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IL-17A、IL-17F和IL-23R基因多态性与结直肠癌易感性关系研究

2021-10-30李洪波

国际检验医学杂志 2021年20期
关键词:等位基因多态性引物

李洪波,匡 黎

湖北医药学院附属东风医院肿瘤科,湖北十堰 431017

结直肠癌(CRC)是从结肠或直肠发展而来的癌症,年龄增加、不良生活方式和潜在遗传性疾病都是其影响因素[1]。一些遗传性疾病也是导致诱发结直肠癌的原因,包括家族性腺瘤性息肉病(FAP)和遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)[2-3]。现阶段,可以通过在结肠镜检查期间获取结直肠样本来诊断CRC,然后通过医学成像来确定疾病是否扩散[4],但目前尚未完全预防和控制CRC。近期研究主要集中于白细胞介素(IL)介导的信号通路对结直肠癌细胞凋亡、迁移或侵袭的影响,或IL这类炎症相关指标对其他疾病(胃癌)易感性及其预后的影响,目前暂无详尽结直肠癌多样性的相关研究[5-7]。有报道显示,IL-17和IL-23R的某些等位基因可能与结直肠癌肿瘤进展风险降低相关,故本研究针对IL-17和IL-23R基因多样性与CRC易感性展开研究,现报道如下[8]。

1 资料与方法

1.1一般资料 选取2016年5月至2019年5月于本院进行治疗的140例CRC患者设为实验组。其中男78例,女62例,年龄31~68岁,平均(47.19±8.56)岁。实验组中结肠癌(CC)患者78例,直肠癌(RC)患者62例;TNM分期Ⅰ~Ⅱ期58例,Ⅲ期44例,Ⅳ期38例;肿瘤位于升结肠42例,横结肠34例,降结肠34例,直肠30例;腺癌120例,黏液腺癌14例,印戒细胞癌6例,其中中高分化50例,低分化90例;平均病程(5.64±2.11)年。纳入标准:符合CRC诊断标准[9],年满18周岁,首次接受治疗,有病检样本,临床和诊断治疗齐全。排除标准:患胃部疾病(胃镜确诊),有胃肠道手术史,有恶性肿瘤病史,对治疗药物过敏者,有近期相关治疗史者。另外选取2014年5月至2017年5月于本院进行体检的100例体检健康者作为对照组,其中男54例,女46例,年龄32~69岁,平均(47.56±8.49)岁。两组一般资料比较差异无统计学意义(P>0.05),具有可比性。本次研究对象选取及其后续实验均受本院伦理委员会批准,全部患者均自愿参与。

1.2检测方法

1.2.1DNA样收集 于清晨(9:00前)抽取所有被研究对象的外周静脉血2 mL,加入抗凝剂(EDTA-K2)后4 ℃下离心分离得到血细胞,使用试剂盒(GenElute,Sigma-Aldrich,美国)抽提血细胞DNA,然后利用琼脂糖凝胶检验目标DNA纯度和完整度,-80 ℃保存备用。

1.2.2基因多态性检验 利用聚合酶联反应-连接酶反应检测技术(PCR-LDR)检验IL-17A/F和IL-23R基因多态性,其中IL-17A rs2275913位点的扩增长度为494 bp,上游引物为5′-CGG AAT TGT CTC CAC AAC AC-3′;下游引物为5′-CAG GAG TCA TCG TTG TTT CT-3′,特异性引物扩增IL-17A基因的目的基因片段。IL-17Frs763780位点的扩增长度为401 bp,上游引物为5′-GCA AAC AAA CAC CTG AAG TA-3′;下游引物为5′-GTT CCC ATC CAG CAA GAG AC-3′,特异性引物扩增IL-17F基因的目的基因片段。IL-23Rrs10889677位点的扩增长度为453 bp,上游引物为5′-CAA TCT TGT TTC CAG AGT AGT GAC-3′,下游引物为5′-AAA AAT ACA TGA GGC GTC CA-3′。具体操作如下:引物和探针由上海百研生物科技公司完成合成,将DNA样本稀释至10 ng/μL后加1 μL至反应体系(包含引物混合物1 μL,Master mix 5 μL和3 μL ddH2O)。置入PCR仪,94 ℃下2 min变性后,进行11个94 ℃(20 s)-65 ℃(40 s)-72 ℃(60 s)的循环,在进入94 ℃(20 s)-59 ℃(30 s)-72 ℃(90 s)的24个循环,最后72 ℃ 120 s。随后加入1 μL Exol/SAP酶,37 ℃下恒温1 h后灭活。使用试剂盒进行双链接反应,将稀释后的连接产物送上海生工生物公司测序,使用DNAman9.0分析数据。IL-17A选择rs2275913位点,IL-17F选择rs763780位点,IL-23R选择rs10889677位点。

2 结 果

2.1高通量测序序列基本信息 使用illuminate平台目的基因高变区进行测序,数据获取剔除低质量reads后进行拼接,所获Tags平均拼接率约为95.00%,结果较为理想,见表1。

表1 高通量测序序列基本信息

2.2两组IL-17A基因及其等位基因频率比较 两组IL-17A(rs2275913)TT、TC和CC分布情况比较差异无统计学意义(P>0.05)。实验组IL-17F(rs763780)TT、TC和CC分布情况与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05),但其等位基因分布差异无统计学意义(P>0.05),见表2。

表2 两组IL-17A/F基因及其等位基因频率比较[n(%)]

2.3两组IL-23R基因及其等位基因频率比较 实验组IL-23R(rs10889677)TT、TC和CC分布情况与对照组比较差异有统计学意义(P<0.05),但其等位基因分布差异无统计学意义(P>0.05),见表3。

表3 两组IL-23R基因及其等位基因频率比较[n(%)]

2.4IL-17F和IL-23R多态性与CRC患者临床表现间的关系 IL-17F(rs763780)单核苷酸基因频率与肿瘤分期相关,纯合子TT在中重度患者中分布明显少于轻度患者,差异有统计学意义(P<0.05),且肿瘤位于升结肠的纯合子TT基因频率明显异于其他部位,差异有统计学意义(P<0.05);IL-23R(rs10889677)位点单核苷酸基因频率与肿瘤分期及肿瘤部位差异无统计学意义(P>0.05),见表4。Logistic回归分析显示,IL-17F(rs763780)Ⅲ、Ⅳ期患者中TT基因型明显异于其他(CT+CC)基因型,差异有统计学意义(P<0.05);肿瘤位于升结肠患者中IL-23R(rs10889677)CC基因型明显异于其他(TT+TC)基因型,差异有统计学意义(P<0.05),见表5。

表4 同临床表现患者IL-17F和IL-23R等位基因及其突变的比较(n)

表5 IL-17F和IL-23R多态性与CRC患者临床表现间的关系(95%CI)

3 讨 论

IL-17和IL-23都是促炎性细胞因子,IL-17由T辅助细胞17产生,以响应IL-23得到刺激[10]。近期相关研究发现IL-17和IL-23R的某些等位基因可能与结直肠癌肿瘤进展风险降低相关[11]。在IL-17家族成员中,IL-17F同种型1和2(ML-1)与IL-17A具有最高的序列同源性(分别为55%和40%)[1-3]。但是针对IL-17F的研究相对于IL-17A而言较少,且其在癌症发展中的作用尚不明确;另一方面,现阶段研究主要集中于IL-17F募集炎症因子、调节细胞因子或干预肿瘤血管生成方向[13]。此外,其他IL(如IL-1s、IL-8和IL-10等)虽然介导炎性反应,但未有明确结果证明他们基因的多态性影响肿瘤易感性。本研究发现实验组IL-17F的rs763780位点和IL-23R的rs10889677位点基因频率分布与对照组存在明显差异,这提示临床工作者IL-17F和IL-23R基因多态性可能和结肠癌存在一定的相关性。裴芳等[14]研究显示病毒性心肌炎IL-17A多态位点AA基因型和A等位基因频率均显著高于对照组,这与本研究的结果类似。同时,IL-23被证明可以促进许多其他免疫病理学模型中的炎症发展,包括关节炎模型,肠道炎症和牛皮癣;其中IL-23R作为IL-23信号传递因子也被证实与疾病易感性相关,与本研究结果一致[15]。

本研究结果显示,IL-17F(rs763780)单核苷酸基因频率与肿瘤分期相关,纯合子TT在中重度患者中分布明显少于轻度患者,且肿瘤位于升结肠的纯合子TT基因频率明显异于其他部位。因而本文推测,IL-17F的rs763780位点T向C的改变,可能增加CRC易感性;同理,IL-23R的rs10889677位点TC向CC的改变,也有可能是肿瘤位于升结肠的标志。研究表明,IL-23可以刺激Th17细胞的生长、分化和维持,而IL-23与存在于T淋巴细胞、NK细胞和DC细胞上的IL-23R结合,介导这些细胞内信号传递,故其控制肿瘤的发生和发展[15-16]。而Th17细胞得到生长、增殖和分化又会产生大量IL-17,从而形成IL-23/IL-23R/Th-17/IL-17通路。这些反应引起细胞内DNA的复制和转录异常,从而引发肿瘤的发生和发展[17-18]。另一方面,本研究指出IL-17F rs763780位点和IL-23R rs10889677基因多态性与CRC病症相关,但本文仅针对该基因上的一个位点进行研究,下一步,本文也需要多位点分析,收集更多临床治疗,分析患者年龄和血清各指标参数等与IL-17A/F和IL-23R不同基因型与临床特征的差异。同时,本文分析了CC和RC患者IL-17A/F和IL-23R间时候存在基因频率差异,为临床诊断和治疗提供依据。

综上所述,IL-17F(rs763780)和IL-23R(rs10889677)可能影响结直肠癌患者的易感性,其多核苷酸多态性分别与患者肿瘤分期、肿瘤部位相关。

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