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变异链球菌氧化应激调控机制的研究进展

2023-02-23宁佳胡欣程兴群

口腔疾病防治 2023年4期
关键词:谷胱甘肽生物膜链球菌

宁佳, 胡欣, 程兴群

1.天津医科大学口腔医院综合科,天津(300070); 2.四川大学华西口腔医院老年口腔科 口腔疾病研究国家重点实验室 国家口腔疾病临床医学研究中心,四川 成都(610041)

龋病发病率高,分布广,对人类口腔和全身健康危害很大[1]。龋病发生发展与牙菌斑生物膜微生态平衡密切相关,生物膜内菌种间竞争在维持口腔微生态平衡中具有重要作用[2]。口腔是一个特殊的微生态境,牙菌斑生物膜可遭遇各种环境因素刺激[3]。其中,氧化应激(oxidative stress)是调控口腔微生物群落组成及结构的重要因素。氧化应激是指细胞内源性抗氧化系统不能有效清除堆积在体内的大量自由基,导致机体氧化和抗氧化系统失衡的状态,并通过激活一系列信号通路调控细胞代谢和功能,参与机体多种疾病病理性改变。牙齿表面、窝沟和牙周袋等不同生境中氧分压显著不同,由于细菌间相互作用,牙菌斑生物膜不同层面氧分压也明显不同。血链球菌和戈登链球菌等牙菌斑生物膜早期定植菌在糖代谢途径中可产生过氧化氢(hydrogen peroxide,H2O2),抑制竞争菌生长,调控eDNA 释放,是介导微生物间相互作用、调节牙菌斑微生态平衡的重要因子,在龋病发病中的作用不容忽视[3]。

变异链球菌(Streptococcus mutans)与龋病的发生发展密切相关。变异链球菌适应口腔内复杂多变的环境刺激,促使自身定植并在生物膜中占据优势地位,持续发挥毒力是其致龋的关键。面对进食、刷牙等人体生理活动变化带来的氧化应激,以及细菌源性H2O2的胁迫作用,变异链球菌通过合成还原酶等多种途径进行对抗。致龋环境中变异链球菌氧化应激耐受性降低,外源性氧刺激可引起细菌DNA 和蛋白质损失,抑制细菌生长和毒力因子表达,削弱其在复杂生物膜中的竞争能力[4]。

本文将对变异链球菌氧化应激调控机制进行综述,包括合成还原酶、通过金属调节蛋白调控铁锰等金属离子摄入、转录调节因子Spx、从胞外摄取谷胱甘肽及相关的信号传导系统等,为深入研究变异链球菌在口腔微环境中的致龋机制提供新思路。

1 合成还原酶

变异链球菌作为兼性厌氧菌,可通过合成各种还原酶,如超氧化物歧化酶(super oxidase dismutase,SOD)、NADH 氧化酶(Nox)抵御氧应激。超氧化物歧化酶SOD 可以促使超氧化物阴离子自由基(O2—)发生歧化反应,使其保持在较低水平,帮助变异链球菌免受O2—毒害,从而在口腔有氧和无氧环境下都能良好生长。研究发现变异链球菌SOD突变株生长减慢,对H2O2耐受能力降低[5]。SOD基于基因水平的研究主要包含3 种类型:CuZn-SOD、FeSOD、MnSOD,其中MnSOD 数量最多。Mn-SOD 是一种含锰的金属酶,能够催化超氧化物自由基转化为过氧化氢和氧气,这种功能对于防止变异链球菌氧中毒非常重要[6]。

由nox 基因编码的NADH 氧化酶Nox,是一种含黄素的氧化还原酶。变异链球菌通过Nox 将O2还原为水,防止形成破坏性的活性氧(reactive oxygen species,ROS);另一方面可将NADH 氧化为NAD+(一种碳循环代谢物)。因此Nox 处于两个调节途径的交叉点,通过O2和NAD+分别调节全局转录因子Spx 和氧化还原调节子Rex 的活性,对氧化应激条件下变异链球菌的生长至关重要[7]。Poole等[8]发现变异链球菌Nox-1 与烷基过氧化氢还原酶(Alkyl hydroperoxide reductase,AhpC)同源,两者均是以半胱氨酸为基础的过氧化物酶系统,可将有机氢过氧化物(organic hydroperoxides)或H2O2分别催化还原为醇或H2O,在变异链球菌应对体外和体内氧化应激压力中发挥保护作用。但敲除这两个酶的编码基因并不会显著影响变异链球菌的抗氧化应激能力,说明变异链球菌存在其它的抗氧化系统用以抵抗氧化应激。

2 调控金属离子摄入

细菌金属调节蛋白是维持细菌胞内金属离子稳定状态的“监视器”,对变异链球菌生理活性和致病性至关重要。铁(Fe)和锰(Mn)等金属离子是细菌细胞内重要的辅酶因子,过多的Fe 离子在细菌中积累会发生芬顿反应产生有毒的羟基自由基,导致细胞活性降低或死亡。与Fe 离子不同,Mn 不会促进芬顿反应发生,由于其是超氧化物歧化酶的辅助因子,可以将有害的羟基自由基转化为无害的副产物,从而在细菌抵御氧化应激的过程中发挥关键作用[9]。

Dpr 是Dps 家族成员dpr 基因的编码产物,是一种铁结合蛋白。与SOD 不同的是,Dpr 不与氧和活性氧发生反应,而是通过隔绝铁离子,阻止铁和H2O2相互作用产生有毒羟基自由基,达到抑制芬顿化学反应,保护机体免受氧化损伤。细胞间游离铁离子浓度的严格调控是细菌在有氧条件下生存的重要因素。Ganguly 等[10]研究发现,Dpr 通过调节细胞内游离铁离子浓度使细菌获得耐氧性,在机体抵抗氧化应激反应中起主要调控作用。smu995-smu998 基因编码铁转运蛋白操纵子,在dpr 突变株中进一步敲除smu995 基因或整个smu995-smu998 基因操纵子,可完全逆转dpr 基因失活导致的氧化应激敏感表型;敲除亚铁离子转运系统(ferrous iron transport system,FeoABC)编码基因不能逆转dpr 突变株的表型,结合smu995-smu998、feoABC 和sloABC 突变株表型,提示这3 个系统在铁转运中可能存在相互作用,也提示变异链球菌可能存在额外的铁摄入系统[11]。

SloR 是变异链球菌25 kDa 金属调节蛋白,属于DtxR 金属调节剂家族。SloR 可结合于sloABC、sloR、comDE、ropA 和spaP 基因启动子区域,调控变异链球菌氧化应激反应。Crepps 等[11]进一步研究发现,SloR 无法直接与sod 或tpx 启动子区域结合;SloR 调控sloABC 操纵子表达,促进细菌摄入Mn2+以抵御氧胁迫;与野生株和sloC 基因突变株相比,变异链球菌sloR 基因突变株中sod、tpx 和sloC 基因表达上调,提示缺乏SloR 时氧化应激对变异链球菌的影响更加显著。

PerR 作为18 kDa Fur 家族的一员,编码与过氧化物耐受相关的转录抑制因子,具有金属依赖性。变异链球菌PerR 可感知并响应氧化应激,负调节dpr 基因表达,perR 基因突变株对氧化应激耐受能力增强[12]。Ruxin 等发现变异链球菌暴露于H2O2时PerR 蛋白表达上调,通过直接结合于Fur 蛋白或者sloR 基因操纵子上PerR 同源序列而抑制SloR 转录,敲除perR 基因,变异链球菌对H2O2耐受能力提高,同时敲除sloR 和perR 基因,细菌tpx 和dpr 抗氧化基因显著上调[13]。以上结果提示PerR和SloR 蛋白在变异链球菌氧化应激反应中存在相互作用,共同发挥重要调控功能。

3 转录调节因子Spx

转录调节因子Spx 是厚壁菌应激反应的主要调节因子。spx 基因首次在枯草芽孢杆菌中被发现,随后被发现普遍存在于低GC 革兰阳性细菌中。SpxA1 和SpxA2 是变异链球菌氧化应激反应的重要调节因子,其中SpxA1 起主导作用。两者主要通过激活dpr、nox、sodA 和tpx 基因等氧化应激反应基因的表达来参与调控细菌氧化应激反应[14]。变异链球菌spxA1 基因突变株在与产过氧化氢的口腔链球菌共培养生物膜中竞争能力下降,在大鼠牙齿上定植能力受损,致龋毒力降低[15]。SpxA1 和SpxA2 蛋白质序列比对显示两者C端存在差异,SpxA1 含有异常数量的酸性残基。SpxA1 的转录受到金属调节因子PerR 和SloR 的共同抑制,而SpxA2 的转录主要依赖于包膜应力调节因子(envelope stress regulator)LiaFSR。作为LiaR调控子的一部分,SpxA2 在包膜压力条件下对变异链球菌的生长至关重要。此外,氧化还原传感(redox sensing)对于SpxA1 依赖的氧化应激反应的激活非常重要,对于SpxA2 介导的包膜应激反应是不可或缺的[16]。

4 谷胱甘肽途径

变异链球菌从细胞外环境摄入谷胱甘肽(glutathione,GSH)在其抵御氧化应激和调控相关蛋白功能中也具有重要作用。变异链球菌谷胱甘肽还原酶基因gor 缺陷株可以在有氧条件下生长,但在2 mmol/L 二酰胺存在环境中停止生长,相反野生型菌株的生长不受影响,谷胱甘肽还原酶活性增加了2.2 倍;此外,野生型菌株中的谷胱甘肽还原酶活性水平在暴露于空气后上调了3.6 倍,提示谷胱甘肽还原酶参与保护变异链球菌免受氧化应激胁迫[17]。变异链球菌谷胱甘肽双功能合成酶编码基因gshAB 基因编码具有谷氨酰半胱氨酸合成酶和谷胱甘肽合成酶功能域的蛋白质,在变异链球菌氧化应激与产H2O2细菌竞争中发挥重要作用。变异链球菌gshAB 基因缺陷株较野生株对H2O2更加敏感,与血链球菌共培养竞争能力显著降低。变异链球菌的谷胱甘肽转运蛋白GshT 和半胱氨酸ABC 输入蛋白TcyBC,从细胞外摄入的谷胱甘肽在防止细菌氧化损伤和调节蛋白质功能方面是至关重要的[18]。

近期研究发现蛋白质S-谷胱甘肽化在变异链球菌氧应激中发挥重要作用,这种翻译后修饰途径可以防止氧化应激条件下蛋白质半胱氨酸残基过度氧化导致的蛋白水解。硫氧还蛋白样蛋白Tlp(thioredoxin-like protein)Cys41 残基的谷胱甘肽化在变异链球菌抵御氧化应激、与血链球菌和戈登链球菌竞争中发挥重要作用;大鼠龋病模型发现S-谷胱甘肽化丧失会降低变异链球菌的致龋性[19]。

5 氧应激反应相关信号传导系统

5.1 双组分信号转导系统

双组分信号转导系统(two-component signal transduction systems,TCS)广泛存在于原核和真核细胞内,主要由膜相关组氨酸蛋白激酶(histidine kinase,HK)和响应调节蛋白(response regulator,RR)构成。HK 感受到外界环境信号后,促使RR 磷酸化,调节靶基因的表达,从而应对外界环境刺激[20]。目前已知14 个TCSs,包括ComDE、VicRK、CiaRH、LiaSR、LytST、Cid/Lrg 等,其中LytST、Cid/Lrg和VicRK 系统对于调控变异链球菌氧化应激反应至关重要。

LytST 包括传感器激酶LytS 和反应调节器LytT,参与LrgAB 蛋白表达调控。LrgAB 蛋白的表达与细菌氧化应激耐受性和菌种间竞争密切相关,变异链球菌lrgAB/lytST 基因缺失株在氧应激条件下生长速度显著降低,lrgAB 基因缺失株对氧敏感,与产H2O2的戈登链球菌竞争能力降低,外源性加入丙酮酸,可有效恢复细菌对氧的耐受能力[21]。Ahn 等[22]发现丙酮酸在变异链球菌生长过程中作为代谢产物被排出菌体外,当主要碳源耗尽时会通过LrgAB 蛋白将丙酮酸重新摄入细胞内。这种对于丙酮酸的重复利用受到葡萄糖浓度和稳定生长期lrgAB 水平的严格调控,而外源性或细菌源性H2O2影响lrgAB 基因的表达。以上研究提示TCS LytST 控制LrgAB 蛋白的表达,LrgAB 蛋白调控丙酮酸摄入,丙酮酸可以作为外源性氧化应激的缓冲剂,使细胞保持氧化还原平衡,维持细胞稳态。

Cid/Lrg 系统在变异链球菌响应外界环境刺激中发挥重要调控作用。该系统与细菌代谢通路密切相关,在不同的生长阶段、不同葡萄糖浓度和氧浓度状态下,cid 和lrg 呈现不同的表达模式,并受CcpA 和VicKR 双组分信号系统调控[23]。氧应激状态下,lrgAB 基因显著上调;cidB 突变株和lrgAB突变株在转录组水平上的变化具有相似性,TnSMU2 基因岛、CRISPR-Cas 系统、ABC 转运蛋白、感受态、细菌素、葡萄糖基转移酶、蛋白质合成、三羧酸循环、碳水化合物代谢相关的各种基因表达发生显著变化,提示Cid/Lrg 系统在变异链球菌响应氧应激中发挥重要调控功能[23]。近期一项研究发现cid 和lrg 启动子区域具有饥饿胁迫调节蛋白CodY 结合位点,凝胶迁移滞后实验和启动子报告基因实验提示CodY 直接介导cid 和lrg 操纵子表达;过表达CodY 对lrgAB 表达无显著影响,但是CodY 缺失影响lytST 基因过表达菌株中lrgAB 表达,提示CodY 在LytST 介导的lrgAB 基因表达调控中扮演重要角色。此外,CodY 与CcpA 蛋白共同影响细菌对丙酮酸的摄入和利用,从而促使细菌更好的应对外界环境变化和体内代谢水平变化[24]。

VicRK 双组分信号系统参与调控变异链球菌氧化应激反应。VicR 为细胞质内RR,VicK 为HK,细胞外环境刺激信号由VicK 的N 末端输入域感受后,细胞质信号域内约200 个保守组氨酸残基发生自磷酸化,磷酸基团由VicK 传递给同源的VicR 上特异的天冬氨酸残基,激活DNA 结合蛋白与相应的靶基因结合,上调或下调基因表达产物[25]。敲除vicK 基因后,突变株对H2O2更加敏感。VicK 可在Mn 离子存在的条件下对非同源应激调节反应调节蛋白GcrR(non-cognate stress regulatory response regulator)进 行 转 磷 酸 化(transphosphorylate),VicR 与GcrR 共转录;Mn 离子参与SloR 介导的金属调控作用,sloR 基因突变株中vicRK 基因显著下调,提示VicRK 与GcrR 相互作用在细菌应对外界氧应激等环境压力中具有重要作用[26]。此外,VicRK 系统还能通过调控基因表达,影响变异链球菌细胞外多糖合成、生物膜形成等重要毒力作用,对变异链球菌致龋性具有重要调控作用[26]。

5.2 杂合非核糖体多肽合成酶-聚酮合成酶系统

杂合非核糖体多肽合成酶-聚酮合成酶系统(hybrid nonribosomal peptide synthetase-polyketide synthasesystem,PKS-NRPS)是具有模块结构的多功能巨型酶,介导合成许多重要的微生物次级代谢产物,如红霉素、青霉素等。该系统在7 种乳酸乳球菌和25 种致龋变异链球菌中展现出相似的基因、模块和结构组成[27]。变异链球菌拥有多个NRPS-PKS 生物合成基因簇,如mub 基因簇合成mutanobactin,muc 基因簇合成mutanocyclin,muf 基因簇合成mutanofactin,参与调控细菌氧应激、菌种间竞争和生物膜形成等多项生理活动[28]。

变异链球菌UA159 TnSmu2 基因岛,又称mub基因簇,由TetR 家族转录因子SMU_1349(MubR)转录激活。变异链球菌拥有其它口腔细菌中不存在的mub 基因簇,可合成mutanobactin 抵御氧刺激。mub 缺失菌株对氧和H2O2敏感,与产H2O2细菌共培养其竞争能力下降,在有氧环境中的生物膜形成能力降低[29]。变异链球菌cidB 突变体具有粗糙型和光滑型两种菌落形态,光滑型突变体对氧化应激耐受能力更强;转录组测序发现光滑型突变体具有TnSmu2 基因岛,提示该基因岛存在有利于变异链球菌抵御氧胁迫[29]。SMU_833 的缺失导致细胞外DNA 依赖性细菌聚集,该突变株更容易受到氧化应激的影响,与产H2O2的口腔链球菌共培养竞争力降低;定量蛋白质组学分析显示,SMU_833 缺陷株会导致产mutanobactin 的基因簇编码的10 种蛋白质显著下调。与SMU_833 突变株相似,mutanobactin 基因簇的缺失使突变体对产H2O2链球菌的竞争力降低,提示杂合NRPS-PKS 系统编码的次级代谢产物mutanobactin 在变异链球菌氧应激反应中具有重要作用[30]。

5.3 环二腺嘌呤核苷酸信号系统

课题组前期研究发现环二腺嘌呤核苷酸(cyclic diadenosine monophosphate,c-di-AMP)也参与调控变异链球菌氧应激反应[31]。c-di-AMP 是2008 年发现的一种细菌第二信使分子。由ATP 或ADP 经腺苷酸环化酶(diadenylate cyclase,CdaA)催化合成,经磷酸二酯酶(Phosphodiesterase,PDE)分解为pApA 或AMP。c-di-AMP 参与调控细菌多项生理活动,而且能够被宿主识别并诱导免疫应答,成为细菌性感染药物和疫苗研究的新靶点[32]。研究发现c-di-AMP 通过与受体蛋白KtrA、CpaA、KdpD 等结合,调控细菌钾离子运输,利于细菌适应外界高渗或低渗环境;c-di-AMP 参与调控细菌应答冷热刺激、酸应激和氧应激能力,提示c-di-AMP 在细菌应答环境胁迫方面具有重要调控作用[33]。在变异链球菌中,c-di-AMP 调控细胞壁稳定性,通过与Cab-PA/VicR 复合体相互作用调控gtfs 表达影响细胞外多糖合成和生物膜形成,并参与调控细菌氧化应激反应[32]。敲除c-di-AMP 合成酶基因cdaA,突变株对氧敏感,与血链球菌共培养,其竞争能力显著减弱,加入过氧化氢酶后,竞争能力得到恢复。△cdaA 全基因组测序结果显示mub 基因簇多个基因显著下调,与变异链球菌响应氧应激密切相关的sod、nox-1、dprA等基因表达量无明显变化,提示c-di-AMP信号系统参与调控变异链球菌氧应激反应[31]。

6 小结与展望

变异链球菌通过合成还原酶、调控金属离子和谷胱甘肽摄入,通过双组分信号转导系统、c-di-AMP 等信号系统调控作用等多种途径进行对抗。外源性氧刺激或细菌源性H2O2可抑制变异链球菌生长、调控产酸和细胞外多糖合成等毒力基因表达,降低其致龋能力。对变异链球菌氧化应激调控作用的进一步认识,可通过针对关键信号通路设计靶向小分子化合物等途径,抑制其氧化应激功能,削弱毒力,从而控制龋病发生发展。

【Author contributions】 Ning J wrote the article. Hu X and Cheng XQ revised the article. All authors read and approved the final manuscript as submitted.

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