遗传学

遗传学

封面介绍：编编码T细胞受体（T cell receptor，TCR）α、β、γ和δ链的基因定位于不同的染色体，分别由多个不同的高度同源的基因家族组成.鸡的细菌人工染色体（BAC）文库是用BAC载体构建的含有鸡的全部基因随机片段的重组DNA克隆群体，是进行鸡物理图谱构建、染色体筛查、基因筛选和基因图位克隆等生物学研究的基础.开展鸡TCRγ链基因位点对应的BAC克隆的重新测序和组装，可为进一步研究鸡TCRβ基因位点和TCRα/δ基因位点的基因组序列积累经验.设计说明：图中卡通鸡的两只脚踩在DNA双螺旋结构上，双翅形象化为手型，左手托起右上角的TCR结构示意图，右手拇指竖起指向文中获得的鸡TCRγ基因位点的组装草图，口中高呼“TCRγ”.图案不仅体现了实验的研究重点，更寓意着利用靶向BAC文库的TCR区段测序策略获得鸡TCR基因位点的完整序列的期望.

鸡T细胞受体γ链基因位点重新测序和组装

马俊平，杨犀，律娜，等

动物T细胞受体（T cell receptor，TCR）基因由多个不同的高度同源的基因家族组成，通过全基因组测序很难获得准确的基因序列和排列位置.文章通过在NCBI中发布的鸡TCR的γ链（TCRγ或TRG）基因片段序列定位了鸡TRG基因所在区域，并确定了与鸡TRG基因位点对应的细菌人工染色体（BAC）克隆（CH261-174P24）.对该克隆进行高通量的重新测序和组装后，得到含有10个scaffolds的基因组草图，较完整地覆盖了鸡TRG基因位点及两侧区域.通过PCR扩增和测序证明了scaffold内部结构的正确性，校正了鸡参考基因组TRG基因位点一个可变基因和一个缺口序列（gap）附近各一处错误序列，以及可变基因区多处序列错误.文章通过校正鸡参考基因组TRG基因位点的序列，为鸡TRA/D和TRB基因位点的基因组序列分析提供了新方法.

鸡；T细胞受体（TCR）；伽马链（TCRγ，或TRG）基因位点；测序；组装

来源出版物：遗传，2015，37（6）： 568-574联系邮箱：朱宝利，zhubaoli@im.ac.cn