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常见氨基酸结构的记忆方法

2016-04-10徐立峰

生物学教学 2016年2期
关键词:丝氨酸丙氨酸天冬氨酸

徐立峰

(山东协和学院医学院 济南 250000)

氨基酸代谢是生物化学中的重点内容,而掌握20种常见氨基酸的结构则是学习氨基酸代谢的基础。为快速掌握常见氨基酸的结构,总结出如下多种记忆方法。

1 学名记忆法

氨基酸的学名包含氨基酸分子结构的部分信息。因而根据羧酸的命名规则,写出氨基酸的学名,有助于记忆氨基酸的结构。例如,甘氨酸的学名是氨基乙酸;赖氨酸的学名是2,6-二氨基己酸。

2 俗名助记法

α-氨基酸常用其俗名,可根据其俗名所蕴含的信息来帮助记忆一些氨基酸的结构。例如,丙氨酸表明是含有3个碳原子的氨基酸;甲硫氨酸含有甲基和硫原子;苯丙氨酸可看做由苯和丙氨酸组成;天冬酰胺、谷氨酰胺则分别是由天冬氨酸、谷氨酸酰胺化而来,都含有酰胺基;异亮氨酸则是亮氨酸的同分异构体;半胱氨酸则是胱氨酸的一半。

3 结构分析法

在掌握氨基酸结构通式的基础上,分析R基团的结构。甘氨酸的R基团是1个氢原子;丙氨酸的R基团是甲基;缬氨酸的R基团是异丙基;丝氨酸的R基团是羟甲基或甲醇;苏氨酸的R基团是乙醇;天冬氨酸的R基团是乙酸;谷氨酸的R基团是丙酸;赖氨酸的R基团是丁胺;精氨酸的R基团由3个亚甲基和1个胍基组成。

4 衍生法

多数氨基酸的结构可看作是由丙氨酸衍生而来。例如,给丙氨酸的甲基加上1个羟基是丝氨酸;加上1个巯基是半胱氨酸;加上2个甲基是缬氨酸;加上1个异丙基是亮氨酸;加上1个羧基是天冬氨酸;加上1个乙酸是谷氨酸;加上1个丙胺是赖氨酸;加上1个苯环是苯丙氨酸;加上1个苯酚是酪氨酸;加上1个吲哚是色氨酸;加上1个咪唑是组氨酸。

5 代谢助记法

根据氨基酸在体内合成与分解的过程来帮助记忆。例如,苯丙氨酸在羟化酶的催化下,在苯环上与丙氨酸相对的碳原子上加1个氧原子,转变为酪氨酸,再进一步分解;大多数植物和微生物的半胱氨酸是由丝氨酸的羟基被巯基取代而成[1],也可看做是把丝氨酸的羟基氧被同族元素硫替代而成;甘氨酸是丝氨酸在转羟甲基酶的作用下,把羟甲基中的碳原子转移给四氢叶酸而生成;精氨酸除去胍基后剩余部分来自谷氨酸,所以精氨酸除去胍基后剩余部分的碳骨架与谷氨酸的相同。

6 特点助记法

根据氨基酸的特点来帮助记忆其结构。例如,甘氨酸是最简单的氨基酸,它的R基团仅是1个氢原子,因而甘氨酸也无旋光异构现象;脯氨酸是α-亚氨基酸,与α-碳原子相连的是亚氨基,而且脯氨酸属于杂环氨基酸,分子中具有1个杂环;天冬氨酸、谷氨酸则是酸性氨基酸,它们的R基团中具有显酸性的羧基;赖氨酸、精氨酸、组氨酸则是碱性氨基酸,它们的R基团中具有显碱性的基团,如氨基、咪唑基、胍基。

7 分类记忆法

把结构上具有共同特点的氨基酸归到一类,有助于记忆氨基酸的结构。例如,丝氨酸、苏氨酸都含有羟基,是羟基氨基酸;苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸都具有苯环,是芳香族氨基酸;半胱氨酸、甲硫氨酸都含有硫原子,是含硫氨基酸;组氨酸、脯氨酸都具有杂环,是杂环氨基酸;缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸的R基团具有支链,是支链氨基酸,支链氨基酸都是必需氨基酸。

8 功能助记法

通过了解氨基酸及其衍生物的功能来加深对氨基酸的印象。例如,甘氨酸参与嘌呤碱基、谷胱甘肽、肌酸、卟啉以及结合型胆汁酸的合成,在胶原蛋白(动物体内最丰富的蛋白质)中的含量很高,由于甘氨酸的R基团仅是1个氢原子,因而对蛋白质的二级结构β-转角的形成起着至关重要的作用;半胱氨酸参与蛋白质中二硫键的形成,对维持蛋白质的结构起着重要作用,半胱氨酸经氧化脱羧产生的牛磺酸参与结合型胆汁酸的合成;甲硫氨酸是合成蛋白质的起始氨基酸,也是甲基供体,是植物激素乙烯合成的唯一前体[2];苯丙氨酸的代谢出现异常,会导致苯丙酮尿症;酪氨酸可转变为儿茶酚胺、甲状腺激素、黑色素,若缺乏会导致白化病;色氨酸在植物体内能转化为植物生长素吲哚乙酸,色氨酸经羟基化和脱羧作用形成的5-羟色胺是脑组织中的抑制性神经递质;精氨酸是尿素形成的中间产物,其末端的脒基参与形成尿素,也能形成NO信号分子;天冬氨酸参与嘧啶碱基的形成;谷氨酸是叶酸、谷胱甘肽的组成成分,其钠盐则是味精的有效成分,其脱羧基产生的γ-氨基丁酸是重要的中枢神经系统抑制性神经递质;谷氨酰胺是被发现的第一个氨基酸,它是运输氨的主要形式,也参与碱基的合成。

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