(1.甘肃省公安厅刑事侦查局,甘肃兰州 730046;2.甘肃政法学院甘肃证据科学技术研究与应用重点实验室,甘肃兰州 730030)
·研究简报·
甘肃甘南藏族人群21个非CODIS基因座的遗传多态性
臧丽丽1,雷亮1,王涛1,陶晓岚1,2,聂笑联1,刘贤海1
(1.甘肃省公安厅刑事侦查局,甘肃兰州 730046;2.甘肃政法学院甘肃证据科学技术研究与应用重点实验室,甘肃兰州 730030)
法医遗传学;多态现象,遗传;短串联重复序列;甘肃;藏族
本研究采用AGCU 21+1荧光标记复合扩增系统对515例甘肃甘南藏族健康无关个体的21个常染色体非CODIS基因座进行遗传多态性分析,旨在为法医遗传学研究提供基础数据。
1 材料与方法
根据知情同意原则,随机采集祖孙三代居住在甘肃甘南藏族自治州的藏族健康无亲缘关系个体FTA卡血痕样本515例,其中男性305例,女性210例。
采用AGCU 21+1 STR荧光检测试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)直接扩增血样DNA,样本DNA在GeneAmp®PCR系统9700(美国AB公司)上进行扩增,实验条件和步骤均严格按照试剂盒使用说明书操作。扩增产物在3500基因分析仪(美国AB公司)上进行毛细管电泳,用GeneMapper ID x1.2软件进行等位基因分型。
根据基因分型结果,应用HW-QuickCheck软件进行Hardy-Weinberg平衡检验[1],利用PowerStats v12软件对原始数据进行处理,计算21个常染色体非CODIS基因座的等位基因频率、杂合度(H)、个人识别率(DP)、非父排除率(PE)、匹配概率(Pm)和多态信息含量(PIC)等。
2 结果与讨论
甘肃甘南藏族自治州515例藏族无关个体的21个常染色体非CODIS基因座等位基因频率分布见表1,群体遗传学参数统计分析结果见表2。21个常染色体非CODIS基因座的累积非父排除率(CPE)和累积个人识别率(CDP)分别为0.999 997 828 805 19和0.999 999 999 999 99。515例藏族个体的21个非CODIS基因座基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。
根据Gill等[2]提出的STR基因座选择标准,DP>0.9、H>0.7的基因座认为是高鉴别能力基因座,由表2可见,除D11S4463和D19S433为高鉴别能力的基因座外,其他基因座均属于中等鉴别能力基因座。综上所述,D19S433等21个非CODIS基因座在甘肃甘南藏族自治州藏族人群中具有良好的遗传多态性,可作为法医学亲权鉴定和个人识别中单亲或出现突变可能的案件的补充。
表1 甘南藏族人群21个常染色体非CODIS基因座等位基因频率分布(n=515)
续表1
表2 甘南藏族人群21个常染色体非CODIS基因座的群体遗传学参数(n=515)
续表2
[1]Kalinowski ST.HW-QUICKCHECK:an easy-to-use computer program for checking genotypes for agreement with Hardy-Weinberg expectations[J].Molecular Ecology Notes,2006,6(4):974-979.
[2]Gill P,Urquhart A,Millican E,et al.A new method of STR interpretation using inferential logic--development of a criminal intelligence database[J].Int J Legal Med,1996,109(1):14-22.
(本文编辑:李成涛)
书讯
《法医病理数字化新技术理论与实践》由司法部司法鉴定科学技术研究所刘宁国与陈忆九主编,于2015年1月出版。该书以当前飞速发展的数字化技术为基础,结合作者多年从事法医病理学鉴定的经验和近年来开展的法医虚拟解剖、计算机生物力学仿真、数字化快速三维现场图、法医骨学专家系统和全息数字病理切片等领域的研究和鉴定工作,并吸纳了国内外最新科研成果和工作实践的报道编写而成。本书分为六章。每章既有数字化法医病理技术手段的最新概况,也有该技术手段所依据的基本理论和方法,同时还对相应技术在法医学各类鉴定的应用进行分别归纳、总结,涵盖了法医病理数字化技术的相关领域基础理论、应用实践和最新研究成果,可供从事法医学鉴定和科学研究的公安、检察、法院、高校和社会鉴定机构等工作人员和学者阅读参考,也可为司法审判人员、大中专院校相关专业学生以及法律工作者提供帮助。
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B
10.3969/j.issn.1004-5619.2016.06.019
1004-5619(2016)06-0461-03
2015-05-26)
甘肃省自然科学基金资助项目(145RJZA038)
臧丽丽(1982—),女,主检法医师,主要从事法医DNA检验鉴定与研究;E-mail:124750200@qq.com
陶晓岚,女,主任法医师,教授,主要从事法医遗传学检案及研究;E-mail:taoxll1025@126.com