烟草电压依赖阴离子通道NtVDAC1.1的电子克隆及生物信息学分析

武兆云　张小全　杨铁钊　王红

摘要：为研究电压依赖阴离子通道（VDAC）基因在烟草根系分泌有机酸的作用，进而为了解该基因的功能和应用提供基础，以拟南芥AtVDAC1（NM_110994）为搜索序列，应用电子克隆技术得到一条烟草VDAC基因全长cDNA，命名为AtVDAC1.1。生物信息学分析表明该基因全长为1018 bp，有着完整的开放阅读框，编码276个氨基酸。进化关系及同源性分析表明，NtVDAc1.1与其他物种的VDAc有着较高的相似性，其中与茄科植物马铃薯三个膜孔蛋白有着很高的一致性（0.768～0.902）。功能分析显示，NtVDAC1.1为膜孔蛋白，参与了阴离子的转运、阴离子转运调节和跨膜运输。二级和四级结构分析均表明，NtVDAC1.1含有a-螺旋和B-折叠。氨基酸位点分析表明，该蛋白具有多种类型的修饰位点，其中的磷酸化位点说明该基因与信号转导有关，对阴离子通道活性具有调节作用。

关键词：烟草；电压依赖阴离子通道；基因克隆；生物信息学分析

中图分类号：S572：Q781 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2015）11-0005-07endprint