Filmarray全自动医用PCR分析系统检测临床疑似呼吸道感染患者的数据分析*

付晓蕊，康蓓佩，贺文芳，张鹏亮，周 磊

空军军医大学第一附属医院检验科，陕西西安 710032

急性呼吸道感染在社区和医院较为常见，尤其是近年来，禽流感病毒、严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒、新型冠状病毒的大肆出现[1]，让人类对呼吸道病毒相关传染性疾病的关注度不断上升[2-3]。当前，呼吸道病毒感染检测主要靠PCR[4]，灵敏度和特异度高。本研究应用的Filmarray全自动医用PCR分析系统可检测17种呼吸道病毒和3种细菌/非典型病原体，包括人呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、甲型流感病毒H1型、甲型流感病毒H3型、甲型流感病毒H1N1-2009型、乙型流感病毒、腺病毒、副流感病毒1～4型、人鼻/肠病毒、人冠状病毒(hCoV)-OC43、hCoV-229E、hCoV-NL63、hCoV-HKU1、百日咳鲍特菌、肺炎衣原体、肺炎支原体等[5-7]。

目前，临床上对病毒性感染的关注度还不够高，存在一定程度上的认识不足、观念落后、意识淡薄。全球每年新发病毒型肺炎200多万例，成人和儿童各100多万例，亟须临床医生加强应对能力。本研究旨在分析本院常见呼吸道相关病原体检测结果，明确相关病原体感染类型，从而缩短诊断时间，为临床呼吸道病原体感染快速诊断提供依据。

1 资料与方法

1.1一般资料 选取2016年8月至2019年6月本院诊治的发热、咳嗽，疑似呼吸道感染的患者(0～89岁)231例为研究对象，其中住院患者160例(呼吸科患者98例，非呼吸科患者62例)，门诊患者71例；0～<10岁15例，10～<20岁8例，20～<30岁18例；30～<40岁21例，40～<50岁31例，50～<60岁38例，60～<70岁42例，70～<80岁37例，80～89岁21例；检测标本包括咽拭子164例、支气管肺泡灌洗液38例、痰液29例。本研究经本院医学伦理委员会批准，所有患者均知情同意并签署知情同意书。

1.2方法 采集痰液、咽拭子及支气管肺泡灌洗液，放入转运培养基中；痰液及支气管肺泡灌洗液留取在无菌痰杯中，及时送检。标本运输和储存条件：室温下最多保存4 h，2～8 ℃最多保存3 d，-15 ℃下最多保存30 d，标本避免反复冻融。

采用Filmarray快速呼吸道病原体检测试剂盒(法国生物梅里埃公司)同步对多种呼吸道病原体的核酸进行扩增与检测，严格按照产品说明书进行操作。在检测结果的基础上再次分析其基本病历资料和临床感染相关指标，比如基础疾病、发热情况、住院时间、生化指标和炎症指标等。

1.3统计学处理 采用SPSS26.0统计软件进行数据处理和分析，不呈正态分布的计量资料以中位数和四分位数[M(P25，P75)]表示，组间比较采用秩和检验；计数资料以例数和百分率表示，组间比较采用χ2检验。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1住院和门诊患者呼吸道病原体分布情况 住院患者呼吸道病原体检测总例数为160例，阳性61例，阳性率为38.13%；其中呼吸科患者检测总例数最多，占61.25%，阳性35例，阳性率为35.71%；儿科患者阳性率最高，为77.78%。门诊患者检测总例数为71例，阳性26例，阳性率为36.62%；其中急诊科患者检测总例数最多，占32.39%，阳性9例，阳性率为39.13%，感染科和儿科患者阳性率较高，均为50.00%。见表1、2。

表1 住院患者呼吸道病原体分布情况

表2 门诊患者呼吸道病原体分布情况

2.2各年龄段呼吸道病原体分布情况 0～<10岁年龄段患者为易感人群，阳性率最高，为80.00%，各年龄段呼吸道病原体分布情况见表3。

表3 各年龄段呼吸道病原体分布情况

2.3呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者基本病历资料比较 呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者在年龄、吸烟、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、体温、咳嗽、肌肉痛或疲劳、咳痰、平均住院时间比较，差异有统计学意义(P<0.05)，见表4。

表4 呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者基本病历资料比较

2.4呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者临床相关指标比较 呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者白细胞计数、B型脑钠肽水平比较，差异有统计学意义(P<0.05)，见表5。

表5 呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者临床相关指标比较

2.5Filmarray 检测的多项阳性结果 共检测出阳性标本87例，单一病毒感染标本52例，其中检出最多的是鼻/肠病毒22例，占42.31%；2种病毒合并感染19例，3种病毒合并感染14例，4种病毒合并感染2例。检测标本中包括2例暂未判断出型别的甲型流感病毒，即甲型流感病毒核酸检测阳性，但因为反应测试条中引物的局限性不能做出型别判定，需送市级疾控中心检测，后咨询市级疾控中心回报流感H5N1型。见表6。

表6 Filmarray 检测多项阳性结果

3 讨 论

Filmarray全自动医用PCR分析系统是一个多功能集成的快速病原体检测设备，允许检测17种呼吸道病毒和3种细菌/非典型病原体，Filmarray系统呼吸道感染模块操作仅需要5 min的人工标本处理和65 min的仪器检测时间，快速方便、特异度和灵敏度高[8-9]，可以快速向临床报告检测结果，是一种新的分子即时检测方法。

本研究结果显示，本院住院患者呼吸道病原体阳性率为38.13%，低于华山医院的检测结果[10]。其中呼吸科患者检测阳性例数最多(35例)，阳性率为35.71%，儿科患者阳性率最高，为77.78%，与后面的年龄分布统计结果0～<10岁的患儿阳性率80.00%相吻合，与国内外研究报道基本一致[11-14]。0～<10岁的儿童为每年呼吸道感染易感人群[15]，并且以常见的鼻/肠病毒、副流感病毒和呼吸道合胞病毒多见，这提示0～<10岁儿童呼吸道病毒性感染不容忽视，需作好相关病毒性感染的宣传教育活动。本院门诊患者急诊科检测呼吸道病原体总例数最多，占32.39%，阳性9例，阳性率为39.13%，提示对于急诊患者快速高效的呼吸道相关病原体检测十分有必要，能迅速明确感染类型，便于医生诊断和临床用药。

本研究中呼吸科住院患者与非呼吸科住院患者的年龄、吸烟、COPD、体温、咳嗽、肌肉痛或疲劳、咳痰，以及白细胞计数、B型脑钠肽水平比较，差异有统计学意义(P<0.05)，提示有呼吸系统相关症状的患者出现呼吸系统疾病的概率会比其他患者要大一些，应密切关注。

除此之外，本研究共检测出阳性标本87例，鼻/肠病毒检测阳性率最高，共检出33例，占37.93%。检测结果可以通过样品和质控品的反应曲线读取，但也有碰到部分检测标本中包括暂未判断出型别的甲型流感病毒，即甲型流感病毒核酸检测阳性，但因为反应测试条中引物的局限性不能做出型别判定，需送市级疾控中心检测，这对发现检测试剂条范围以外的相关性感染也有一定的提示作用。

Filmarray全自动医用PCR分析系统有其独特的优势，比如患者受肺炎支原体、肺炎衣原体、非典型病原体、百日咳鲍特菌感染困扰，因其培养条件苛刻常规实验室无法快速明确病原体，而此方法可以很快向临床报告结果，还可以同时检测到多种呼吸道相关病原体感染，对疑难病例有重要临床指导价值，便于医生及时了解患者感染状态，全面防控相关病原体感染。但因其费用昂贵，一般情况不建议使用，如遇病情迁延不愈或高度怀疑病毒感染而又暂时无法确认或者混合感染时，可以考虑采用Filmarray全自动医用PCR分析系统快速检测常见呼吸道感染相关的病原体，它能更好地服务于感染性疾病的诊断与临床药物的合理使用中，对临床呼吸道感染患者的诊断和治疗具有重要意义。