基于新一代测序数据的比对算法的研究
2012-04-29权威王亚东
智能计算机与应用 2012年5期
权威 王亚东
摘要: 随着测序技术的发展,现在的高通量测序技术已经能在短时间内产生大量的数据。一个人类基因组的数据大约在3GB,而测序的数据集则往往是人类基因组的30倍以上(100GB)。如此庞大的数据量,就为生物学家带来相对较大的挑战。基于新一代测序数据的比对通常是开展诸多分析工作的第一步,对于生物信息工作者深入研究极为重要,但是该类软件往往偏向计算机方向,其对比原理及使用方法对于生物信息工作者显得颇为晦涩。因此,就比对现有的主要算法进行了总结分析。
关键词:
中图分类号:TP391文献标识码:A文章编号:2095-2163(2012)05-0039-04