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玉米ZmWRKY36基因的生物信息学及功能分析

2023-02-20王文丽穆春华张发军刘霞冷冰莹姚国旗闫振伟刘巍王昀张恩盈

山东农业科学 2023年12期
关键词:生物信息学分析功能分析盐胁迫

王文丽 穆春华 张发军 刘霞 冷冰莹 姚国旗 闫振伟 刘巍 王昀 张恩盈

摘要:作为植物转录因子家族最大的成员之一,WRKY蛋白在植物的生长发育、防御反应以及胁迫响应中都发挥着极为关键的作用。本研究以玉米自交系B73为材料,克隆了一个玉米WRKY转录因子ZmWRKY36,并对其进行生物信息学与功能分析。结果表明,ZmWRKY36基因的开放阅读框为1 002 bp,编碼333个氨基酸。ZmWRKY36蛋白分子量为35.8 kDa,理论等电点为5.66,属于酸性蛋白;不稳定系数为67.16,为极不稳定蛋白;亲水指数为-0.526,为亲水性蛋白;具有1个WRKY结构域和1个C2HC锌指结构基序,属于WRKY转录因子Ⅲ类亚家族成员;与高粱SbWRKY64、稷PmWRKY4和狗尾草SvWRKY4有着较近的亲缘关系。进一步分析发现,ZmWRKY36蛋白定位于细胞核内,并且有着较强的转录激活活性。qRT-PCR结果显示,ZmWRKY36基因在玉米根和叶中表达量较高,具有组织特异性;并且受到干旱胁迫和盐胁迫的显著诱导,表明转录因子ZmWRKY36可能在玉米抵御外界干旱胁迫和盐胁迫的过程中发挥着重要作用。

关键词:玉米;ZmWRKY36;生物信息学分析;功能分析;干旱胁迫;盐胁迫

中图分类号:S513:Q78 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2023)12-0001-08

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