APP下载

ADAM33基因T2位点多态性与支气管哮喘易感性的关联研究*

2023-01-29常永莉张莉媛王惠琴陈方园李天浩

检验医学与临床 2023年1期
关键词:等位基因多态性基因型

常永莉,张莉媛,王惠琴,王 冰,陈方园,李天浩

陕西中医药大学第二附属医院,陕西咸阳 712000

支气管哮喘是临床常见呼吸系统疾病,呈家族聚集性,多种细胞及细胞组分参与发病,与多基因遗传有关。有资料显示,全球约有3亿人患有支气管哮喘,在我国有超过3 000万人患有支气管哮喘,该病发病率较高,严重影响患者生命质量[1-2]。支气管哮喘的病因尚不明确,多认为环境暴露、遗传易感性相互作用决定着该病的发生和发展:环境因素是导致支气管哮喘发生及发展的重要因素,患者健康状况、精神心理状态、免疫状态、遗传因素等是影响易感性的重要因素,也是支气管哮喘发生、发展的主观条件[3-4]。许多研究者致力于支气管哮喘的遗传病因学研究,并试图证明支气管哮喘的易感基因,由此帮助人们了解支气管哮喘的病理过程。解整合素-金属蛋白酶33(ADAM33)是膜锚定蛋白,参与细胞-基质、细胞-细胞相互作用的各种生物过程,ADAM33基因单核苷酸多态性是近年研究热点。有研究探讨了支气管哮喘易感性、病情严重程度等与ADAM33基因单核苷酸多态性的关系,然而所得结果不尽相同,存在一定差异[5-6],故本研究旨在探讨ADAM33基因T2位点多态性与支气管哮喘易感性的关联性,现报道如下。

1 资料与方法

1.1一般资料 选取2019年12月至2020年12月在本院就诊并接受治疗的支气管哮喘患者120例作为研究对象,纳入研究组。患者年龄20~60岁、平均(38.62±5.51)岁,男61例、女59例。纳入标准:(1)支气管哮喘诊断符合《支气管哮喘防治指南》(2016版)[7]标准,处于急性发作期;(2)年龄>18岁;(3)临床病历资料及随访资料完整。排除标准:(1)合并肝、心、肾等脏器病变及血液系统等疾病者;(2)合并恶性肿瘤、自身免疫性疾病、呼吸系统疾病者;(3)有血液系统疾病既往史者;(4)精神障碍无法正常沟通者。对纳入的患者进行病情分级后分组:轻度为步行、上楼时气短,可平卧,讲话可连续成句,呼吸频率轻度增加,呼吸末期有哮鸣音;中度为稍活动后出现气短,喜坐位,讲话以单词为主,时有焦虑或烦躁情绪,出汗,呼吸频率增加,可有辅助呼吸肌活动及三凹征,哮鸣音响亮、弥漫;重度为休息时出现气短,端坐呼吸,讲话以单字为主,常有焦虑、烦躁情绪,大汗淋漓,呼吸频率超过30次/分,常有辅助呼吸肌活动及三凹征,哮鸣音响亮、弥漫;危重为不能讲话,意识模糊或嗜睡,胸腹矛盾运动,哮鸣音减弱乃至无。以上判断标准只需符合某一程度的某项指标即可分级,无须满足全部指标。将研究组分为轻度组(33例),中度组(22例),重度组(34例),危重组(31)例。选取同期在本院体检的健康人群120例为对照组,年龄20~59岁、平均(38.53±5.41)岁,男62例、女58例。对照组研究对象无长期慢性咳嗽、呼吸困难、气喘等哮喘类症状及病史,无个人过敏疾病史及过敏反应家族史。两组性别、年龄等一般资料比较,差异无统计学意义(P>0.05),具有可比性。本研究经本院医学伦理委员会批准,所有研究对象均同意本研究并签署知情同意书。

1.2方法

1.2.1标本采集 抽取两组研究对象肘静脉血5 mL,加入乙二胺四乙酸二钠进行抗凝,将标本放于-80 ℃冰箱保存。

1.2.2基因组DNA提取 将标本取出,常温下放置1~2 h融解,取标本300 μL,加入细胞裂解液450 μL,封闭后用力震荡,充分混合后采用离心机(济南好来宝医疗器材有限公司,TGL-16M)以8 000 r/min离心3 min,取细胞核沉淀物,加入缓解液GS 200 μL,震荡至完全结合。样品中加入蛋白酶K溶液15 μL,采用涡旋机(广州思硕机电设备有限公司,OX-0.66/8)涡旋6 s,加入缓冲液GB 15 μL,摇晃充分后,放入65 ℃水浴锅(北京京创泰宁伟业科技发展有限公司,DZKW-A)恒温5 min,充分摇晃至溶液变清亮。加入70%乙醇溶液200 μL,充分摇晃至出现沉淀物,将沉淀物放置于离心管,8 000 r/min离心1 min,倒弃溶液,加入缓冲液GD 500 μL,8 000 r/min离心1 min,倒弃溶液,加入漂洗液PW 650 μL,8 000 r/min离心1 min,倒弃溶液,再加入漂洗液PW 500 μL,8 000 r/min离心1 min,倒弃溶液,再8 000 r/min离心3 min,倒弃溶液。于室温倒置离心管于滤纸上,晾干沉淀物,加入洗脱缓解液300 μL,轻微震荡,放置于37 ℃恒温水浴锅12 h,收集溶液,采用基因组DNA提取试剂盒(北京索莱宝生物科技有限公司)提取基因组DNA。

1.2.3等位基因特异性聚合酶链反应(PCR) PCR反应体系20.0 μL:提取基因组DNA 1.0 μL,上、下游引物共0.32 μL,2.5 mmol/L dNTP 1.6 μL,TaqDNA聚合酶(TaKaRa公司)0.1 μL,10×Buffer 2.0 μL,二甲基亚砜1.0 μL,荧光染料Rox 0.2 μL,荧光染料SYBR 0.2 μL,超纯净水13.18 μL,氯化镁(MgCl2) 0.4 μL。反应条件:变性,温度95 ℃,时间3 s;退火,温度95 ℃,时间15 s;延伸,温度60 ℃,时间45 s,35个循环;终末延伸,温度72 ℃,时间10 min。PCR产物扩增选择德国Eppendorf公司的实时荧光定量PCR系统,PCR产物长度为211 bp。上游引物:5′-CCCCAAGAAACTCAGTAAACG-3′;下游引物:5′-GAGAAATGGTGGAGGGTAAAT-3′。采用限制性内切酶NaR1进行T2位点检测,总体系为20.0 μL,其中10×Buffer 2.0 μL,去离子水7.0 μL,限制性内切酶1.0 μL,成功扩增的PCR产物10.0 μL。放置于37 ℃恒温箱过夜,逐一滴入2.5%琼脂糖凝胶梳孔,于电压槽80 W电压下进行电泳30 min,于凝胶成像仪保存后进行图片分析。

1.2.4DNA序列测定 采用遗传分析仪(北京中盾安民分析技术有限公司,GA118-16A)对扩增好的PCR产物进行测序,并采用NCBI的BLAST软件与数据库进行同源性分析,验证正确性。

1.3统计学处理 采用SPSS13.0统计软件进行数据处理和分析。计数资料以例数或率表示,Hardy-Weinberg平衡定律检验、等位基因频率和组间基因型频率的比较采用χ2检验,ADAM33基因T2位点等位基因分布与支气管哮喘患病之间的关联、哮喘患者严重程度与其T2位点多态性的关系采用Logistic回归进行分析。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1两组ADAM33基因T2位点Hardy-Weinberg平衡定律检验 采用Hardy-Weinberg平衡定律检验公式χ2=(O-C)2/C计算ADAM33基因T2位点3种基因型(AA、AG、GG)χ2值,发现研究组和对照组ADAM33基因T2位点均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。见表1。

表1 两组ADAM33基因T2位点Hardy-Weinberg平衡定律的检验

2.2两组ADAM33基因T2位点基因型频率比较 研究组与对照组ADAM33基因T2位点基因型(AA、AG、GG)频率比较,差异均有统计学意义(χ2=7.001,P<0.05)。见表2。

表2 两组ADAM33基因T2位点基因型频率比较[n(%)]

2.3两组ADAM33基因T2位点等位基因频率分布比较 ADAM33基因T2位点等位基因频率分布比较中,研究组A等位基因频率(15.42%)低于对照组(23.75%),差异有统计学意义(P<0.05);Logistic回归分析结果提示,ADAM33基因T2位点A等位基因频率降低可提升支气管哮喘患病风险(OR=0.875;95%CI:0.758~0.920,范围包括1,P>0.05)。见表3。

表3 两组ADAM33基因T2位点等位基因频率分布[n(%)]

2.4支气管哮喘患者严重程度与ADAM33基因T2位点多态性的关系 轻度组患者ADAM33基因T2位点AG基因型频率(9.09%)低于中度组患者(36.36%)、重度组患者(32.35%)、危重组患者(41.94%),差异有统计学意义(χ2=6.136、5.482、9.197,P<0.05);中度组患者ADAM33基因T2位点AG基因型频率与重度组患者、危重组患者比较,差异无统计学意义(P>0.05)。Logistic回归分析结果显示,ADAM33基因T2位点AG基因型频率增加是影响支气管哮喘严重程度的高危因素(OR=1.581;95%CI:1.118~1.453;P<0.05)。见表4、5。

表4 支气管哮喘患者严重程度与ADAM33基因T2位点多态性的关系(n)

表5 影响支气管哮喘严重程度的多因素Logistic回归分析

3 讨 论

支气管哮喘是由环境因素及遗传因素共同作用引起的气道慢性炎症。近年来,我国支气管哮喘发病率逐年增加,给患者、家属及社会带来沉重负担。大多数支气管哮喘患者经过吸入激素、支气管扩张剂等药物进行规范、足疗程的治疗可完全控制病情,但仍然有部分支气管哮喘患者病情难以控制,且病情迁延难愈,易复发。因此,研究支气管哮喘发病机制对该病的临床诊断及治疗具有重要意义[8-10]。当环境因素损伤正常气道时,气道会启动组织修复及炎性反应,然而,对支气管哮喘而言,患者对气道损伤的敏感度降低,支气管组织修复的效率较低,修复进程较慢,这加重了支气管哮喘患者气道炎性反应,以及促进了气道重构[11]。气道、血管和上皮平滑肌纤维增生,上皮下基底膜纤维化,气道气流受限是支气管哮喘患者常见的病理学改变,由此产生气道重塑和不可逆性狭窄[12-13]。支气管哮喘还受多基因遗传的影响,研究发现支气管哮喘的发生及发展与多种易感基因密切相关[14]。

近年发现的支气管哮喘易感基因为ADAM33基因,ADAM33丰富地表达于间质细胞及平滑肌细胞,较少表达于上皮细胞。ADAM33基因位于20号染色体短臂(20p13),包含21个内含子和22个外显子,跨度为14 kb,ADAM33中包含813个氨基酸,通过内肽酶切割为成熟蛋白。ADAM33前体蛋白含有细胞内糖蛋白结构域、跨膜结构域、解整合素结构域、金属蛋白酶结构域等保守的结构域,通过这些结构域在信号传导、细胞融合、金属蛋白酶活性调控等方面起重要作用。研究表明,支气管哮喘患者肺功能下降及气道高反应性与ADAM33蛋白水解酶活性提升相关,ADAM33蛋白水解酶参与气道重塑和不可逆性狭窄等病理过程[15-17]。支气管哮喘主要是由于气道气流受阻、气道平滑肌纤维增生等,导致气道重塑和不可逆性狭窄,而ADAM33 mRNA在支气管平滑肌细胞、肌纤维母细胞、成纤维细胞中呈高表达状态,提示支气管哮喘患者气道重塑和不可逆性狭窄很可能与ADAM33基因有关[18]。PUXEDDU等[19]发现,ADAM33基因可促进血管生成,ADAM33基因是组织重塑基因,与气道重塑有关。

研究显示,ADAM33基因的单核苷酸多态性与支气管哮喘的遗传易感性有关,T2位点位于第20个外显子,第744个氨基酸由脯氨酸变为丝氨酸,碱基改变是由A替代G,单核苷酸多态性存在连锁不平衡,ADAM33基因中的哪个单核苷酸多态性在支气管哮喘中起主导作用难以确定[20-22]。本研究对研究组和对照组ADAM33基因T2位点3种基因型进行Hardy-Weinberg平衡定律检验,结果均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05),说明两组试验对象有很好的均衡性。研究组与对照组ADAM33基因T2位点基因型(AA、AG、GG)频率比较,差异均有统计学意义(P<0.05),说明ADAM33基因T2位点与支气管哮喘易感性有关。

JONGEPIER等[23]随访支气管哮喘患者20年,分析ADAM33基因的9种单核苷酸多态性对患者肺功能的影响,发现ADAM33基因不仅与支气管哮喘易感性有关,还与支气管哮喘患者疾病严重程度密切相关。本研究对危重、重度、中度、轻度支气管哮喘患者进行ADAM33基因T2位点基因型频率分析,结果显示,中度、重度、危重支气管哮喘患者ADAM33基因T2位点AG基因型频率高于轻度支气管哮喘患者,差异均有统计学意义(P<0.05),提示ADAM33基因T2位点AG基因型频率增加是影响支气管哮喘严重程度的高危因素(P<0.05)。ADAM33基因T2位点等位基因中,研究组A等位基因频率(15.42%)低于对照组(23.75%),差异有统计学意义(P<0.05),提示ADAM33基因T2位点A等位基因频率增加可降低支气管哮喘患病风险(OR=0.875,P<0.05)。李晓等[24]对重度、中度、轻度支气管哮喘患者进行ADAM33基因T2位点基因型频率及基因分布分析,发现T2位点等位基因中,支气管哮喘患者A等位基因频率高于健康人群,重度和中度支气管哮喘患者AG基因型频率均高于轻度支气管哮喘患者,得出罹患支气管哮喘的高危因素是A等位基因频率增加,影响支气管哮喘严重程度的高危因素是AG基因型增加,与本研究结果有所不同。

综上所述,支气管哮喘与ADAM33基因位点多态性存在关联:ADAM33基因T2位点与支气管哮喘易感性有关,ADAM33基因T2位点A等位基因频率增加可降低支气管哮喘的患病风险,ADAM33基因T2位点AG基因型是影响支气管哮喘严重程度的高危因素。今后研究可选择更多位点探讨ADAM33基因单核苷酸多态性与支气管哮喘的关联,探讨其在支气管哮喘中的发病机制。

猜你喜欢

等位基因多态性基因型
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
WHOHLA命名委员会命名的新等位基因HLA-A*24∶327序列分析及确认
马铃薯cpDNA/mtDNA多态性的多重PCR检测
DXS101基因座稀有等位基因的确认1例
GlobalFiler~? PCR扩增试剂盒验证及其STR遗传多态性
西安地区育龄妇女MTHFRC677T基因型分布研究
BAMBI基因敲除小鼠的繁育、基因型鉴定
CYP3A4*1G基因多态性及功能的初步探讨
等位基因座D21S11稀有等位基因32.3的确认