日本筑波大学:逆转座子可能会影响瓜的基因表达
2020-10-14
国际种业前沿动态 2020年16期
日本筑波大學和日本国家农业与食品研究组织(NARO)的研究人员最近在《生物学通讯》(Communications Biology)上发表的一项研究表明,当甜瓜基因组多样化时,逆转座子可以改变基因表达,并可能影响果实成熟。
甜瓜是全球最重要的经济作物之一。甜瓜的一个特殊特征是两种水果类型共存:呼吸跃变型(产生乙烯,指某些肉质果实从生长停止到开始进入衰老之间的时期,其呼吸速率的突然升高)和非呼吸跃变型。乙烯是一种重要的植物激素,对调节果实的货架期等跃变期果实成熟性状具有重要的经济意义。
Harukei-3由于其口感和美观,在日本作为选育高档甜瓜的标准类型已经使用了很长时间,这种甜瓜如果生长在合适的季节,会产生特别甜的果实。由于Harukei-3甜瓜在成熟过程中会产生乙烯,研究人员通过使用第三代纳米孔测序结合光学测序和下一代测序,组装了Harukei-3的整个基因组序列。
研究结果表明,当甜瓜基因组多样化时,逆转座子有助于基因表达方式的变化。逆转座子也可能影响导致果实成熟的基因表达。
来源:Seedquest