克隆单子叶植物启动子及功能验证
2022-02-02卢凌霄高珊于洋王银月邹春野于鸿雪吕小飞
卢凌霄,高珊,于洋,王银月,邹春野,于鸿雪,吕小飞
(辽源市农业科学院,吉林 辽源 136200)
1 材料
1.1 植物材料
常规水稻、哥伦比亚生态型(Columbia,Col)拟南芥(Arabidopsis thaliana)种子均由本实验室保存。
1.2 质粒与菌株
中间载体pUC-19、黄色荧光融合瞬时表达载体pSAT6-EYFP 均由本实验室保存,pEASY-T5 cloning vector 购于北京Transgen 公司,大肠杆菌Trans1-T1 感受态细胞购于北京Transgen 公司。
1.3 试剂盒
PCR 扩增所需引物均在上海生工生物工程公司合成,KOD FX 及rTaq 购买于TOYOBO 生物技术公司,各种DNA 限制性内切酶、T4 连接酶均购买于美国New England Biolabs(北京)公司,DNA Marker 和蛋白Marker 购买于TaKaRa 公司。
质粒提取试剂盒购于GeneStar 公司,DNA 胶回收试剂盒购于Omega 公司。
2 试验方法
2.1 克隆启动子
1)Act2-1启动子克隆。CTAB法提取水稻总DNA,NCBI检索Os Actin2-1 序列(GenBank:EU259512.1 1 008 bp),设计引物,分段PCR 法扩增目标片段P1(880 bp)、P2(120 bp),胶回收片段P1、P2,T4 DNA 连接酶连接两片段得到完整Actin2-1 启动子,克隆载体测序与目标序列比对。启动子序列中存在一个PstI 酶切位点,影响后续载体构建,设计引物突变掉克隆所得片段中的PstI 酶切位点,见表1。
表1 设计引物序列
2)Ubi 启动子改造。玉米Ubiquitin 启动子为实验室保存,序列中有一个EcoR I 酶切位点,影响后续载体构建,需设计引物将酶切位点钝化,改造后的Ubi 启动子需进行功能验证。
2.2 启动子功能验证
2.2.1 黄色荧光瞬时表达载体构建
利用 In-Fusion 方法构建瞬时表达载体pACT-EYFP 和pUBI-EYFP,利用AgeI 和EcoR V 酶切位点以In-Fusion 无缝克隆方法将35S 启动子分别替换为克隆并改造得到的Act2-1 和Ubi 启动子,利用QIAGEN 大提质粒试剂盒提取质粒。
2.2.2 原生质体制备及瞬时转化所需母液
配制200 mL 0.8 mol/L 甘露醇,0.2 mol/L MES,1 mol/L CaCl2,1 mol/L KCl,2 mol/L MgCl2,5 mol/L NaCl,50 mL 10%BSA,灭菌室温保存。
2.2.3 配制工作液
1)酶解液(20 mL):取0.2 mol/L MES 母液20 mL于70 ℃预热3 min后,加入1.5%Cellulase R10、0.4%Macerozyme R10、0.4 mol/L mannitol、1 mol/L KCl 母液0.4 mL,55 ℃水浴10 min,冷却后加入1 mol/L CaCl2200 μL、10%BSA 200 μL。
2)W5 溶液(100 mL):取0.2 mol/LMES 1 mL、5 mol/L NaCl 6.16 mL、1 mol/L CaCl212.5 mL、1 mol/L KCl 500μL,加入灭菌的ddH2O 至100 mL。
3)MMG 溶液(100 mL):取0.2 mol/L MES 2 mL、0.8mol/L mannitol 50 mL、2 mol/L MgCl21.5 mL,加入灭菌的ddH2O 至100 mL。
4)WI 溶液(100 mL):取0.2 mol/L MES 2 mL、0.8 mol/L mannitol 62.5 mL、1 mol/L KCl 2 mL,加入灭菌的ddH2O 至100 mL。
5)PEG 溶液(10 mL):称取PEG4 g、0.2 mol/Lmannitol 1 mL、1 mol/L CaCl21 mL,加入灭菌的ddH2O 8 mL,55 ℃水浴促进溶解,提前1 h 配制。
2.2.4 制备拟南芥原生质体,并瞬时转化表达载体
1)剪取21 d 左右的未抽薹拟南芥叶片,用刀片将叶片切成细条,浸于5 mL 酶解液中,轻轻摇晃。
2)放入25 ℃培养箱中,用锡箔纸包住避光酶解3 h 后形成绿色酶/原生质体溶液,期间可以汲取少量液体在显微镜下观察原生质体状态。
3)加入W5 溶液5 mL,用75 μm 过滤筛过滤到圆底离心管中。
4)使用水平低速离心机,配平后100 rpm 离心2 min,小心吸出上清液。
5)加入W5 溶液2 mL 重悬,冰上放置30 min,原生质体会沉降至管底。
6)小心吸出清液,加入MMG 溶液2 mL 重悬,按转化的质粒数均匀地分到无菌的离心管中。
7)按每100 μL 原生质体细胞转化1 μg 质粒,将质粒稀释后加到原生质体细胞中,轻轻混匀后,缓慢加入PEG 溶液110 μL(边加边混匀),避光放置10 min。
8)加入W5 溶液400 μL,轻轻混匀后,终止转化反应。
9)以离心力100 g 离心2 min,吸出上清液,加入WI 溶液1 mL 重悬,转移到培养板中。
10)25 ℃避光过夜孵育。
11)取100 μL 溶液于激光共聚焦显微镜下观察启动子启动表达荧光蛋白的情况。
3 结果与分析
3.1 Act2-1 启动子的克隆、改造及测序结果分析
PCR 扩增出的P1、P2 片段进行琼脂糖凝胶电泳,见图1(a),HindⅢ和BamHⅠ双酶切中间载体pUC-19,与酶切处理过的P1、P2 片段连接,获得pUC-Act,菌落PCR 和双酶切验证,见图1(b)和图1(c)。
使用突变PstI 位点引物PCR 扩增,可分别得到830 bp 和210 bp 的两个片段,见图1(d),回收两个片段作为模板扩增得到突变了酶切位点的完整Act2-1启动子片段,回收片段连接到克隆载体pEASY-Blunt Zero上,进行菌落PCR 和双酶切验证,经测序验证获得突变了PstI 位点完整Act2-1 启动子,见图2。
图1 Act2-1 启动子的克隆
图2 Act2-1 启动子序列
3.2 Ubi 启动子的改造及测序结果分析
Ubi 启动子全长2 035 bp,使用钝化酶切位点EcoR I 引物扩增两片段大小分别为1 415 bp、651 bp,回收两个片段作为模板,使用上下游引物第二轮扩增出Ubi 启动子全长,连接到克隆载体上挑选阳性克隆进行测序,获得突变EcoR I 酶切位点的Ubi 启动子。
3.3 黄色荧光瞬时表达载体构建及启动子启动荧光蛋白表达能力观察
利用In-Fusion 方法构建表达载体pACT-EYFP和pUBI-EYFP,大提质粒。与携带35s 启动子的对照载体一起瞬时转化到拟南芥原生质体,激光共聚焦显微镜下观察启动子是否能正常启动黄色荧光蛋白表达。对照35S::YFP 能够正常表达荧光蛋白,经克隆改造得到的Act2-1 和Ubi 启动子也均观测到黄色荧光蛋白,见图3,证明试验所得启动子具有启动蛋白表达功能。
图3 拟南芥原生质体瞬时表达黄色荧光蛋白
4 结论
根据NCBI 检索Os Actin2-1 序列,PCR 法克隆得到Actin2-1 启动子,与检索序列同源性达100%,在此基础上突变掉碍于下一步载体构建的酶切位点,得到新的Act2-1 启动子;在已有的玉米Ubiquitin 启动子基础上使用PCR 法突变掉EcoR I 酶切位点,使其便于下一步自有载体构建体系的应用。
使用拟南芥原生质体瞬时转化Act2-1、Ubiquitin启动子构建的黄色荧光瞬时表达载体,以黄色荧光蛋白基因作为报告基因,激光共聚焦显微镜下观察瞬时转化的原生质体,可观测到黄色荧光蛋白的表达,证明克隆得到的新启动子具有启动功能,可以用于单子叶植物表达载体的构建。