微小核糖核酸对肾疾病的影响*
2016-11-19王雅楠嵇雅茹张学明
王雅楠,虞 飞,嵇雅茹,张学明
(包头医学院,内蒙古包头 014040)
微小核糖核酸对肾疾病的影响*
王雅楠,虞 飞,嵇雅茹,张学明
(包头医学院,内蒙古包头 014040)
微小核糖核酸(micro ribonucleic acid,miRNA)是一类保守的,内源性具有调控功能的非编码单链小分子核糖核酸(ribonucleic acid,RNA),长度约20~25个核苷酸(nuleotide, nt),通过介导靶mRNA降解或抑制靶基因翻译来调节靶基因的表达。研究证明,miRNAs参与细胞增殖与凋亡,造血和血管生成等各种生命过程的调节,但目前只有一小部分miRNAs生物学功能得到阐明。近期研究发现,miRNA能够调控多个基因位点,从而miRNA的异常表达将影响整个基因网络,这有助于对各种肾疾病的研究。因此,研究miRNA与肾病的关系,窥探肾病的发病机制,将为临床上预防、诊断、治疗肾疾病提供新的理论依据。
1 miRNAs的发现与产生
Lee[1]等于1993年在线虫中发现了调控线虫发育的miRNA lin-4,这是个具有里程碑意义的发现。随后Calin等[2]发现在B细胞白血病患者中miRNA-15和-16显著下调,miRNA表达量和癌症之间存在联系。这个发现使miRNAs迅速成为生命科学领域的研究热点。
miRNA是miRNA基因经RNA聚合酶Ⅱ转录为初级miRNA(pri-miRNA)后加工而成的(图1);在细胞核中,pri-miRNA由RNase ⅢDrosha和结合蛋白DGCR8形成的复合体加工成含有茎环结构的pre-miRNA;pre-miRNA被运输到细胞质中,经RNase Ⅲ Dicer加工形成长度约为22 nt的双链miRNA;双链miRNA解链,一条链与Argonaute家族蛋白形成miRNA 诱导的沉默复合体(miRISCs);miRISCs与靶位点互补结合抑制基因转录使其mRNA降解或抑制蛋白翻译,从而调控基因的表达。植物miRNA能与靶mRNA开放阅读框(ORF)完全互补结合;而对于动物miRNA,通常在5’端含有6-7 nt的种子(seed)序列,通过种子序列,miRNA与靶mRNA 3’-非翻译区(3'-untranslated region,3’-UTR)互补结合。
2 miRNA基因靶点预测
miRNA可能有多个靶基因几个miRNAs也可以调节同一个基因,从而形成了复杂的调节网络,给miRNA的研究带来了一定的困难。目前用来筛选miRNA的靶基因的方法有传统生物信息学和实验两种方法。已经建立好的生物信息工具包括:TargetScan(www.targetscan.org),miRANDA(www.microrna.org)andPictar(www.pictar.mdc-berlin.de)等,利用miRNA的5’端“种子序列”预测靶位点。
注:该图来源于文献Badal SS,Danesh FR.MicroRNAs and their applications in kidney diseases[J].Pediatr Nephrol,2015,30(5):727-40 实验方法不仅可以筛选miRNA的靶基因也可以验证miRNA的靶基因。可分为两类:一类是以miRNA:mRNA的直接作用为基础,其准确率高,主要有荧光素酶报告基因,RNA与蛋白质免疫共沉淀技术等;另一类是以miRNA:mRNA相互作用为基础,其准确率较低,是通过转染miRNA inhibitor/mimic来建立miRNA的差异表达[3]。
3 miRNA与肾疾病
miRNA与靶基因特异性的结合从而调控与肾功能有关的特异性蛋白。miRNA的上调或下调与急性和慢性肾损伤息息相关[4]。有研究敲除了小鼠肾小管Dicer酶导致了严重的肾小球和肾小管囊肿,发现miR-200家族基因明显下调[5]。其中miR-200b/c和miR-459调控多囊肾中PKD1基因的表达。条件性Dicer酶等位基因敲除的方法可用于肾的研究。因此,miRNA在肾的正常生理和病理生理过程中发挥着至关重要的作用。
3.1 miRNA与糖尿病肾病 糖尿病肾病是糖尿病的长期并发症,是终末期肾疾病的一个危险因素。据报道白细胞介素-6受体参与了糖尿病肾病的发展,miRNA在调节基因的表达上扮演重要角色。为确定在糖尿病肾病中miRNA表达量是否有变化,LI C等[6]收集糖尿病肾病患者的肾组织与正常人相比较,发现miR-125a在患者肾组织中表达量明显减小,研究证实rs12976445基因的3′UTR是miR-125a的直接靶基因结合位点。研究者得出,miR-125a可以抑制基因rs12976445表达,miR-29a水平下降与肾小管间质纤维化有相关性。在肾组织中,与其他器官相互比较,除了表达一些共有的miRNA之外还会表达一些特异的miRNA。Natarajan[7]调研组在高糖诱导系膜细胞和1型2型糖尿病小鼠模型中发现,TGF-β抑制miR-192的表达,miR-192抑制SIP1的表达促进系膜细胞的增殖,导致肾小球系膜细胞的增生和肥大。
miR-21在各组织中广泛表达,参与调控多种疾病。有研究报道,miR-21也参与了糖尿病肾病的发生发展,在糖尿病肾病患者中miR-21的上调抑制了PTEN的表达从而促进了肾纤维化[8]。miR-21的上调与TGF-β1信号通路的激活有关。TGF-β1信号通路中的Smad7上调了miR-21的表达;miR-21的抑制阻断TGF-β1通路诱导纤维化。也有研究发现[9],TGF-β1信号通路中的Smad3通过结合miR-21启动子区来诱导miR-21的表达,而Smad2却无此效应。在糖尿病肾病中miRNAs表达增加的可以通过抑制miRNA恢复靶基因的正常调控;而miRNAs表达降低的可以通过插入目的片段miRNAs来建立基因的调控。miR-125a,miR-21,miR-192等可能是治疗糖尿病肾病以及其它肾疾病的新靶点。
3.2 miRNA与局灶性节段性肾小球硬化 局灶性节段性肾小球硬化(FSGS)是儿童和成人常见的原发性肾小球疾病。近期研究发现,miRNA与FSGS诊断和预后息息相关。FSGS患者尿液中的miR-196a,miR-30a-5p,和miR-49表达上调[10],与疾病的严重程度呈正相关。用TaqMan低密度芯片检测尿液miRNA的表达谱发现54种miRNAs,并且检测尿液中miRNA的水平,结果发现活动期FSGS者的miR-196a,miR-30a-5p和miR-49显著升高,明显高于缓解期FSGS患儿;经过类固醇治疗,激素耐药患儿miRNA表达没显著变化,而激素治疗有效的FSGS患儿miRNA表达水平下降,miR-30a-5p水平可以预测FSGS患儿对激素治疗的效果情况。用qRT-PCR检测14例FSGS患者和15例正常人肾组织miR-155、miR-194和miR-215[11],FSGS患者3种miRNA水平均显著高于正常组,miRNA水平与患者蛋白尿水平呈正相关。cai等[12]发现,miR-192和miR-205在FGSG患儿中表达明显升高高于MND患儿,并且miR-192水平与FSGS患儿间质纤维化水平存在相关性,并推测,这两种miRNA在FSGS肾病的病理生理改变中起到非常关键的作用。
3.3 miRNA与多囊肾病 多囊肾(PKD)是一个单基因肾病,可分为常染色体显性PKD(ADPKD)和常染色体隐性PKD(ARPKD)。由特定基因突变引起,包括PKD1与PKD2的突变。miRNA参细胞增殖、凋亡和致癌等生理过程,它在多囊肾病中促进囊肿上皮细胞增殖分泌流体,导致囊肿的膨胀。Patel等[13]人在早期通过敲除PKD小鼠模型Dicer酶发现肾内整个miR-17-92家族(MIR-17,-18a,-19a,-19b,-20A,-92a)发生上调。miR-17-92家族可调节PKD基因的表达,而PKD基因在肾上皮细胞过表达可产生囊性结构,说明miR-17-92能够通过调控PKD基因的表达来抑制囊肿的发展[14],所以miR-17-92家族靶基因消除会抑制孢囊发展,该家族可作为治疗PKD的潜在作用靶点。研究发现[15]miR-199A-5P与PKD相关,多囊肾病患者肾组织中miR-199A-5P显著上调且PDK模型大鼠和细胞系中的miR-199A-5P也上调,与临床和病理程度呈正相关。CDKN1C/ p57为miR-199A-5P的靶基因,miR-199A-5P可以在转录后水平抑制CDKN1C/ p57表达。所以,下调miR-199A-5P可以抑制细胞增殖从而减缓囊泡的形成。
综上所述,多种miRNAs在肾功能和肾相关疾病中发挥重要调控作用,有关肾疾病的研究在较短的时间取得了瞩目的成就。miRNA通过抑制靶基因进而发挥其生物学效应,因此miRNA靶基因的鉴定对于研究肾疾病的发病机制具有重要意义。miRNA在血清和尿液等体液中性质稳定,可能会成为肾病的新的潜在生物标志物。然而,miRNA与各种通路和调控机制相关,致使病理机制较为复杂。由于复杂的病理机制、组织特异性等致使将miRNA应用到临床面临很大的挑战。因此,需要我们进一步来探究机制和寻找潜在治疗靶点。
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国家自然科学基金项目(31060304); 内蒙古自治区高等学校科学研究项目(项目编号:NJZY16215);包头医学院博士启动基金项目(BSJJ201602)
张学明
2016-03-22)