中国热带农业科学院热带生物技术研究所在高通量简化测序技术研究领域获得突破

“AFSM技术，是目前为止全世界唯一的可以在全基因组高通量检测SNVs的同时检测甲基化位点的方法，具有其它简化测序无法比拟的优势。”AFSM技术发明人、热带生物技术研究所（简称生物所）青年科学家夏志强博士告诉记者。

近日，生物所在高通量简化测序技术研究领域获得突破，种质与基因资源研究室夏志强博士发明了AFSM技术，能够提供世界领先的简化测序和甲基化解决方案，相关成果已发表于《Nature》旗下子刊Scientific Reports（Xia et al.， 2015; IF： 5.578），并申请了国家发明专利（专利号：201410154134.9）。AFSM技术通过对酶切获得的AFSM-tag进行高通量测序，能够降低基因组的复杂度，操作简便，同时不受参考基因组的限制，可快速鉴定出高密度的SNVs与甲基化，用于遗传连锁图谱的快速构建、QTL定位、自然群体演化与结构分析、全基因组关联GWAS分析和快速进行群体表观遗传学甲基化研究。

相比世界范围内其它高通量简化测序技术，它具备五大优势：一是适用对象广泛，其研究对象有无参考基因组均能适用;二是精确度高，每个Tag 的平均覆盖深度至少达到5倍，保证分子标记的高准确性;三是性价比高，它基于简化后的基因组DNA测序，测序和甲基化检测成本均较低，特别适合大样本量研究;四是快速高效，只需3-4个月即可完成大样本的群体研究;五是甲基化检测优势，能够在全基因组水平大规模高通量检测甲基化。

（摘自中国热带农业科学院院网，2015-09-30）