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雪峰乌骨鸡HSP70基因多态性与精液品质关联分析

2020-08-30喻宗岗姚亚铃燕海峰

浙江农业学报 2020年8期
关键词:吸光精液精子

喻宗岗,蒋 隽,姚亚铃,郭 英,李 闯,燕海峰,*

(1.湖南省畜牧兽医研究所,湖南 长沙 410131; 2.湖南农业大学 动物科学技术学院,湖南 长沙 410128; 3.湖南洪江嵩云禽业有限公司,湖南 洪江 418200)

热休克蛋白70基因(heat shock protein 70,HSP70)是一种高度保守、没有内含子的基因,在细胞保护、抗氧化和免疫中被广泛研究。在精液品质方面,HSP70基因的研究主要集中于人、小鼠和反刍动物,而在鸡中的研究较少,其在鸡精液冷冻保存方面的研究更是鲜有报道。武鸿斌等[2]在弱精、少精患者中研究发现,HSP70基因与精子密度、精子活力显著相关[2];万卫斌等[3]报道指出,HSP70基因可以抑制解脲脲原体细胞凋亡,从而改善男性不育。有多篇研究发现,HSP70基因可以作为鼠精液品质的遗传标记[4-7]。在牛的研究中发现,HSP70基因不仅可以作为精液品质的评定指标[8-9],其表达还与精液品质相关[9-12]。在鸡的研究中,HSP70基因不仅可以作为鸡繁殖性状的候选基因[13];而且其表达与冻后精子复活力相关[14]。因此,HSP70基因可以作为精液品质的候选基因。

本文以HSP70基因作为鸡冻精品质的候选基因,利用测序筛选多态性位点,并与雪峰乌骨鸡精液品质及冻精品质进行关联分析,以期获得与鸡精液抗冻性相关分子标记,为雪峰乌骨鸡的精液冷冻保存和保种提供技术支持。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 试验动物

110只27周龄白羽雪峰乌骨种公鸡购自嵩云禽业有限公司,饲养在相同条件下,自由采食,每日光照时间16 h。EDTA真空抗凝采血管翅静脉采血,采2支,每支约1~2 mL,置于-20 ℃冰箱保存备用。

1.1.2 试验材料

动物基因组DNA提取试剂盒(TSP201-200)、I-5TM2X Hi-Fi PCR Master Mix(TP001)、琼脂糖(TSJ001)、DL 2000 DNA Marker(TSJ011-100)、K2EDTA-2ML真空采血管购自擎科新业生物科技有限公司。

1.2 精液采集与处理

1.2.1 精液采集与稀释

按照水利部、财政部、国土资源部和中国气象局的有关文件要求,省水利厅会同省财政厅、省国土资源厅、省气象局成立了项目建设领导小组,并成立省山洪灾害预警系统建设项目办公室(以下简称省项目办)作为项目法人,承担项目的建设管理工作;各设区市、县成立相应的项目建设管理机构,省市水文部门作为同级项目办成员参与项目建设管理,以支撑项目中暴雨洪水监测系统的建设;气象部门成立相应项目建设机构负责气象部门实施内容的建设。

使用背腹联合按摩法采精,参比EP管刻度记录采精量,分别吸取0.2、0.1 mL精液于含有预热LR液和密度测定液的EP管中,置于冷藏箱中待测。

1.2.2 鲜精活力检测与抗冻液添加

将带回实验室的精液置于4 ℃冰箱中平衡30 min,期间吸取10 μL于32 ℃恒温视频显微镜下检测鲜精活力。平衡30 min后,每管稀释精液按1∶1添加0.4 mL冷藏于4 ℃的LRD(DMA浓度为12%),充分混匀后于4 ℃冰箱平衡10 min。

1.2.3 细管制作、冷冻与解冻

冻精制作在4 ℃电子冰箱中完成,细管中部留约1 cm的空气柱,以防冷冻过程中爆裂;灌装后的细管用记号笔,每5只公鸡的细管为1组,按照公鸡编号由小到大编号。制作完后,将细管铺在细管导板上用胶带固定,并标记相应的组号。所有组完成后将细管精液在自制的细管熏蒸架3 cm处,置于液氮中冷冻7 min。精液冷冻和解冻方法参见文献[15]。

1.2.4 精液品质检测

取10 μL精液在32 ℃恒温视频显微镜下观察[15],测定精子活力,标准参考中国百科大辞典。通过建立吸光值-精子密度曲线法计算密度。采用分光光度计测量精液吸光值,设置12个精液稀释梯度,每个梯度设置3个生物学重复和3个技术重复。在合适的稀释倍数下采用血细胞计数法测算精子密度,计数变异系数控制在10%以内。根据稀释比例关系推算其他各稀释倍数下的精子密度,最后建立吸光值-精液密度回归方程。

1.3 HSP70基因SNP筛选与分型

用试剂盒提取基因组DNA,1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量。使用NCBI数据库中HSP70基因序列(GenBank No. J02579.1),primer 5.0 软件设计PCR引物。引物序列为HSP70-F:TTGTGATTGGCTGAGGGGAGT,HSP70-R:GCACTTGGCATTTCTCATCTTTCAC;退火温度56.5 ℃,产物2 647 bp。反应体系:I-5TM2X Hi-Fi PCR Master Mix 12.5 μL,正反向引物各1 μL,DNA模板1 μL,双蒸水9.5 μL。反应程序:98 ℃预变性120 s;98 ℃变性10 s,57 ℃退火10 s,70 ℃延伸30 s,共35个循环;70 ℃终延伸300 s。将经电泳检测合格的PCR产物送湖南长沙擎科新业生物科技有限公司测序。使用Contig程序对每个个体读取碱基后的序列拼接、组装,使用DNAMan软件对拼接序列进行比对筛选出各个SNPs,并根据SNPs位点峰图,完成分型。

1.4 数据统计分析

在Excel中整理数据,计算各突变位点的基因型频率、等位基因频率、有效等位基因数(number of effective alleles,Ne)、遗传纯合度(homozygosity,Ho)、遗传杂合度(heterozygosity,He)和多态信息含量(polymorphic information content,PIC)。使用SPSS 19.0软件统计分析,群体基因遗传平衡的使用卡方适合性检验,采用单因素方差分析检验各基因型下精液品质指标差异显著性,差异显著时进行Duncan’s多重比较,结果以平均数±标准误表示。统计分析模型如下:

y=μ+G+ε。

(1)

式(1)中,y为观测值,μ为群体均值,G为基因型效应,ε为随机误差。

2 结果与分析

2.1 吸光度与精子密度

计数板法测定的精子密度与密度仪测定的吸光值见表1。建立吸光值-精子密度回归方程为y=0.063 2x3-0.010 5x2+0.905 9x+0.001 8。式中,y代表精子密度(108·mL-1),x代表吸光值。

表1 精子密度与吸光值测定结果

2.2 HSP70基因SNPs筛选

挑选高、中、低3种精液品质的雪峰乌骨鸡基因组DNA制作3个混合池,对3个混合池的HSP70基因PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳电泳检测,得到均一明亮的条带,说明DNA质量较好,满足后续测序要求。

2.3 HSP70基因突变位点基因分型

对每个样本的HSP70基因进行PCR扩增及测序,确定各样本的基因型,基因型如图1。经测序比对后发现在HSP70基因436 bp处有1处共有突变G>A,该处位点存在GG、AA和AG这3种基因型。

图1 HSP70基因SNPs测序峰图分析Fig.1 SNPs sequencing peak map analysis of HSP70 Gene

2.4 雪峰乌骨鸡HSP70基因多态位点群体遗传

对雪峰乌骨鸡群体HSP70基因突变位点进行遗传多样性分析(表2),该基因的SNP位点可将个体分为GG、AG、AA这3种基因型,该突变位点的PIC为0.371 4(0.25

表2 HSP70基因型和等位基因频率卡方分析及突变位点多样性分析

2.5 雪峰乌骨鸡HSP70基因多态位点与精液品质的关联

对雪峰乌骨鸡基因分型后各组群的精液指标与HSP70基因多态性关联分析见表3。如表所示,GG型的采精量、精子密度均极显著(P<0.01)高于AG和AA型,精子的冻后活力极显著(P<0.01)高于AA型,显著(P<0.05)高于AG型;AG型的采精量和精子密度极显著(P<0.01)高于AA型,冻后活力差异不显著(P>0.05)。

表3 基因突变位点基因型与精液品质关联分析

3 讨论

3.1 大样本量公鸡精子密度测定的影响因素

精子密度显著影响受精率[16]和精液冷冻保存效果,合适的精子密度可以最大限度发挥优良种畜的繁殖潜能,因此,准确计算精子密度十分必要。计算精子密度的常规方法是血细胞计数法,该方法步骤繁琐、耗时、低效,不适宜大量样本精液密度的测定。本研究采用吸光值-精子密度回归曲线方程法,只需使用分光光度计测量精液的吸光度,代入方程即可快速计算精子密度,极大地提高了测定效率。吸光值在0.5~1.0范围内,计数值变异系数控制在8%以下时,计数结果较为准确。

3.2 基因分型技术分析

目前常使用的基因分型方法有酶切法、高分辨率溶解曲线法(high-resolution melting,HRM)和测序法。酶切法酶切条件不好掌握且操作繁琐,受人为因素影响大,可能会出现假阴性结果。HRM法要求扩增序列短,且对荧光定量PCR仪的HRM性能有很高要求,对大于100 bp的序列特异性不够。随着测序技术的发展,测序成本的降低给科学研究带来了极大的便捷。本研究采用测序分型,该方法较酶切法省去了酶切位点寻找、凝胶电泳等繁复的步骤,更加简捷,减少了试验系统误差,提高了结果的准确性。同时,与HRM法相比,该方法可以对更长的序列进行分析,特异性更好,适用范围更广。

3.3 精液冻存的影响因素

冷冻精液对于种质资源保存、群体规模扩大和生产性能提高有着重要的推动作用。已有研究通过筛选稀释液、稀释比例、抗冻液、冷冻速率与解冻速率、添加抗氧化剂等措施来提高冻精品质。精液是否抗冻是优质冻精的基础。本课题组通过前期的试验发现,鸡个体与品种间精液存在抗冻性差异,本文从基因变异的角度来解析抗冻性的这种差异。

3.4 HSP70基因多态性与冻精品质关联分析

HSP70基因编码的蛋白质是最保守最重要的蛋白,普遍存在于原核和真核细胞中,参与多种生理过程,发挥着调控细胞凋亡[17]、抗氧化[18]、参与肿瘤调节[19]等多种生物学功能。有研究表明,HSP70基因可以作为精液品质的候选基因,且该基因的表达可以抵御热应激[20-22]和运输应激[23-24],也有研究报道发现鱼中该基因的表达可以抵御冷冻刺激[25],在鸡冻精中的研究还未见报道。本研究发现,HSP70基因436 bp处存在突变G>A,突变位点与鸡冻精品质关联分析发现,该突变位点显著影响鸡精液冻后活力、采精量和精子密度,可以作为鸡冻精品质的分子标记。本试验结果与HSP70基因在山羊和牛的冻精研究中的结果相似[26-28]。宾石玉等[29]研究发现,鱼HSP70基因多态性与耐寒性状显著相关。有报道指出,HSP70蛋白通过参与精子膜蛋白折叠来抵御冷冻刺激,从而影响精子活力[30],通过抑制线粒体释放细胞凋亡诱导因子发挥抗应激能力[31],这为精液抗冻机制提供了有力证据。本文未研究HSP70基因的表达特性,精液抗冻性的分子机制是否与HSP70基因的表达有关还有待进一步验证。

致谢:本研究由湖南家禽安全生产工程技术研究中心和长沙市科技计划(kh1901146)共同资助。

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