基于MRI的影像组学在阿尔茨海默病中的研究进展
2021-03-28王笑男李春媚陈敏
王笑男,李春媚,陈敏*
1.北京医院放射科 国家老年医学中心 中国医学科学院老年医学研究院,北京 100730;2.中国医学科学院北京协和医学院研究生院,北京 100730;*通信作者 陈敏 cjr.chenmin@vip.163.com
阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)是老年人最常见的痴呆类型,通常起病隐匿,进行性发展,伴有记忆力减退、认知功能障碍及性格行为异常等多种临床症状[1],早期难以准确诊断及鉴别诊断,容易延误治疗。AD的主要病理学特征为脑内β-淀粉样肽聚集形成神经斑,神经纤维缠结及神经元变性或缺失[2],目前尚无有效治疗措施可以停止或逆转AD的进展,因此寻找一种可以早期诊断AD的影像学方法,对疾病的准确诊断、早期干预及预后预测尤为重要。影像组学通过高通量提取医学影像图像的灰度、形状、纹理及滤波等特征,利用统计和机器学习的方法,为临床疾病的准确诊断和早期治疗提供依据[3]。近年来,影像组学在神经退行性疾病,尤其是在AD的研究中迅速发展,本文对其基本原理、临床应用及前景进行综述。
1 基于MRI的影像组学概述
影像组学是从医学图像中提取大量特征,进而进行定量描述及定量分析的研究方法,其基本工作流程包括图像采集、图像分割、特征提取、特征选择、模型建立5个步骤[4]。
1.1 图像采集与图像分割 图像采集是影像组学的基础,用于AD的图像可以来自地方医疗机构[5]和(或)公开数据库[6-9]。目前最常用的序列是高分辨率T1WI图像。为了消除不同采集机型及不同扫描参数对图像的影响,可对MR影像进行预处理,包括图像配准、直方图均衡化、三线差值重采样等方法[10],目前,这些预处理方法的选择标准及适用条件尚无统一定论。
图像分割是将图像分割成特定脑区或提取感兴趣区(ROI)的过程,可采用手动分割、半自动分割和自动分割的方式[11-13]。手动分割准确性高,且对不规则ROI勾画精细,是目前最常用的“金标准”分割方法,但是受观察者经验及主观因素影响,可重复性差、耗时长、效率较低。半自动分割可替代部分人力工作,但需人工校正。自动分割排除人为因素,效率及可重复性大幅提高,但受技术限制,尚无统一的方案和标准。
1.2 特征提取与特征选择 特征提取是影像组学的关键步骤,目前常用的软件包括MaZda[14]、Matlab[15]、FSL[16]、A.K[5]。影像组学特征包括灰度、形状、纹理等。灰度特征又称一阶特征,从灰度直方图中提取,可以获得最大(小)值、范围、均值、四分位间距、能量、熵、一致性等统计量。形状特征可以定量描述图像中目标的几何属性(长短、直径、表面积、体积、球形度等)、统计属性(不变距等)及拓扑属性(孔、连通等)。纹理特征[17]包括灰度共生矩阵、灰度相关矩阵、灰度游程矩阵、灰度区域大小矩阵、局部灰度差分矩阵等。
特征选择又称特征降维,是影像组学模型泛化性的决定因素。特征选择方法包括过滤法、封装法、嵌入法。过滤法不依赖机器学习,不考虑特征的相关性,计算方法简单、速度快,适合高维数据,包括卡方检验、相关系数、最小冗余最大相关等。封装法根据目标函数,选择或排除特征,计算量较大,实际应用较少。嵌入法是实际应用中最常见的方法,可以在计算过程中搜索最佳特征子集,包括决策树、随机森林、最小绝对收敛和选择算法等。
1.3 模型建立与分析 模型建立是影像组学的最终目标。建模方法有Logistic回归模型、支持向量机(support vector machine,SVM)、随机森林(random forest,RF)、卷积神经网络(convolutional neural networks,CNN)等。
1.3.1 Logistic回归模型 Logistic回归模型是最有用的监督分类模型,因其分类方法简单,分类结果合理,在临床应用中很受欢迎。
1.3.2 SVM SVM是一种二分类模型,目的是寻找一个超平面将数据分为两类(有应答及无应答),既可以用于线性可分样本,又可以通过核技巧转化用于非线性可分样本,适用范围较广,在影像组学研究中应用广泛[18]。
1.3.3 RF RF是一个分类决策树概念,由根节点、中间节点和叶节点组成,可以模拟人类的推理过程,其优点是计算复杂程度不高,对中间值缺失不敏感;缺点是容易造成过度拟合。
1.3.4 CNN CNN是一种前馈神经网络,可以不进行图像预处理及特征提取,直接学习对原始图像进行操作,是经典的机器学习方法之一。
2 基于MRI的影像组学在AD 中的临床应用
AD进展是一个连续的过程,从临床前阶段到轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI),进而发展为AD,会持续数年,尤其MCI阶段,尚不满足痴呆诊断标准但已经出现一定程度的认知损害,而大脑萎缩不明显,确诊需要依靠脑组织活检[2],很难在临床上开展。因此,寻找正常衰老的健康人、MCI及AD患者的影像学差异,尤其确立MCI阶段的影像诊断标志物,建立病程转归的预测模型,并与患者认知障碍程度建立联系尤为重要。
2.1 诊断 海马区是AD进展过程中较早累及的区域之一[19-20]。Sørensen等[21]基于T1WI图像提取海马区纹理,通过SVM法区分正常衰老的健康对照者、MCI和AD患者,结果显示健康对照者/MCI、健康对照者/AD的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.724、0.912,证实影像组学具有区分正常衰老的健康对照者与MCI及区分正常衰老的健康对照者与AD的能力。Feng等[22]利用ANOVA软件进一步提取海马头和海马尾的111个有意义的影像特征,将区分AD和健康对照组的AUC提高到0.93,敏感度为84.21%,特异度为88.89%。多项研究证实AD患者认知水平下降与胼胝体萎缩有关[23-24],范炤等[25]分析78例AD患者及44名健康对照者的三维T1WI图像,手动分割胼胝体并提取385个影像特征,结果证实胼胝体的MR影像纹理特征可以区分AD与健康对照者,AUC为0.720,敏感度为0.792,特异度为0.500。与健康对照者相比,AD及MCI患者组学特征不仅在海马、胼胝体这些已证实与认知密切相关的区域存在差异,多项扩展到全脑不同结构的研究也提示组学特征具有鉴别意义,如基于自动分割的不同脑区[25-26]、脑叶[27-28]及灰质[29],而不同脑结构可靠的组学特征仍需要大量样本的验证。影像组学能够反映组织内部的异构性,弥补单纯基于肉眼所见的体积、形状、信号变化的不足,提高了AD的诊断准确性,具有良好的临床应用前景。
2.2 预测 由MCI到确诊AD一般耗时3~6年,预测MCI何时会转化为AD对指导临床早期干预具有重要意义。Shu等[7]分析203例稳定MCI及154例进展为AD患者的组学特征,用逻辑回归方法建立模型,预测MCI在48个月内进展为AD的准确度在训练集及测试集中分别为0.814和0.807,敏感度分别为0.822和0.745,特异度分别为0.671和0.738;研究者利用该模型预测12个月内MCI进展为AD的AUC为0.814,敏感度为0.726,特异度为0.798,表明影像组学模型可以预测由MCI进展为AD的高危人群。Spasov等[30]基于影像组学、人口学特征、载脂蛋白E基因等建立多参数深度学习模型,区分3年内稳定MCI及发展为AD的MCI,准确度为86%,为预测MCI进展为AD提供了一种计算机辅助方法。Tang等[6]纳入来自阿尔茨海默病神经影像学倡议数据库(Alzheimer's disease neuroimaging initiative,ADNI)的162例MCI(包括5年内转化为AD 68例,稳定MCI 94例),结果发现基于影像组学-临床-实验室预测模型较单纯临床-实验室预测模型的训练组诊断效能增长约5%,表明影像组学在预测MCI转换为AD方面存在潜在的应用价值。
2.3 基于MRI的影像组学与认知障碍的关系 简易智力状况评分(mini-mental status examination score,MMSE)是国内外广泛应用的首选的AD筛查量表,能全面、准确、迅速地反映受试者的智力状态,是AD患者认知功能缺损程度分级的标准之一。Feng等[22]分析116例单中心数据,从双侧海马区共提取111个有意义的组学特征,其中98个与MMSE评分相关。此外,影像组学特征还与多种智力损伤评分相关,如海马纹理特征与基于Addenbrooke改良认知评估量表的认知功能评分呈负相关(r=-0.25,P<0.001)[21],结合快速问答评分较单纯灰度直方图将区分AD与健康对照者的准确率由84.07%提高到97.01%[29]。由此可见,影像组学可以作为临床认知障碍损伤程度的评价指标。
3 基于MRI的影像组学的局限性
基于MRI的影像组学在AD中的研究多为回顾性分析,不同的扫描设备、不同MR参数及不同医学中心扫描方式会有所差异,如何获取标准医学影像数据是目前研究中亟待解决的问题[31]。影像组学模型建立方法多种多样,图像预处理方法选择和执行顺序尚无统一的标准,是影响影像组学模型泛化性的原因之一。手工提取感兴趣区的可靠性及可重复性不能保证,也限制了影像组学在临床上的推广。因此,更规范、更科学、更稳定的影像组学方法,是未来需要突破的方向。
4 小结与展望
影像组学可以对MR图像信息进行深度挖掘,将影像诊断方法从传统肉眼的定性诊断向定量诊断转变,并与疾病诊断、转归预测及临床严重程度相关联,在影像数据高通量提取与疾病诊疗中显示出巨大的潜力。影像组学在AD中的应用处于探索阶段,基于机器学习或深度学习的影像组学是未来发展的方向,可能成为临床AD诊疗的可靠方法,为临床诊治提供更精确的指导。随着医疗大数据时代的到来及人工智能的发展,影像组学的应用具有更广阔的前景,期待在不久的将来,基于大样本的影像组学成为AD的可靠诊断工具。