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一株青枯菌拮抗细菌M26的筛选、鉴定及其发酵条件优化

2020-10-20陈丹丹李圆圆齐素敏冉新炎韩广泉陶宁王丽荣

山东农业科学 2020年9期
关键词:青枯病芽孢淀粉

陈丹丹,李圆圆,齐素敏,冉新炎,韩广泉,陶宁,王丽荣

(山东碧蓝生物科技有限公司/泰安市植物微生态制剂重点实验室,山东 泰安 271000)

番茄(Solanum lycopersicum L.)是管状花目茄科番茄属一年或多年生草本植物,为我国主要的蔬菜之一。番茄营养丰富,其含有的番茄红素具有抗氧化、清除自由基、延迟衰老和抗癌的功效[1],具有很大的经济效益。随着番茄种植面积的不断扩大,番茄青枯病也越来越严重。番茄青枯病是由青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的一种常见的维管束系统性病害之一,发病严重时可造成植株死亡,导致番茄严重减产甚至绝收[2]。

利用生防菌防治番茄土传病害是一种有应用前景的防治措施[3]。芽孢杆菌(Bacillus)是一类研究较多的生防细菌,当前用于防治青枯病的芽孢杆菌有解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)[4-6]、枯草芽孢杆菌(B.subtilis)[7,8]、短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)[9]、蜡状芽孢杆菌(B.cereus)[10]、耐寒短杆芽孢杆菌(Brevibacterium frigoritolerans)[11]、特基拉芽孢杆菌(B.tequilensis)[11]、多 粘 芽 孢 杆 菌(Paenibacillus polymyxa)[12]等。美国迄今已有1个解淀粉芽孢杆菌FZB42和3个枯草芽孢杆菌GB03、MB1600、QST713获得商品化生产许可[13]。

本试验筛选到一株抑制青枯雷尔氏菌的细菌M26,通过16S rRNA基因序列、形态学和生理生化特征分析,确定其为解淀粉芽孢杆菌,并对其发酵条件进行优化,为开发该菌株成为青枯病生防菌提供参考,同时丰富了防治青枯病的微生物资源。

1 材料与方法

1.1 试验材料

供试菌株:青枯雷尔氏菌,购买自中国普通微生物菌种保藏管理中心;其他菌株由山东碧蓝生物科技有限公司菌种保藏中心保存。

供试培养基:芽孢培养基(YB):葡萄糖2 g,蛋白胨10 g,酵母膏5 g,氯化钠5 g,水1 L,pH=7.0,固体培养基(YA)加琼脂粉15 g;青枯培养基:蛋白胨5 g,葡萄糖5 g,酵母提取物0.2 g,牛肉提取物3 g,氯化钠0.5 g,七水硫酸镁1.5 g,水1 L,pH =7.0,固体培养基加琼脂粉15 g和2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC)100μL;2%营养琼脂培养基(NA):蛋白胨10 g,牛肉膏3 g,氯化钠5 g,水1 L,pH值为7.2~7.4,琼脂粉20 g,1%NA培养基加琼脂粉10 g。所有培养基121℃灭菌30 min备用。

主要试剂和仪器:葡萄糖、蛋白胨、酵母膏、氯化钠等,均为分析纯试剂;天根细菌基因组DNA提取试剂盒;PCR引物,由铂尚生物技术(上海)有限公司合成;HBI芽孢杆菌生化鉴定条,由青岛海博生物技术有限公司生产;BIO-RAD PCR仪,伯乐生命医学产品(上海)有限公司;OLYMPUS CX31型显微镜,日本奥林巴斯株式会社;DYY-6C型电泳仪,北京市六一仪器厂;T6新世纪紫外可见分光光度计,北京普析通用仪器有限责任公司;TANON-1600全自动数码凝胶成像分析系统,上海天能科技有限公司。

1.2 试验方法

1.2.1 拮抗菌的初筛 菌液的制备:将青枯菌接种于青枯液体培养基中,30℃、180 r/min摇床培养48 h后备用;将保存的拮抗菌接种到YB培养基中,37℃、180 r/min摇床培养24 h后备用。

初筛方法:采用平板孔扩散法。底层为20 mL的2% NA培养基,待培养基凝固后加入1 mL的青枯菌和5 mL的1% NA培养基摇匀,等液体干透后用打孔器(直径9 mm)距离中心3 cm打4个孔,每孔中加100μL的生防菌液,每个处理重复3次,抑菌圈直径按十字交叉法进行测量。

1.2.2 拮抗菌的复筛 从初筛结果中选取抑菌效果比较好的菌株进行复筛,方法如1.2.1,选出抑制效果最好的1株细菌。

1.2.3 拮抗菌的鉴定 利用细菌DNA提取试剂盒提取拮抗菌DNA,使用细菌16S rRNA通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)进行PCR扩增。PCR反应体系(50μL):DNA模板2 μL,Mix 25μL,27F 1μL,1492R 1μL,ddH2O 21 μL。PCR扩增程序:95℃4 min;94℃30 s,52℃80 s,72℃90 s,30个循环;72℃8 min。PCR产物经1.2%琼脂糖凝胶电泳检测后送铂尚生物技术(上海)有限公司进行测序,测序后的拼接结果在NCBI上进行BLAST相似序列检索比对,采用MEGA 6.0软件进行多序列同源性分析,并构建系统进化树。

形态学和理化特征试验:将拮抗菌接种于YA培养基中,37℃培养24 h,观察菌落形态、大小、边缘、表面、凹凸度、透明度等,并进行革兰氏染色和芽孢染色[14],具体方法参考《常见细菌系统鉴定手册》[15]。

1.2.4 发酵条件优化 (1)种子液制备:将复筛得到的拮抗菌接种至YB培养基中,37℃、180 r/min培养24 h待用。

(2)发酵条件优化:按照1/15(V/V)的接种量接种于YB培养基培养24 h,分别检测不同温度(25、30、35、45、55℃)、不同pH值(5、6、7、8、9)、不同NaCl含量(0、0.5%、1.0%、1.5%、2.0%)、不同转速(150、180、210 r/min)、不同装载量(15%、25%、40%、50%)下600 nm的光密度值,每个试验组设3个重复。

1.3 数据处理

采用SPSS软件包单因素方差分析法(oneway ANOVA)中的Duncan’s多重比较检验法进行数据分析和差异显著性检验(P<0.05),利用Microsoft Excel 2010软件作图。

2 结果与分析

2.1 拮抗菌的筛选

选取保存的40株菌进行纯化,编号为M1、M2、… 、M40。有5株细菌对青枯雷尔氏菌有较强的抑制作用,抑制结果如表1所示。其中菌株M26对青枯雷尔氏菌具有很强的抑制作用,抑菌圈直径达14.34 mm,复筛平均抑菌圈直径达15.22 mm。经过连续多次试验后抑菌效果稳定(图1),所以对菌株M26进行进一步研究。

表1 5株细菌对青枯雷尔氏菌的抑菌圈直径 (mm)

2.2 M26菌株16S rRNA基因序列分析

电泳结果(图2)显示,PCR产物长度在1 500 bp左右。测序结果显示M26菌株16S rRNA基因的序列长度为1 453 bp,与电泳结果一致。M26与Bacillus amyloliquefaciens strain BA31(MG548650)相似性达到99.79%。系统进化树也显示M26与B.amyloliquefaciens strain BA31(MG548650)在同一系统分支上(图3)。因此,初步鉴定M26为解淀粉芽孢杆菌。

图1 M26菌株对青枯雷尔氏菌的抑制效果

图2 M26菌株16S rRNA PCR产物的琼脂糖凝胶电泳图谱

图3 基于16S rRNA基因序列构建的M26及相关菌株的系统发育树

2.3 菌株M26的形态和生理生化特征

菌株M26在YA培养基上37℃培养24 h后,菌体呈杆状,有荚膜和芽孢;菌落为乳白色,呈圆形,直径在0.35~0.45 cm,表面有褶皱,中心部分凸起,边缘为锯齿状,不透明,不产生色素。部分生理生化特征见表2,与B.amyloliquefaciens的生理生化特征[16,17]最为接近。

表2 M26菌株的生理生化特征

2.4 菌株M26的发酵条件优化

由图4可知,菌株M26在25~55℃范围内均能生长,25℃和35℃的差异不显著,但是在25℃时生长最好(图4 A);在25℃条件下,M26在pH值5~9范围内均能生长,在pH=7下生长最好(图4 B);在25℃、pH=7条件下,M26在NaCl含量为0~2%的条件下均能生长,0.5%NaCl含量下生长最好(图4 C);在25℃、pH=7、0.5%NaCl含量下,180 r/min下OD600显著低于150 r/min和210 r/min,在150 r/min条件下生长最好(图4 D);在上述优化条件下,装载量为40%下生长的最好(图4 E)。综上可知:解淀粉芽孢杆菌M26在25℃、pH=7、0.5%NaCl含量、转速为150 r/min、40%装载量条件下生长的最好。

图4 不同发酵条件下菌株M26的生长情况

3 讨论与结论

解淀粉芽孢杆菌可通过产生抗生素、抗菌蛋白或多肽等活性物质抑制植物病原菌、真菌、病毒和线虫[18-20]。其易于生产,对环境友好,是一类重要的生防资源[21]。有研究表明:解淀粉芽孢杆菌对番茄青枯菌有很强的拮抗作用[22,23];枯草芽孢杆菌、解淀粉杆菌和地衣芽孢杆菌能够抑制青枯病的发生,且枯草芽孢杆菌抑菌能力最强,可使感染率降低80%[24];解淀粉芽孢杆菌BS2004、SQY162和SQRT3对番茄青枯病的防治效果在70%以上,最高可达到81.25%,且均能够促进番茄植株生长[25-27]。

解淀粉芽孢杆菌与枯草芽孢杆菌的亲缘性很高,对人体及其它生物无害,因此被广泛应用于饲料、植物病害防治及果蔬保鲜中[28]。本研究对菌株M26的发酵温度进行优化时,在45℃生长最差,而在35℃和25℃均生长良好。符可芯等[17]的研究表明,解淀粉芽孢杆菌在高于45℃时菌体生长放缓,OD值下降,且在55℃的OD值高于25℃的,与本研究结果不一致,可能是解淀粉芽孢杆菌菌株的差异性所造成的。刘芳等[21]的研究表明,随着温度的升高,枯草芽孢杆菌BZJN1的芽孢数减少,45℃时降到最低,与本研究结果一致。

通过分析M26菌株的16S rRNA序列、形态和生理特征,确定M26为解淀粉芽孢杆菌。M26菌株的最佳培养条件为温度25℃、pH=7、0.5%NaCl含量、转速150 r/min、装载量40%。本试验为解淀粉芽孢杆菌的生产工艺提供了参考数据。

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