烟草根际解钾菌的筛选与鉴定
2012-05-25孔凡玉张成省
刘 璇,孔凡玉,张成省,王 静,冯 超,赵 杰
(1.中国农业科学院烟草研究所,青岛 266101;2.中国农业科学院研究生院,北京 100081)
钾几乎可以参与烟株体内所有的代谢过程[1],对烟株的物质代谢和能量代谢有很大的影响。增施钾肥和提高土壤中钾的有效性是提高烟叶钾含量的有效途径[2-3]。然而,我国钾肥资源较为匮乏,而且单纯增施钾肥并不能提高烟叶中的钾含量[4-5]。因此,开辟新的效果好、成本低且不污染环境的解钾菌,充分利用土壤中的钾素资源,对发展生态、经济农业具有十分重要的意义。
解钾菌能够将土壤中的固定态钾分解,转化为作物可以直接吸收利用的有效钾,而且它分泌的一些活性物质可以促进植物的生长。因此解钾菌是理想的生物肥料[6-7]。
本研究对解钾菌进行了解钾能力测定和菌种鉴定,探讨了解钾菌是否可以增加培养液中可溶性钾的含量,以期为制成烟草大田解钾菌菌肥提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
土样:山东省青岛市即墨采集的烟草根际土壤。钾源:钾长石。分析纯试剂:NaH2PO4,MgSO4·7H2O,FeCl3,蔗糖,CaCO3。生化试剂:琼脂,牛肉膏,蛋白胨。主要仪器:超净工作台,离心机,光焰光度计,高压灭菌锅,摇床。解钾细菌培养基:NaH2PO42.0 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,FeCl30.05 g,蔗糖5.0 g,CaCO30.1 g,钾长石粉1.0 g,琼脂15~20 g,蒸馏水1000 mL,pH 7.0~7.5。牛肉膏蛋白胨培养基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,琼脂15~20 g,水1000 mL,pH 7.4~7.6。
1.2 方法
本试验于2010年9月在中国农业科学院烟草研究所即墨基地进行,从烟草根际土壤中分离筛选出解钾菌。
1.2.1 钾细菌的分离纯化 取根际土样 1 g放入100 mL解钾细菌培养基的三角瓶中,28 ℃下进行摇床培养72 h。采用10倍稀释法,制成10-1~10-7稀释度悬液。
取上述制成10-3~10-7稀释度的根际菌悬液50 μL在解钾细菌培养基上涂布,每一稀释度 3个重复。在28 ℃温箱中培养,以钾细菌的菌落形态(呈玻璃珠状,透明,凸出,挑取时有勃稠感等)为标准进行挑取,进一步纯化,选取长势较好的菌株保藏,以便用于进一步研究[8]。
1.2.2 解钾菌的速效钾产生能力测定 解钾细菌的摇床培养:将配好的钾细菌液体培养基按每瓶50 mL的装量加入250 mL的三角瓶中,0.1MPa,20 min灭菌,冷却后接进1 mL解钾菌液,并设置不接种的空白对照。接种后,28 ℃、150 rpm振荡培养7 d。
上清液速效钾测定:将在三角瓶中培养好的钾细菌发酵液倒出并定容至50 mL,将发酵液在500 rpm下离心10 min,除去发酵液中的不溶性物质,然后取10 mL的菌液10000 rpm离心10 min,取上清液测定水溶性钾含量[9]。
1.2.3 解钾菌的16S rDNA鉴定 模板DNA的提取:去细菌培养物1~5 mL(106~108个细胞,最多不超过2×109个细胞),10000 rpm离心1 min,弃净上清。向沉淀中加入180 µL Buffer GTL,震荡使菌体重悬。
加入20 µL Proteinase K,涡旋混匀,70 ℃孵育直至菌体完全裂解,孵育过程中每隔一段时间颠倒或震荡离心管使样本分散。
涡旋振荡15 s,加200 µL Buffer GL ,涡旋振荡充分混匀;加200 µL 无水乙醇,涡旋振荡充分混匀(加入Buffer GL和无水乙醇后可能产生白色沉淀,不会影响后续实验)。
将上一步所得溶液(包括形成的沉淀)全部加入Spin Column DM中(Spin Column DM已放入Collection Tube),8000 rpm离心1 min,弃废液,将Spin Column DM放回Collection Tube中。
向Spin Column DM中加入500 µL Buffer GW1(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),8000 rpm离心1 min,弃废液,将Spin Column DM放回Collection Tube中。
向Spin Column DM中加入500 µL Buffer GW2(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),14000 rpm离心1 min,弃废液,将Spin Column DM放回Collection Tube中。
14000 rpm离心2 min,弃废液。将Spin Column DM置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的Buffer GW2。
将Spin Column DM转入一个新的离心管中,向膜的中间部位悬空滴加200 µL Buffer GE,室温放置1~5 min,8000 rpm离心1 min,将溶液收集到离心管中。-20 ℃保存DNA。
反应使用的上游引物为:
反应使用的下游引物为:
反应体系(50 µL)
由上海英骏生物技术有限公司北京测序部测序。
2 结 果
2.1 菌落基本特征
初筛选菌落28 ℃在筛选培养基上培养48 h得到8个典型菌落,并进一步纯化菌落28 ℃在筛选培养基上培养48 h,菌落特征见表1。
表1 菌落形态与菌体基本形态特征Table1 The morphology colony and basic characteristics of morphological
2.2 速效钾产生能力
利用钾长石为唯一钾源筛选培养基从植物根际土壤中筛选具有分解钾矿的微生物,对所得到 8个菌株,分别扩大培养进行解钾实验,以 CK(不接种)作为对照,各接种培养液中速效钾增加百分比见图1。
所选菌株中以菌株 K-GX4的产生速效钾能力最强,其培养液中速效钾含量增加 174.2%,K-XHJ3、K-JM-J5、K-GX5、K-GX1次之,培养液中速效钾含量增加分别为 146.99%、123.21%、121.23%、101.73%。培养液中速效钾含量增加小于100%的菌株为K-JM-B2、K-GX6、K-JM-B1,其速效钾含量分别增加79.27%、47.25%、24.51%。
图1 速效钾增加量百分比Fig.1 Increase in the percentage of available potassium
2.3 16SrRNA基因序列分析
将测序结果输入Gen-Bank,利用BLAST软件,将测定得到的基因序列与 GenBank数据库中的序列进行同源性分析,获取同源性较高的相邻的种、属的16S rDNA序列,得到结果如表2所示。
表2 GenBank中Blast得到8种的菌株的结果Table2 The result of 8 strains in GenBand
3 讨 论
从青岛即墨烟草根际土壤中筛选到的8株解钾菌,通过测定各菌株培养液中钾含量来评价其解钾能力。其中以变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)产生速效钾解钾的能力最强,以产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)、阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、成团泛菌(Pantoea agglomerans)、阿氏肠杆菌(Enterobacter asburiae)4种菌解钾能力较强,较弱的为洋葱伯克霍尔德氏菌(Burkholderia cepacia)、Microbacterium foliorum、拟香味类香味菌(Myroides odoratimimus)。而且62.5%的菌株的培养液中速效钾含量增加超过100%。
同实验室富营养的培养条件相比,自然条件下的细菌往往处于“饥饿”状况,而这正是细菌在自然界生活的正常环境。解钾细菌和其他细菌一样,在自然条件下极易受到环境条件的影响,如植物的种类、土壤肥力、水分、日长、光照强度、生长季节的长短、温度的变化以及其他土壤微生物和原生动物的影响,这些条件中的任何一个发生变化,都有可能直接或间接地影响解钾菌的生长。因此,尽管本研究所筛选到的解钾菌株都具有分解钾长石矿粉的能力,但在自然环境条件下情况十分复杂,若再通过盆栽试验和大田试验相结合的方法,从改善土壤生态环境、提高肥料利用率,改善烤烟根际营养水平、增强根系吸收能力,合理平衡、协调各生育期的营养及代谢状况等方面进一步研究确认后,即可作为制作微生物肥料优先选用菌。
将解钾菌制成生物肥料可增加烟草根际可溶性钾的含量,有利于烟草钾元素的吸收,从而提高烟叶产量和烟叶品质。烟草生物肥料具有无毒、无害、无污染、肥效长、节约能源等无机肥料所不及的优点[10]。从发展趋势看,生物肥料在现代农业生产中将发挥越来越大的作用,代表着未来肥料发展的方向。
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