丁酰胆碱酯酶在胃癌中的预后价值及其生物学功能分析
2023-10-29何继凯瞿文豪贾佳琦杨小兵贾立周黄衍强
何继凯,瞿文豪,贾佳琦,杨小兵,王 彬,贾立周,黄衍强,赵 薇*
1右江民族医学院研究生院,广西 百色 533000;2巴彦淖尔市医院中心实验室,内蒙古 巴彦淖尔 015000;3南京医科大学附属南京医院病理科,江苏 南京 210006
GC(gastric cancer,GC)是全球第5大癌症,死亡率居全球第4位[1-2]。目前,GC的治疗方法主要包括手术、放疗和化疗,但术后局部复发或远处转移的发生率超过40%[3]。此外,放疗和化疗后会出现明显的不良反应,导致晚期GC患者的5年生存率仅约20%[4-5]。因此,寻找GC新的治疗和预后靶点以提高患者的生存率,已成为一项迫切的公共卫生问题。
为筛选出与GC 预后相关的基因,本研究采用多种分析方法发现,在GC中丁酰胆碱酯酶(bcylcholinesterase,BCHE)具有良好的预后价值。BCHE 是一种由肝脏合成并分泌到血液中的血浆酶,主要表达于外泌体和内质网[6],其半衰期约为12 d,参考值为5 900~13 200 U/L[7-8]。研究表明,口腔癌和乳腺癌患者血清中BCHE 的表达水平明显升高[9-10]。然而,BCHE 基因在GC中的表达水平、调控机制,以及与临床治疗和预后的相关性仍不清楚。
1 材料和方法
1.1 材料
本研究的GC 患者临床病理信息和基因转录组数据都来源于UCSC Xena数据库的肿瘤基因组图谱(TCGA)[11]。
人GC细胞系HGC27、MKN1和人正常胃上皮细胞系GES-1(武汉普诺赛生命科技有限公司)。qRTPCR 试剂(南京诺唯赞生物科技股份有限公司);小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)(上海吉玛制药技术有限公司);Lipo6000、CCK-8试剂(上海碧云天生物公司);基质凝胶(厦门模基生物科技有限公司)。
1.2 方法
1.2.1 生信数据处理
首先使用Lasso 回归筛选预后基因[12],并采用Kaplan-Meier生存曲线和单因素、多因素Cox回归分析BCHE基因表达在GC中的预后价值;其次采用卡方检验验证BCHE mRNA与临床病理参数之间的关系,使用TIMER2.0数据库(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)[13]和CIBERSORT 算法研究BCHE 和免疫细胞浸润之间相关性,此外,利用WGCNA 算法和DAVID Bioinformatics Resources数据库(https://david.ncifcrf.gov/)[14]对BCHE基因进行Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析。
1.2.2 qRT-PCR
使用细胞RNA 提取试剂盒提取人GC 细胞HGC27、MKN1和人正常胃上皮细胞GES-1的RNA,再用逆转录试剂将RNA逆转录成cDNA,以GAPDH作为内参对BCHE进行qRT-PCR扩增。BCHE R:5′-TGTTGCAGAGAATCGGAAATCAA-3′,F:5′-CCCAATAAGCATGCAGAGCA-3′。GAPDH R:5′-GAAGGTGAAGGTCGGAGTC-3′,F:5′-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3′。采用2-ΔΔCt计算相对表达量。
1.2.3 细胞转染
利用siRNA靶向敲减BCHE基因。将细胞分为对照组、空载组(si-NC)和实验组(si-BCHE),收集处理后的HGC27和MKN1细胞,并配制成2×105个/mL的细胞悬液,铺入6 孔板中,每孔2 mL。培养24 h后,每孔滴加7.5 μL Lipo6000和7.5 μL siRNA,在培养箱中培养48 h后进行下一步实验。
1.2.4 CCK-8和克隆形成实验
CCK-8 实验:收集处理后的HGC27 和MKN1细胞,并配制成2×104个/mL 的细胞悬液,铺入96 孔板中,每孔100 μL,分别在24、48、72、96 h 后加入10 μL CCK-8试剂,在37 益下孵育2 h后检测450 nm的吸光度值。克隆形成实验:收集处理后的HGC27和MKN1 细胞,并配制成1×103个/mL 的细胞悬液,铺入6孔板中,每孔1 mL,观察到克隆体的外观后使用甲醛固定细胞,再用1%结晶紫对细胞进行染色,最后PBS洗涤3次并拍照。
1.2.5 细胞黏附实验
96孔板每孔加入100 μL的1∶4基质凝胶,凝胶凝固后,收集处理过的HGC27 和MKN1 细胞,并配制成1×105个/mL 的细胞悬液,铺入96 孔板中,每孔100 μL,随后置于细胞培养箱中孵育2、4和8 h,PBS洗涤3次后,更换新的培养基后进行CCK-8检测。
1.2.6 迁移和侵袭实验
迁移实验:收集处理后的HGC27 和MKN1 细胞,并配制成2×105个/mL 的细胞悬液,铺入6 孔板中,每孔2 mL,24 h 后使用灭菌的200 μL 枪头垂直于6 孔板底部横线划线,更换无血清培养基,分别在0、12、24 h后使用荧光倒置显微镜拍照。侵袭实验:收集处理后的HGC27 和MKN1 细胞,并配制成1×106个/mL 的无血清细胞悬液,将细胞加入铺有1∶8基质凝胶的Transwell上层小室中,每孔100 μL。小室的底部加入500 μL 20%的血清培养基。培养48 h 后,使用甲醛固定细胞,再用0.1%结晶紫对细胞进行染色,最后PBS洗涤3次并拍照。
1.3 统计学方法
所有统计分析都使用R 软件(4.1.2 版本)和GraphPad Prism 8进行,符合正态分布的数据资料以均数±标准差()表示,两组间比较采用独立样本t检验,多组间比采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验。根据中位数将BCHE mRNA在GC组织中的表达水平分为高表达组和低表达组[15-18]。生存分析采用Kaplan-Meier 法并进行log-rank 检验。使用R 包“forestplot”进行单因素和多因素Cox回归分析,并将单因素分析中差异具有统计学意义(P<0.05)的变量纳入多因素分析。BCHE 表达高低与临床病理参数的关系采用卡方检验。P<0.05为差异有统计学意义,每组实验重复3次。
2 结果
2.1 BCHE 与GC 患者预后及临床病理参数的关联性分析
首先通过Lasso 回归分析筛选出15 个与GC 患者总生存期(overall survival,OS)有关的基因:BCHE、GPX3、ADAMTS18、ASPA、CD36、SERPINE1、CYP19A1、LRAT、CGB5、ANO3、SOX14、CYMP、CFHR4、F13B和OTX2(图1A);其次,根据生存曲线分析筛选出影响预后差异最显著的基因BCHE(P<0.001,图1B),且发现BCHE mRNA 高表达的GC 患者无进展生存期(P=0.001)、疾病特异性生存期(P=0.002)和无病生存期(P=0.004)更短(图1C~E)。进一步分析发现,BCHE mRNA 在肿瘤组织中的表达水平高于癌旁组织(P<0.001),同时BCHE mRNA 在晚期GC(Ⅲ/Ⅳ期)患者中的表达水平高于早期GC(Ⅰ/Ⅱ期)患者(P=0.020,图1F)。根据BCHE mRNA 在GC 组织中表达水平的中位数将患者分为高表达组和低表达组,分析BCHE mRNA 的表达与GC患者临床病理学参数之间的关系。结果表明,BCHE mRNA 的高表达与T 分期(P=0.029)、TNM 分期(P=0.035)、肿瘤类型(P<0.001)、肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)(P<0.001)、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)(P<0.001)等临床病理参数相关(表1)。此外,单因素分析结果显示BCHE mRNA 的表达水平(P<0.001)、年龄(P=0.010)、T分期(P=0.002)、M分期(P=0.002)、N分期(P=0.002)、TNM分期(P<0.001)和肿瘤类型(P=0.030)与GC患者预后有关。将单因素分析中有统计学意义的临床因素和BCHE表达水平因素一并纳入多因素分析,结果表明BCHE mRNA 的表达水平(P=0.006)、年龄(P=0.025)和M分期(P=0.019)均是GC患者的独立预后因素(表2)。
表1 BCHE mRNA与GC患者临床病理参数的关系Table 1 The relationship of BCHE mRNA with clinical features
表2 BCHE mRNA及临床病理参数的单因素及多因素Cox回归分析Table 2 Univariate analysis and multivariate Cox regression analysis of BCHE mRNA and clinical features
图1 BCHE mRNA在GC中的表达水平及相关生存分析Figure 1 The expression of BCHE mRNA and related survival analysis in GC
2.2 BCHE表达和免疫细胞浸润的相关性分析
首先,使用CIBERSORT 算法研究BCHE mRNA与免疫细胞浸润之间的关系。结果表明,BCHE mRNA 高表达与多种免疫细胞浸润相关,包括浆细胞、B 细胞、调节性T 细胞、NK 细胞和巨噬细胞等(P<0.05,图2A);进一步通过TIMER2.0 数据库研究BCHE mRNA 表达与免疫细胞浸润之间的具体相关性。结果表明,在GC 中BCHE mRNA 的表达与B 细胞(r=0.192,P<0.001)、单核细胞(r=0.226,P<0.001)、巨噬细胞(r=0.169,P<0.001)、NK 细胞(r=0.137,P=0.008)、肥大细胞(r=0.432,P<0.001)和癌症相关成纤维细胞(cancer fibroblast,CAF)(r=0.733,P<0.001)显著正相关;与CD4+T 细胞(r=-0.256,P<0.001)和CD8+T 细胞(r=-0.104,P=0.043)显著负相关(图2B)。
图2 BCHE与免疫细胞浸润的相关性分析Figure 2 The correlation between BCHE and immune cell infiltration
2.3 BCHE基因的富集分析
为了解目的基因BCHE可能存在的生物学功能和信号通路,我们利用WGCNA 算法和ESTIMATE算法筛选与BCHE 基因相关的共表达基因,选择了与免疫细胞和基质细胞相关性最高的棕色模块(包含了188 个与BCHE 共表达的基因)(图3A),使用DAVID数据库对这188个基因进行富集分析,GO分析结果表明BCHE 的表达可能与细胞增殖、细胞黏附和细胞迁移等功能有关(图3B)。KEGG 分析表明,BCHE 的功能可能与PI3K-Akt 信号通路、TGF-β信号通路和癌症通路等有关(图3C)。
图3 BCHE mRNA的富集分析Figure 3 Enrichment analysis of BCHE mRNA
2.4 BCHE 敲减对GC 细胞增殖、黏附、迁移和侵袭的影响
为验证BCHE 在GC 细胞中的作用,本研究验证了该基因的体外功能。qRT-PCR 检测发现,GC 细胞株(HGC27 和MKN1)中BCHE mRNA 的表达显著高于胃组织正常细胞株(GSE-1)(P<0.001,图4A)。通过siRNA 敲减BCHE 表达,敲减效率如图4B、C 所示,选择敲减效率最高的1 号片段(si-BCHE-1)进行下游的功能实验。结果发现,BCHE 敲减后明显抑制了GC 细胞的增殖能力(P<0.05)和克隆形成能力(P<0.001,图4D~G)。黏附实验结果表明,BCHE敲减后能够促进GC细胞的黏附能力(P<0.05,图5A、B)。迁移和侵袭实验结果表明,BCHE 敲减后明显抑制GC 细胞的迁移(P<0.001)和侵袭能力(P<0.001,图5C~F)。这些结果表明,BCHE 是GC 细胞中的一个促癌基因,敲减BCHE可抑制其介导的恶性生物学功能。
图4 敲减BCHE抑制胃癌细胞的增殖和克隆形成的能力Figure 4 Knock-down of BCHE inhibits proliferation and colony formation of gastric tumor cells
3 讨论
BCHE 是一个潜在的肿瘤标志物,其mRNA 水平在卵巢癌、乳腺癌和肺癌中显著升高[9,19-20],且BCHE mRNA的高表达与子宫内膜癌和卵巢癌患者较差的总生存率相关[19,21]。本研究通过生信数据分析以及实验验证发现,BCHE 在GC 细胞中高表达,且BCHE mRNA 的高表达与GC 预后不良呈显著正相关。以上结果提示,BCHE可能是GC新的预后生物标志物。
鉴于GC 微环境对肿瘤发生发展和转移具有重要作用,本研究使用CIBERSORT 算法和TIMER 2.0数据库分析发现,BCHE mRNA 高表达与B细胞、癌症相关成纤维细胞及巨噬细胞的浸润呈正相关,与CD4+T 和CD8+T 细胞浸润呈负相关。研究报道显示,肿瘤微环境中存在较多的免疫细胞亚型,部分免疫细胞亚型与肿瘤患者较差的预后相关,如M2型巨噬细胞、调节性B 细胞、癌症相关成纤维细胞等[22-24];亦有研究表明,B细胞浸润可能和肿瘤转移相关[25]。另外,部分T 细胞上高表达免疫抑制性分子(如PD-1、CTLA-4)等,当与携带相应配体的肿瘤细胞结合时,可抑制效应性T细胞的杀伤功能,从而使肿瘤细胞逃脱体内免疫系统的检查点监视,这也成为针对免疫检查点治疗的核心所在[26]。据此,有理由推测GC 组织中BCHE 的高表达可能通过重塑肿瘤免疫微环境,促进肿瘤的发生发展,进而可影响免疫治疗的效果。
研究表明,BCHE 与细胞凋亡、细胞黏附、细胞增殖和肿瘤发生有关[27-28]。在神经母细胞瘤中,BCHE mRNA的敲低显著抑制了癌细胞的增殖和侵袭[28]。在对子宫内膜癌的研究中发现BCHE可能和TGF-β信号通路有关[21]。然而,BCHE 在GC 中的生物学功能的研究尚未见报道。本研究通过敲低BCHE mRNA表达显著减缓了GC细胞增殖和克隆,并促进GC细胞的黏附、抑制GC细胞的迁移和浸润能力。因此,BCHE 是一个促癌基因,降低BCHE 的表达可抑制其介导的恶性生物学功能。但本研究仍有不足,如未对BCHE的分子机制进行实验验证,因此,本研究团队将会在今后的工作中完善对该部分内容的探索。