全基因组测序揭示水源性土拉菌病

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全基因组测序揭示水源性土拉菌病

KARADENIZLI及其同事采用全基因组测序进行土耳其境内（锡瓦斯，昆仑以及科贾埃利省）口咽部土拉菌病暴发流行的研究。这次暴发流行波及178人，经典的流行病学已经提示饮用水污染为暴发流行的可能原因，然而缺乏分子层面的证实。

33例首发病例中12例的咽拭子培养分离到土拉杆菌亚种holarctica，同时从暴发流行地区未经消毒的饮用水水源收集的140份水样中有5份分离出该亚种。全基因组测序显示有6株分离株属于B.12型。土拉菌遗传变异非常少，因此传统的分子生物学方法不能鉴别菌株的型别，但是全基因组测序可以解决该问题。全基因组测序结果显示所检测的菌株有2个新基因簇，与已知的土拉杆菌基因组序列至少有20和26 个碱基多态性的差异。

研究者指出，该病流行区域的水库入水口都暴露在外，输送饮用水的管道也无覆盖。因此，水源易受污染。

经皮下注射或吸入＜10个细菌，或口服要求＞106个细菌可导致感染，提示本次暴发土拉菌病的主要原因是流行地区的水源被高度污染。美国，每年约有100例土拉菌病，多数为散发病例，但并无饮用水被污染导致发病的证据。

研究者指出将土拉菌蓄意污染饮用水水源具有可能作为生物武器的风险。

In the literature. Waterborne tularemia：whole-genome sequencing nails it. Clin Infect Dis， 2015：61（1October）.

高 琼摘译 黄海辉审校

Waterborne tularemia： whole-genome sequencing nails it

2015-12-02