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基于共词分析的国外转化医学研究热点*

2015-03-13赵颖颖赵玉虹

医学信息学杂志 2015年2期
关键词:共词主题词干细胞

赵颖颖 张 晗 赵玉虹

(中国医科大学图书馆 沈阳 110013) (中国医科大学医学信息系 沈阳 110013)



基于共词分析的国外转化医学研究热点*

赵颖颖 张 晗 赵玉虹

(中国医科大学图书馆 沈阳 110013) (中国医科大学医学信息系 沈阳 110013)

对PubMed数据库2012-2014年发表的转化医学研究文献进行分析,取频次大于等于18的作为高频主题词,构造高频主题词共现矩阵,用Matlab转化成相异矩阵,利用SPSS对相异矩阵进行系统聚类分析,总结当前转化医学研究热点并对转化医学研究提出一些建议。

转化医学研究;共词分析;聚类分析

1 引言

近年来,为了解决基础和临床分离的困境,提高生物医学科技投资效益,促进向生物医学研究为人类健康服务的原始目的回归,转化医学的概念被提出。转化医学(Translational Medicine)作为一种新的研究模式,是连接基础医学和临床、护理、预防医学的桥梁。转化医学的主要目的是要打破基础医学与药物研发、临床及公共卫生之间的固有屏障,在其间建立起直接关联,从实验室到临床,把基础研究获得的知识成果快速转化为临床和公共卫生方面的防治新方法。转化医学是从试验台到临床的一个连续、双向、开放的研究过程[1]。1996年Geraghty[2]首次提出Translational Medicine概念,2012年Translational Medical Research作为主题词加入MeSH词表。共词分析法是文献研究的重要方法之一,最早在20世纪70年代中后期由法国文献计量学家提出,其思想来源于文献计量学的引文耦合与共被引概念。共词分析法主要是对同一篇文献中词汇对或名词短语共同出现的次数进行统计,以此为基础对这些词进行分层聚类,揭示出这些词之间的亲疏关系,进而分析它们所代表的学科和主题的结构变化。关于转化医学研究已发表了大量外文文献,本文应用共词分析方法,分析转化医学研究的最新文献,总结当前主题研究热点,为广大研究者开展相关研究提供参考。

2 资料与方法

以“Translational Medical Research”为主要主题词对PubMed数据库进行检索,下载2012-2014年发

表1 2012-2014年转化医学研究的高频主题词

续表1

表2 转化医学研究高频主题词的共现矩阵(局部)

表3 转化医学研究高频主题词的相异矩阵(局部)

3 结果与分析

3.1 聚类图

用SPSS进行系统聚类分析,得到2012-2014年转化医学研究热点的聚类树图,见图1。从图中可以看出,当前转化医学研究热点主要集中在以下6个方面。

图1 2012-2014年转化医学研究热点的聚类树图

3.2 学科间的合作

包括1,4,6,22,23,30,31,34主题词。“儿科协作改进网络的背景和概述”中提到,儿科协作改进网络可以减小质量差距,促使病人和照顾者共同学习,实验室加快将研究转化为实践和新知识的发现,使儿童保健结果得到改善[4]。

3.3 干细胞移植与再生医学、社区参与研究

包括13,15,16,18,28,29,37,41主题词。再生医学是一门研究组织器官受损后修复和再生的科学。作为再生医学基础的干细胞研究涉及健康科学的许多领域。“转化干细胞疗法:同伴动物在再生医学中的作用”概述了大型动物兽医模型在推进干细胞疗法对人类和兽医临床应用的贡献[5]。“将干细胞疗法转化到临床”提到,在神经科学领域,将干细胞疗法转化到临床上处在起步阶段,早期干细胞临床试验的成功可能会导致其他的并发症。识别介导干细胞治疗效果的分子机制,可能会给提高其疗效带来机会[6]。

3.4 肿瘤及抗肿瘤药物的研究、动物疾病模型、个性化医学

包括2,5,12,17,19,27主题词。“癌症患者疼痛和镇痛的转化进展”概述了相关的临床研究和科学现状,对癌症患者疼痛机制和优化镇痛的多途径方法提供一个更好的认识[7]。“肿瘤的转化研究:新药需要其他的体外临床前测试方法”概述了目前的肿瘤体外模型,介绍了特异性、抗转移治疗性药物临床前开发的新理论[8]。大鼠、小鼠、狗和猴子等是常用的动物模型。“绒猴:一个人类生物学和疾病的多用途的临床前转化模型”强调普通绒猴,小的非人类灵长类动物(NHP),可以作为生物医学和临床前转化研究的有用模型[9]。个体化医学是基于患者遗传和环境的个体差异,为实现最优疾病管理的临床、治疗和诊断方法。“药物基因组学和个体化医学:将科学转化为实践”提出,药物基因组学研究在本质上是可以转化的,范围从基因型-表型关系的发现到能为临床提供证据的临床试验。药物基因组学进展在个体患者临床应用是可能的[10]。

3.5 卒中、神经科学

包括11,25,32,33,39,40主题词。卒中出现34次,“缺血性卒中的干细胞疗法:临床前研究向临床治疗的转化”概述了干细胞各种类型的潜能,从胚胎到成人到诱导的多能干细胞,在治疗卒中时,强调从正在进行的临床试验获得新证据,讨论与转化干细胞技术到临床治疗卒中相关的问题[11]。

3.6 循证医学、临床试验

包括3,8,9,10,14,20,21,36主题词。“循证公共卫生的转化研究:关键概念和未来方向”定义了公共卫生转化的范围,概述了4个相关但是概念上不同的支持循证实践的转化过程。即审查证据到新设置的可转移性、转化研究、知识转化和知识转化研究。一个集成的框架说明了它们之间的关系,提出了进一步发展的优先领域和实证研究[12]。

3.7 药物发现、奖赏和奖品

包括7,24,26,35,38主题词。“药物设计和发现:转化生物医学科学在不同国家间不同”一文中,为了鉴别在药物设计发现方面成功、优越、失败的国家,对1991-2010年间批准的全部新药,做了一个全面调查。基于分析,设计了预测算法来确定哪个国家在贡献有效新疗法需求时是成功的[13]。

4 结语

近年转化医学迅速发展,发表了大量文献,有很多成功案例,但临床实践中仍有许多疾病和难关需要解决。笔者对转化医学研究提出一些建议:(1)正确处理基础医学与临床医学的关系。每年有大量的研究性论文发表,但绝大多数论文使用的是小鼠、狗等动物模型,进入临床前研究的论文很少。应该重视以临床研究为核心的基础研究,有目的地进行研究,将基础研究成果应用到临床实践。(2)建立转化医学研究平台。建立专门的转化平台,将大学、研究所、医院、企业联系起来。通过情报学方法,检索相关知识,加工组织在一起,构建各种专题数据库,包括专家库、技术需要库、科技成果库、蛋白库等,以便更好地为基础、临床等学科服务。(3)培养高水准的转化医学人才。提高转化医学人才的临床知识、基础理论知识,培养复合型人才。将基础研究成果转化成临床可用的诊疗方法,减少患者痛苦,最终使患者受益。(4)加强学科间的合作。转化医学涉及许多学科,如基础医学、预防医学、临床医学和医学信息学等,应该加强各个学科间的合作,及时就需要解决的问题进行沟通,使转化医学顺利进行。

1 董尔丹,胡海,洪微. 浅析转化医学与医学实践[J]. 科学通报,2013,(1):53-62.

2 Geraghty J. Adenomatous Polyposis Coli and Translational Medicine[J]. Lancet, 1996,348(9025):422.

3 崔雷,刘伟,闫雷,等. 文献数据库中书目信息共现挖掘系统的开发[J]. 现代图书情报技术,2008,(8):70-75.

4 Lannon CM, Peterson LE. Pediatric Collaborative Improvement Networks:background and overview[J]. Pediatrics, 2013,131(Suppl 4):189-195.

5 Volk SW, Theoret C. Translating Stem Cell Therapies: the role of ompanion animals in regenerative medicine[J]. Wound Repair Regen, 2013,21(3):382-394.

6 Miller RH, Bai L. Translating Stem Cell Therapies to the Clinic[J]. Neurosci Lett,2012,519(2):87-92.

7 Maani CV, Shah MA, Hansen JJ, et al. Translational Advances in Pain and Anesthesia for Cancer Patients[J]. J Surg Oncol, 2012,105(5):488-493.

8 Drell TL, Zanker KS, Entschladen F. Translational Research in Oncology: the need of additional in vitro preclinical testing methods for new drugs[J]. Curr Pharm Des, 2012,18(23):3416-3420.

9 Hart BA, Abbott DH, Nakamura K, et al. The Marmoset Monkey: a multi-purpose preclinical and translational model of human biology and disease[J]. Drug Discov Today, 2012,17(21-22):1160-1165.

10 Crews KR, Hicks JK, Pui CH, et al. Pharmacogenomics and Individualized Medicine: translating science into practice[J]. Clin Pharmacol Ther, 2012,92(4):467-475.

11 Balami JS, Fricker RA, Chen R. Stem Cell Therapy for Ischaemic Stroke: translation from preclinical studies to clinical treatment[J]. CNS Neurol Disord Drug Targets, 2013, 12(2):209-219.

12 Rychetnik L, Bauman A, Laws R, et al. Translating Research for Evidence-based Public Health: key concepts and future directions[J]. J Epidemiol Community Health, 2012,66(12):1187-1192.

13 Weaver IN, Weaver DF. Drug Design and Discovery: translational biomedical science varies among countries[J]. Clin Transl Sci, 2013,6(5):409-413.

Hot Points of Translational Medical Research Abroad Based on Co-word Analysis Method

ZHAOYing-ying,

LibraryofChinaMedicalUniversity,Shenyang110013,China;ZHANGHan,ZHAOYu-hong,DepartmentofMedicalInformatics,ChinaMedicalUniversity,Shenyang110013,China

The paper retrieves PubMed database to download papers related to translational medicine research between 2012 and 2014, selects the subject heading (Mesh) terms of high frequency(≥18) to form co-word matrix, transforms into dissimilarity matrix, summarizes the hot points of translational medicine research and puts forward advices.

Translational medical research; Co-word analysis; Cluster analysis

2014-09-11

赵颖颖,助理馆员,发表论文1篇;通讯作者:赵玉虹,教授,博士生导师。

辽宁省科学技术计划项目“肝炎、结核等重大疾病临床研究平台建设”子项目“构建辽宁(本溪)生物医药科技产业基地的信息化服务与成果转化创新平台”(项目编号:2013225079)。

R-058

A 〔DOI〕10.3969/j.issn.1673-6036.2015.02.012

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