华南地区大豆根内拮抗菌AF-67筛选与鉴定*
2010-09-18区伟佳李敏清袁英英李华兴
区伟佳,王 荣,李敏清,袁英英,李华兴
(华南农业大学资源环境学院,广州 510642)
华南地区大豆根内拮抗菌AF-67筛选与鉴定*
区伟佳,王 荣,李敏清,袁英英,李华兴**
(华南农业大学资源环境学院,广州 510642)
筛选生防菌共436株,有生防性能71株,占16.3%,抑菌效果较好8株,占1.8%,能快速高命中率的获得具有防病效果好、抑菌谱广的生防菌株。内生菌AF-67与Fusarium oxysporum共培养时,能使其菌丝体及其分生孢子生长明显畸变。经16S rDNA基因序列分析,AF-67被初步鉴定为Bacillus amyloliquefaciens。
大豆根腐病;根内拮抗菌;筛选;鉴定;16S rDNA
大豆根腐病(Soybean root rot)在国内外大豆产区均有发生,是土传病害,危害较重[1]。该病对产量影响大,感病品种产量损失一般为5%~10%,严重的可达90%以上,甚至绝产。每年给国家造成巨额经济损失[2,3]。华南大豆产区高温多雨的气候环境,土壤紧实粘重、偏酸等均有利于根腐病的发生[4],关于解决华南产区大豆根腐病的研究越来越受科研工作者的关注。
生物防治手段普遍应用于植物病害防治。许多根际或根内微生物同时具有防病、促生作用。土壤施用含有该生防菌株的生物肥料能减少农药的用量,降低成本,同时还能改善土壤条件及农产品品质[5]。在生防菌株的筛选源上,考虑生防菌在植株根部的定殖效果,着重研究从植株根际或根内中筛选。有研究表明,从根际或根内分离筛选出的拮抗菌能更好的定殖在植株根系[6,7]。
芽孢杆菌作为目标菌群,更能适合于生物肥料工业生产的要求。研究通过对有效生防菌的16S rDNA序列分析,确定生防菌的种类和来源。旨在提供一种快速、准确的生防菌选鉴方法。
1 材料与方法
1.1 细菌分离材料
采自华南农业大学博罗、宁西大豆试验田的大豆植株。
1.2 供试大豆根腐病原菌
尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum) 3个高致病性菌株 F1、F2、F5;
丝核菌(Rhizoctoniasp);
小核菌(Sclerotium rolfssii);
以上供试菌种由华南农业大学资源环境学院根系中心分离与提供。
1.3 根内拮抗芽孢杆菌AF-67的分离
选取健康强壮大豆植株根系,表面消毒后,无菌状态置于灭菌研钵,加入适量LB培养基和灭菌石英砂,充分研磨后转入含50mL LB液体培养基中,150rpm富集培养30min。取出,置于80℃恒温水浴10min。培养液稀释后,取适当浓度涂布LB平板,36℃培养48h后挑取形态不同、长势较好的菌落,划线纯化。
1.4 拮抗菌筛选、抑菌效果与菌间相容性测定 [8,9]
距PDA平板中心3cm处互相垂直四个方向点接拮抗细菌,平板的中央接种经过活化的尖孢镰刀菌菌块(直径5mm),28℃黑暗培养12d后记录菌圈直径,设5个重复。公式如下:
同时按上述的方法对丝核菌、小核菌进行拮抗性测定。
菌间相容性采用交叉划线法:取待检拮抗菌液依次两两交叉划线,在划线的交叉处出现透明不生长,为菌间不相容;无出现透明点,能正常生长为菌间相容[8,9]。
1.5 拮抗菌AF-67的鉴定
形态鉴定参照《伯杰氏鉴定细菌学手册》[10];AF-67鉴定方法采用分子生物学16S rDNA序列分析:取培养至对数期菌液,用细菌DNA提取试剂盒提取AF-67的总DNA。配制扩增体系50uL,其中,正向引物K01(FC27):5’AGAGTTTGATCCTGGCTCA G 3’;反向引物K02(RC1492):5’TACGGCTACCTT GTTACGACTT 3’。PCR产物由北京奥科生物技术有限责任公司测序。序列结果通过BLASTN程序在GenBank核酸数据库中进行分析,确定其分类地位。
1.6 AF-67培养液对尖孢镰刀菌菌丝发育影响
将尖孢镰刀菌(F5) 菌块(直径5mm)与AF-67菌悬液3mL加入50mLKB培养液中,28℃,150rpm培养3d。吸取少量培养液,显微镜下观察真菌菌丝的生长情况。对照接病原菌块的KB培养液。
2 结果和讨论
2.1 大豆根内拮抗菌分离与筛选
从大豆根内筛选出候选生防菌共436株,其中具有生防性能71株,占16.3%,其中对大豆根腐病原菌具明显抑制作用8株,占1.8%,抑菌效果见表1。
试验证明该法能高命中率的获得具有防病效果好、抑菌谱广的生防菌株。由表1可知,所得菌株对峙试验后15d仍保持高抑菌效果性能。
表1 生防菌对大豆根腐病菌抑菌效果 %
2.2 生防菌相容性测定
生防菌间相容性测试结果显示(见表2),菌株AF8与其他大部分生防菌显示不相容性,其他菌株均显示可以共存。
表2 生防菌间相容性测试结果
2.3 拮抗菌AF-67的16S rDNA分子生物学鉴定
图1 拮抗菌AF-67的16S rDNA电泳条带及其测序峰图片段
优选有代表性,编号为AF-67拮抗细菌,16S rDNA序列比对结果经GenBank(NCBI)比对,登记号为lcl58891。根据同源性比较(见表3),与解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis subsp) 同源性最高,达99%,与地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、短小芽孢杆菌 (Bacillus pumilus) 同源性也达97%。
表3 AF-67 16S rDNA在GenBank(NCBI)比对结果
拮抗菌16S rDNA的PCR扩增条带单一、清晰,位于约1.5kb处。其序列峰图效果理想,无出现错峰套峰,测序结果可靠性高(见图1)。
测序结果在GenBank核酸数据库中分析,构建系统发育树(见图2),分析遗传距离,其种间亲缘关系表明AF-67与B.Amyloliquefaciens的亲缘关系最近,且在同一个分支中,这再次验证了AF-67最可能为解淀粉芽孢杆菌。
2.4 AF-67对尖孢镰刀菌菌丝发育影响
拮抗菌AF-67与镰刀菌共培养后发现,能明显抑制病菌菌丝的生长(见图3)。菌丝体局部明显膨大、肿胀,菌丝不发育,同时有畸形、断裂现象,菌丝体分隔数显著增多。细胞内含物大量凝聚,部分形成大且透明的空泡。与对照相比,经共培养的镰刀菌产孢量明显减少。
图2 AF-67的系统发育树
图3 AF-67对尖孢镰刀菌菌丝发育影响
3 讨论
鉴于芽孢杆菌属的生物安全性、耐热特性和生产上的可操作性,试验能快速直接筛选出目标生防菌。结合分子生物学技术,对于难于培养、生化反应不明显及遗传表型等手段不能鉴定的细菌,采用此法提供快捷可行的解决方案。
造成大豆根腐的致病菌种类繁多杂乱,地域差异性大[11]。筛选的8株生防菌对几种华南地区的常见致病菌均显示较好抑菌效果。靶标菌中,国内以Fusarium oxysporum的出现频率最多[12,13],大豆项目科研基地的感病植株,其5号高致病性菌株的分离率最高。筛选的AF-67对Fusarium oxysporum菌丝生长有一定的抑制作用,具开发利用潜力。
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In this study,the improved traditional screening methods could quickly obtain strains which showed antagonistic activity against soybean root rot and broad antagonistic spectrum.The activity of 436 strains assayed,16.3%of them showed antagonistic activity againstF.oxysporumf.sp.soybean and one of them,strain AF67 isolated from soybean roots was the best.Co-culture with Fusarium oxysporum,mycelium and conidia were evident distortion.Based on the sequence of 16S rDNA,strain AF67 was identified asBacillusamyloliquefaciens.
Soybean root rot;Antifungal Entophytic Bacteria;Isolation;Characterization;16S rDNA
S432.4+4
B
1674-3547(2010)02-0018-04
2009-12-22;修回日期:2010-01-12
国家自然科学基金项目(40971155);广东省“十一五”攻关项目(2006B20301050),广东省教育部产学研结合项目(2009B090300330),广东省农业厅科技项目(粤农土肥(2004)28号)。
李华兴,男,教授,华南农业大学资源环境学院,E-mail:huaxli@scau.edu.cn