猪传染性胃肠炎病毒PCR检测方法研究进展
2020-12-30申识川刘文正
申识川,刘文正,李 利
(1.濮阳市检验检疫服务中心,河南 濮阳 457000;2.台前县农业农村局,河南 台前 457600;3.营口市食品药品检验检测中心,辽宁 营口 115004)
猪传染性胃肠炎是由猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)引起的以脱水、严重腹泻、呕吐、肠绒毛萎缩、初生仔猪高死亡率为主要特征的一种接触性传染病,是造成哺乳期仔猪死亡的主要疫病之一。我国20世纪50年代开始有该病的报道,给我国养猪业造成了重大经济损失。如能在发病早期快速确诊该病,对于本病的防治具有非常重要的作用。猪传染性胃肠炎、猪流行性腹泻和猪轮状病毒病在临床症状、病理变化、流行病学等方面高度相似,仅靠临床症状很难确诊。因此,建立准确的猪传染性胃肠炎病毒的检测方法意义重大。本文综述了国内近几年PCR检测方法研究进展。
1 猪传染性胃肠炎病毒概述
TGEV属于冠状病毒科成员,该病毒形态在电镜下观察类似于王冠,基因组是连续单股正链RNA,全长28.6 kb,编码7 个开放阅读框,编码4 种结构蛋白和3 种非结构蛋白。目前研究表明,猪传染性胃肠炎病毒只有一种血清型。
2 猪传染性胃肠炎病毒PCR检测方法研究进展
TGEV 传统的病毒分离、荧光抗体试验等检测方法样品处理繁琐、耗时长,灵敏度低,不适合推广应用,随着PCR 技术的成熟,相关仪器和试剂价格的降低,PCR检测方法在动物传染病检测中已成为一种常规的检测方法。
2.1 RT-PCR检测猪传染性胃肠炎病毒
相对于病毒分离鉴定和中和试验,PCR 检测具有快速、准确、对人员和设备要求不高的优势,在基层得以广泛应用。王黎等根据TGEV的N基因序列建立了检测TGEV的RT-PCR 方法,并对猪传染性胃肠炎高发季节的四川省成都市、德阳市、绵阳市、遂宁市、南充市各地猪场送检的疑似病料进行了检测,检测结果表明在四川省的这些地区TGEV 的感染率非常高,此项研究为该病的防控提供了流行病学资料。满坤等根据TGEV的S基因建立的RT-PCR方法从河北某猪场疑似TGEV 的病猪小肠内容物中分离出了一株TGEV的强毒株,为进一步研究TGEV的变异情况提供了依据。
2.2 多重RT-PCR检测猪传染性胃肠炎病毒
多重PCR技术是在一个PCR反应体系中加入多对以上引物和多个模板,同时进行扩增的
PCR技术,可用一种病料通过一次PCR 反应,检测多种病原体,实现对多种疾病的诊断,被广泛应用于动物疫病检测。张坤、何启盖根据Gen Bank 收录的PEDV M 基因序列、TGEV N 基因序列和猪轮状病毒(GAR)VP 7 基因序列设计3 对引物,建立了能够同时检测PEDV、TGEV 和GAR 的多重PCR 方法,应用该方法检测了华中地区75 份腹泻猪粪样,结果表明该方法检测PEDV、TGEV、GAR 的敏感性高、特异性强, 是一种有效检测PEDV、TGEV 和GAR的方法。
2.3 荧光定量PCR检测猪传染性胃肠炎病毒
荧光定量PCR 技术是近年发展起来的基因检测技术,相对于传统PCR 具有扩增效率高、灵敏度更高、特异性好、能精确定量等优点,而且可以有效避免检测过程中的污染和假阳性问题。董玲娟等根据TGEV-TH98株的N基因序列建立的TGEV荧光定量RT-PCR检测方法,对采自陕西杨凌周边的30份临床样品进行检测,结果表明,该方法特异性高、重复性好、敏感性比普通PCR 方法高2个数量级,可应用于临床检测TGEV。龚双燕等建立的检测猪初乳的荧光定量PCR方法检测结果显示,荧光定量PCR检测方法的敏感性高于普通PCR 方法,可以用于猪初乳检测TGEV。
2.4 多重荧光定量PCR检测猪传染性胃肠炎病毒
李军等根据Gen Bank 中登录的TGEV 的S 基因、PEDV的S 基因、猪轮状病毒(PRoV)A 型的NSP 基因序列,建立了针对这3种病毒的多重荧光定量RT-PCR方法,用建立的方法对来自广西壮族自治区、广东省、江苏省等地的9 个大型猪场的粪便、小肠和乳汁样品猪腹泻38份临床样品进行了检测,结果表明该方法能够特异性检测PEDV、TGEV和PRoV,而与其他病原无交叉反应。
2.5 RT-LAMP方法检测猪传染性胃肠炎病毒
高睿泽等根据TGEV N 基因序列设计了两对反转录环介导等温扩增(RT-LAMP)引物,建立了针对TGEV-N基因的RT-LAMP快速检测方法,通过与经RT-PCR和ELISA检测验证过的47 份临床样品进行比对,结果显示符合率为100%,表明该方法可用于临床检测TGEV。
3 小 结
以上几种RT-PCR 检测方法,都是随着分子生物学技术的发展而建立的,经历了从定性到定量的发展过程,猪场、动物卫生检疫部门和高校研究所等可以根据自身条件选择适合自己的检测方法。