苏北地区汉族人群19个Y-STR基因座的遗传多态性
2013-03-11于海龙储国栋詹梅
于海龙,储国栋,詹梅
(江苏省宿迁市公安局物证鉴定所,江苏宿迁 223800)
苏北地区汉族人群19个Y-STR基因座的遗传多态性
于海龙,储国栋,詹梅
(江苏省宿迁市公安局物证鉴定所,江苏宿迁 223800)
法医遗传学;多态现象,遗传;Y-STR;苏北;汉族
Y染色体短串联重复序列(Y-STR)作为常用的Y染色体特异遗传标记,在法医学个体识别、亲子鉴定、混合斑中男性成分检测、追溯父系迁移历史[1]等方面都具有独特的应用价值,是常染色体及mtDNA的重要补充。本研究调查了苏北地区642名汉族无关男性个体的19个Y-STR基因座的遗传多态性,以期为该群体的DNA检验鉴定提供基础数据。
1 材料与方法
1.1 样本
收集保存于FTA卡上的642名苏北地区汉族无关男性个体血样,分别用打孔器取直径1.0mm血样。
1.2 样本扩增和检测
对19个Y-STR基因座(DYS391、DYS389Ⅰ、DYS390、DYS389Ⅱ、DYS438、DYS456、Y-GATA-H4、DYS388、DYS447、DYS19、DYS392、DYS393、DYS460、DYS439、DYS635、DYS448、DYS458、DYS437、DYS385a/b),采用GoldeneyeTMDNA 20Y试剂盒[基点认知技术(北京)有限公司],按照操作说明书进行PCR扩增,反应总体系为10μL,PCR产物在3130XL型遗传分析仪(美国AB公司)上进行毛细管电泳,运用GeneMapper ID v3.2软件进行自动基因分型。
1.3 统计分析
应用直接计数法计算19个Y-STR基因座的等位基因频率与单倍型频率。基因多样性(gene diversity,GD)按照公式GD=n(1-ΣPi2)/(n-1)计算,其中n为样本数,Pi为各等位基因或单倍型频率[2]。
2 结果与讨论
对苏北地区642名汉族无关男性个体样本进行检验,得到各Y-STR基因座的等位基因分布情况(表1)。在642例样本中观察到619种单倍型,其中599种单倍型只观测到1次,17种单倍型观测到2次,3种单倍型观测到3次(表1)。
19 个Y-STR基因座的GD值分布范围是0.4117 (DYS438)~0.9762(DYS385a/b),大部分基因座GD值高于0.7(表2)。结果表明,19个Y-STR基因座在苏北地区汉族人群中有较好的多态性,适合法医学应用。
表1 苏北地区汉族人群19个Y-STR基因座等位基因频率(n=642)
续表1
表2 苏北地区汉族人群19个Y-STR基因座GD值(n=642)
[1]孟祥宁,薛雅丽,傅松滨.利用Y染色体进行人类起源和进化分析[J].国外医学遗传学分册,2003,26(2):63-66.
[2]Roewer L,Arnemann J,Spurr NK,et al.Simple repeat sequences on the human Y chromosome are equally polymorphic as their autosomal counterparts[J].Hum Genet,1992,89(4):389-394.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2013.06.019
1004-5619(2013)06-0468-02
2013-06-03)
(本文编辑:李成涛)
于海龙(1976—),男,河北辛集人,主检法医师,主要从事法医物证及DNA检验与研究;E-mail:yhailongyx@gmail.com