CrossDome 工具或可预测基于T 细胞的免疫疗法是否会错误地攻击健康细胞

据Fonseca AF 2023 年6 月12 日（Front Immunol，2023，14.https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1142573.）报道，美国休斯顿大学的研究人员努力让T 细胞免疫疗法更加安全，他们开发了一种名为CrossDome 的工具，该工具结合遗传信息和生化信息来预测T细胞免疫疗法是否可能错误地攻击健康细胞。

基于T 细胞的免疫疗法在抗击癌症和传染病方面有着巨大的潜力，因为它们有能力专门识别靶向病变细胞，包括癌症转移。然而，由于它可能识别健康细胞的未知靶标，这种潜力受到了安全问题的影响。在一种情形下，研究人员构建了特殊的T 细胞，它们被认为靶向一种在称为黑色素瘤的皮肤癌中发现的蛋白。 然而，这些T 细胞最终也攻击一些患者的心脏细胞，因其蛋白不同。 这对心脏造成了严重损害。

CrossDome 工具有助于预测基于T 细胞的免疫疗法的潜在风险。 它使用不同类型的信息（称为多组学）的组合来进行预测，并确定这种疗法除了靶向预定的病变细胞之外，是否可能意外地伤害健康细胞。 通过分析多种因素，CrossDome 为基于T 细胞的免疫疗法的安全性提供了新的见解，并可能帮助人们开发更安全的治疗方法。

为了测试CrossDome 的有效性，研究人员用它来预测16 个广为人所知的T 细胞交叉反应病例中的潜在错误，包括黑色素瘤-心脏损害病例。该工具成功地将一种心脏蛋白确定为T 细胞的潜在靶标，在数以千计的其他蛋白中把它列为高风险的候选靶标。为了加强这些研究结果，研究人员结合了来自不同功能数据集的信息，以帮助评估某些基因的表达量，以及它们与某种名为HLA 的分子结合的可能性，从而引发免疫反应。 这些信息帮助人们决定哪些潜在的非靶标基因值得在实验中测试。