阿胶中马和驴成分的实时荧光PCR检测
2014-03-09吴亚君刘鸣畅韩建勋李新实
吴亚君,王 斌,刘鸣畅,韩建勋,李新实,陈 颖
阿胶中马和驴成分的实时荧光PCR检测
吴亚君,王 斌,刘鸣畅,韩建勋,李新实,陈 颖*
(中国检验检疫科学研究院农产品安全研究中心,北京 100123)
建立阿胶中马和驴成分高特异、高灵敏的实时荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测方法。选择马和驴线粒体基因tRNA-Thr及D-loop区为靶序列,设计合成特异引物,通过普通PCR和实时荧光PCR检测,结果表明,这两对引物能够准确检测阿胶或动物胶中马和驴成分。
阿胶;马;驴;实时荧光PCR
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品
马血清、驴血清来自山东出入境检验检疫局;骆驼肉、猪肉、牛肉、貂肉、狗肉、鸡肉、鹿茸、猫肉、狍子肉、鼠肉、兔肉、鸭肉、羊肉、鱼肉、大豆、大米、玉米、黄瓜、胡萝卜为本实验室收集样品。正品阿胶块、未知来源的阿胶样品(1~6)。
1.1.2 试剂
DNeasy Mericon Food Kit(50)试剂盒(货号:69514)德国Qiagen公司;Wizard Magnetic DNA Purification System for Food试剂盒(货号:FF3751) 美国Promega公司;Nucleospin Food试剂盒(货号:74094550) 德国MN公司;十六烷基三甲基溴化铵(cetyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)提取液(54.9 mmol/L CTAB、1.4 mol/L NaCl、0.1 mol/L Tris-HCl、0.02 mol/L乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA),pH 8.0)、CTAB沉淀液(13.7 mmol/L CTAB、40 mmol/L NaCl)、无水乙醇、PCR预混液(TaqManGene Expression Master Mix,货号:4369016) 美国ABI公司;蛋白酶K(20 mg/mL,货号:P6556-100MG)美国Sigma公司;DNA 1000 LabChip(货号:5067-1504) 美国Agilent公司;灭菌水。
1.1.3 仪器与设备
Reriti 96Well Thermal Cycler PCR仪、7500 Real Time PCR System实时荧光PCR仪 美国ABI公司;2100 Bioanalyzer毛细管芯片电泳仪 美 国Agilent公司。
细胞按前述分组处理后,移除内培养基(用于后续LDH酶活性测定)并加入100 μL的MTT试剂(终质量浓度:0.5 mg/mL)继续培养24 h。培养结束后弃上清液,每孔加入DMSO (100 μL)避光振荡30 min,测定OD490 nm后按公式:细胞生存率(%)=OD样品组/OD正常组×100来计算细胞生存率。LDH脱氢酶水平采用比色试剂盒按照说明书操作要求进行测定。
1.2 方法
1.2.1 D NA提取
血清、肌肉、植物样品采用CTAB法[10-11]:取1 g样品粉末到50 mL离心管中,加入5 mL CTAB提取缓冲液和20 μL蛋白酶K,涡旋混匀65 ℃孵育过夜,将样品管12 000×g离心10 min。吸取1 mL上清液到新的2 mL离心管中,加入700 μL三氯甲烷振荡混匀,14 500×g离心10 min,吸取600 μL上清到新的2 mL离心管中,加入1 200 μL CTAB沉淀缓冲液,混匀室温孵育60 min,14 500×g离心10 min弃去水相,加入350 μL 1.2 mol/L NaCl溶液溶解沉淀,加入350 μL三氯甲烷振荡混匀,14 500×g离心10 min,吸取200 μL上清液到新的1.5 mL离心管中,加入160 μL 异丙醇混匀后室温孵育20 min,14 500×g离心10 min,弃去水相,加入500 μL 70%乙醇混合冲洗沉淀,14 500×g离心10 min,弃去水相室温晾干,加入100 μL 0.1×TE缓冲液65 ℃、10 min溶解DNA。
阿胶样品采用试剂盒法,起始样品量200 mg,DNA溶于100 μL无菌双蒸水。
1.2.2 常规PCR
PCR反应体系:DNA模板5 μL;10×PCR反应缓冲液2.5 μL;dNTPs 2.0 μL;上下游引物(10 pmol/L)各0.5 μL;Taq酶1 U,用无菌水补至总体积为25 μL。
PCR扩增程序:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30s,60 ℃退火30s,72 ℃延伸1 min,35个循环;72 ℃延伸5 min。
1.2.3 毛细管芯片电泳
电泳操作按照DNA 1000 LabChip 试剂盒所提供的说明进行。凝胶-染料混合物的准备:将试剂盒中DNA Dye Concentrate及DNA Gel Matrix试剂室温放置30 min,涡旋振荡DNA Dye Concentrate试剂,取25 μL DNA Dye Concentrate至DNA Gel Matrix试剂中,混匀充分后,用离心过滤器过滤(1 500×g、10 min)。将凝胶-染料混合物注入分离芯片中,将5 μL Marker加入各个样品孔中。取上述PCR产物各1 μL分别加入12个样品孔中,将1 μL Ladder加入指定的Ladder孔中,最后将芯片涡旋混匀后放入毛细管芯片电泳仪中进行自动检测分析。
1.2.4 实时荧光PCR[6,12-13]
25 μL PCR体系:12.5 μL Master Mix、6.0 μL ddH2O、0.5 μL 10 μmol/L引物、0.5 μL 10 μmol/L探针、5 μL模板,引物探针序列见表1。
PCR程序:50 ℃去除RNA 2 min,95 ℃预变性10 min,95 ℃变性15 s,60 ℃退火1 min,50个循环。
表1 检测用引物和探针Table 1 Specific primers and probes of real-time PCR amplification
2 结果与分析
对马和驴线粒体基因组进行序列比对后挑选的靶序列(NC_001788.1、KC203030.1),为tRNA-thr和D-loop区,见图1。马和驴的探针长度为28 个碱基,其中8 个为差异碱基。正向引物23 个碱基,其中在5’端有1 个差异碱基,反向引物22 个碱基,靠近3’端有3 个差异碱基。
图1 马和驴线粒体靶序列比对结果Fig.1 Sequence alignment of mitochondrial target genes for horse and donkey
采用常规PCR法对马和驴等11种动物基因组的扩增结果见图2。两对引物对的PCR产物长度108 bp,与电泳结果一致。马特异性引物仅对马DNA有扩增,驴特异性引物仅对驴DNA有扩增,说明两对引物特异性良好。
图2 马(A)和驴(B)特异性引物常规PCR产物毛细管芯片电泳结果Fig.2 Microchip capillary electrophoresis by using horse and donkey specific primers for routine PCR amplification
增加探针后马和驴特异性体系的扩增结果见图3。实验对象包括马和驴等16 种动物以及5 种植物。其中马特异性体系仅对马DNA样本有扩增,驴特异性体系仅对驴DAN样本有扩增,扩增曲线呈典型S型,所有样本3 次平行实验重复良好。说明设计的马和驴特异性实时荧光PCR体系特异性良好。
图3 马和驴实时荧光PCR特异性结果Fig.3 Specificity for horse and donkey ingredients by real-time PCR
将马和驴DNA质量浓度分别调整至0.1 ng/øL后,按比例混合,使马和驴的体积百分比分别为100%、90%、50%、10%、1%、0.1%。混合DNA的实时荧光PCR结果见图4,马特异性体系的相对灵敏度达到0.1%,即500 pg模板DNA中检测到0.5 pg马DNA。驴特异性体系的相对灵敏度达到1%,即500 pg模板DNA中检测到5 pg驴DNA。
为了了解不同DNA提取方法对阿胶的适用性,分别采用DNeasy Mericon Food Kit(50)试剂盒、Wizard Magnetic DNA Purification System for Food试剂盒、Nucleospin Food试剂盒,以及CTAB法对阿胶进行DNA提取,每份DNA重复扩增8 次,上述方法的扩增率分别为4/8、2/8、8/8和1/8(结果未示),Nucleospin Food的扩增率明显高于其他方法,适合阿胶样品的检测。
图4 马和驴特异性体系相对灵敏度Fig.4 Relative response of horse and donkey specific systems
采用建立的实时荧光PCR体系对正品阿胶及某公司送检的6 批阿胶样品的检测,结果见表2。正品阿胶样品只检出驴成分,未知来源的6 个阿胶样品存在不同程度的掺杂情况,其中4 个样品未检出驴成分。
表2 未知来源阿胶样品检测结果Table 2 Results obtained by real-time PCR for the detection of unknown donkey glue samples
3 讨论与结论
阿胶的传统加工工艺很复杂,包括晾皮、刮皮、泡皮、铡皮、化皮、打沫、浓缩、凝胶、切胶、晾胶、擦胶[1-15]。对阿胶进一步加工成口服液和颗粒冲剂的过程中需要进一步酶解、纯化、干燥等,因此从新鲜的动物皮张到最终的产品需要经过高强度的加工,对DNA的破坏尤为严重。硅胶膜类试剂盒经过许多研究者的验证[16-17],在深加工食品核酸的提取方面性能很好。其核心是硅树脂,通常为亲水、多孔的硅胶珠,硅胶珠表面包被碱性基团,在酸性条件下可以产生高密度的正电荷,使DNA骨架上带负电荷的磷酸基团高特异性地结合在硅胶珠上,获得的核酸纯度很高,对碎片核酸的富集也很有效,这对于成分复杂的加工食品样品尤为有利。本实验对不同来源阿胶块样品的成功检测说明该类试剂盒的适用性。
此外,由于食品加工过程中高温高压对DNA造成很大破坏,因此检测体系通常选择高拷贝的短序列作为目标物。动物成分检测中线粒体是优先选择的对象,因为拷贝数多(1 000~2 000 个/细胞,每个线粒体基因组数百个拷贝),进化适中(能很好地反映物种特征)[18]。由于马和驴物种非常相近,对其线粒体序列的比对结果显示两者相似度92.4%,因此采用了线粒体全序列比对,寻找适合引物探针设计的差异集中区域的方式,找到了覆盖tRNA-Thr和D-loop区的一段序列,成功设计了满足要求的马特异性引物探针体系和驴特异性引物探针体系。
近年在食品真伪和质量评价领域有许多新型的技术得到应用。瞿海斌等[3]采用近红外光谱技术对阿胶真品和伪品进行快速区分。近红外等快速无损技术最大的优点是快速和无损,但是由于真品和伪品之间往往缺乏特征性指标,容易对未知样品造成误判,而且加工工艺、原料来源、样品颗粒均一性等也可能影响样品数据,造成聚类的偏差。而且很多伪品在熬制过程中会加入少量阿胶,将对光谱数据造成干扰。DNA检测技术对食品原料物种来源的判别具有唯一性、不受加工和混杂影响等特点,能够准确判定食品真伪。
阿胶作为我国“中药三宝”之一,在我国保健食品市场占据重要地位[19]。近年来阿胶也开始进入国外市场[20],例如2006年9月26日首次获准加拿大卫生部的中药产品药品生产质量管理规范证书注册,进入了加拿大的药品市场。在阿胶的质量监管中,对原料的控制尤为重要,虽然目前对阿胶的药理仍在研究中,但上千年的实践已证实驴皮作为阿胶原料所具有的独特效果,同时出于消费者知情权和利益的保护,也应当保证阿胶原料的真实性。对送检样品的检测发现普遍存在的掺杂甚至假冒现象,说明对阿胶原料监管十分必要和紧迫。
本实验针对线粒体tRNA-Thr和D-loop区序列,建立了阿胶中马和驴成分的实时荧光PCR检测方法,此法特异性高、灵敏度高,能准确检测阿胶中的马和驴成分,为市售商品的监管及食品化妆品药品生产企业的原料质控提供快速准确的技术手段。
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A Real-Time PCR to Detect Horse and Donkey Ingredients in Donkey Hide Glue
WU Ya-jun, WANG Bin, LIU Ming-chang, HAN Jian-xun, LI Xin-shi, CHEN Ying*
(Agro-product Research Center, Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100123, China)
In this study, we established a highly specific and sensitive real-time polymerase chain reaction (PCR) method to detect horse and donkey components in donkey hide glue. The mitochondrial tRNA-Thr gene of horse and the mitochondrial D-loop region of donkey were selected as target sequences for the designing of specific primers. In conventional and realtime PCR assays, horse and donkey ingredients could be specifically detected using both primer pairs.
donkey hide glue; horse; donkey; real-time polymerase chain reaction (PCR)
R282.5
A
1002-6630(2014)08-0085-04
10.7506/spkx1002-6630-201408016
2013-07-23
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2011AA100807)
吴亚君(1975—),女,副研究员,博士,研究方向为食品物种鉴定技术。E-mail:wuyajuncaiq@163.com*
陈颖(1972—),女,研究员,博士,研究方向为食品物种鉴定技术。E-mail:chenyingcaiq@163.com