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采用X射线衍射解析人鸟嘌呤核苷酸解离刺激因子RalGDSRas结合结构域的空间结构

2015-06-18黄雪英雷明沈阳张巍刘艳丽刘珂赵浩斌祁超

分析化学 2015年6期
关键词:氢键结构域核苷酸

黄雪英 雷明 沈阳 张巍 刘艳丽 刘珂 赵浩斌 祁超

摘 要 Ras结合结构域(RBD)是鸟嘌呤核苷酸解离刺激因子(RalGDS)家族成员C端的高保守区,通过它连接Ras和Ras相关蛋白。利用Red Wings和SGC1 screens相关的悬滴法设盘结晶,按体积比1∶1加蛋白液到含1∶100胞内蛋白酶GluC(w/w)的结晶溶液(2 mol/L (NH4)2SO4, 0.2 mol/L NaAc, 0.1 mol/L HEPES, 5% MPD, pH 7.5)中,晶体3天长成可组装大小。利用X射线晶体衍射技术解析了人RalGDS的Ras结合域(RalGDSRBD)的晶体结构,对比鼠和人RalGDSRBD,主要是Ras结合区的C端不同。人RalGDSRBD通过Glu838和Glu840在RalGDS和Ras蛋白间形成氢键, 而在同一位点,鼠RalGDSRBD通过Asp820和Asp822形成氢键。人RalGDSRBD结构中含ββαββαβ型三维结构的泛素样构象, 一个单体的C端残基与相邻单体的β折叠形成平行βββββ结构。

关键词 鸟嘌呤核苷酸解离刺激因子(RalGDS); Ras结合结构域(RBD); Ras蛋白endprint

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