2010~2017 年国内猪嵴病毒感染情况调查汇总
2020-07-22杜淑清徐国栋
杜淑清 ,徐国栋 ,李 志 ,赵 斌
(1.天津市农业发展服务中心,天津300061;2.天津市动物疫病预防控制中心,天津300402;3.山东一起耕云农业服务有限公司,山东济南250101)
嵴病毒(Kobuvirus, Kobu)属小 RNA 病毒科嵴病毒属,因病毒粒子在电镜下呈崎岖不平的嵴状而得名,多种动物中均可检测到嵴病毒,自不同种类宿主分离的病毒被冠以不同的命名,猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)最初于2007 年在匈牙利健康猪粪便中被检测到,2008 年首次证实国内猪群粪便中存在PKV[1-4]。 笔者期望通过相关文献的汇总统计,明确国内猪群中PKV 感染状况。
1 方法
1.1 数据录入方法
下载中国知网中关于国内猪群中PKV 核酸检测的调查文献,剔除内容重复的文献,按时间顺序依次录入被检样品相关信息:采样时间(年份)、采样地点(省份)、被检猪群种类、被调查猪群是否腹泻、被检样品种类、检测方法、扩增的目的基因、被检样品数量、样品阳性率。
1.2 统计方法
用Microsoft Office Excel 工作表录入对原始数据进行汇总,并汇总样品阳性结果、样品相关信息频次,对腹泻猪和非腹泻猪样品累积阳性率进行统计学差异比较。
2 结果
2.1 原始数据汇总结果
共对遴选的 2010~2017 年间 19 篇[5-23]文献进行了原始数据整理,汇总得到35 条相关信息。
2.2 被检样品属性统计结果
在 2010 ~2017 年的 11 个时间段中,以2011~2012 年、2012 年的检测频次较高,分别为28.57%(10/35)、14.29%(5/35),在时间上对 PKV较高频次的关注,恰恰与当时全国范围内高病死率新生仔猪腹泻的发生时间相吻合;除2 个信息条中采样地点较模糊外,采样频次较高的省份有川(36.36% ;12/33)、 苏(18.18% ;6/33)、 沪(15.15%;5/33)等;调查者多采用 RT-PCR(频次为 77.14%,27/35)方法对 PKV 3D 基因(85.71%,30/35)进行检测,被检样品多采自腹泻(频次为82.86%,29/35)猪群,被检猪群多为仔猪群(频次为60%,21/35),被检样品以粪便、肠道和粪混合物(频次为88.57%,31/35)所占频次最高。
2.3 阳性样品的统计
2.3.1 样品阳性率的统计
35 条信息中,样品总体阳性率区间在14.29%(1/7)~95.65%(22/23)间,总体平均阳性率为 46.00%(2149/4672)。 表 1 汇总了各时间段内被检样品数、阳性样品数及其阳性率,在去除“2010-2012 年”时间段内阳性率数据后(因时间跨度大),10 个时间段内的累积阳性率区间在25.81%~73.43%间,平均阳性率为 42.96%(1851/4309),除 2013-2014 年、2016-2017 年阳性率较高外,总体趋势在阳性率40%上下波动,此外并无其它规律可循。
2.3.2 腹泻猪群和健康猪群样品阳性结果的差异比较
因被检样品的5 类信息(猪群、是否腹泻、样品种类、检测方法、扩增基因)同质性较高,故对采自腹泻猪群、健康猪群的阳性样品是否存在统计学差异进行卡方检验,原始数据见表2,经检验统计量得 X2=7.05,由 EXCEL 函数“=CHIDIST(7.05,1)”得 P=0.008,因 P≤0.01,则腹泻组和健康组的样品阳性存在极显著差异,即取自腹泻猪的样品出现阳性结果的可能性较大,与健康猪的阳性率差别为9.64%。
表1 各时间段内被检样品的阳性率汇总
表2 腹泻组和健康组样品阳性的实际观察频数
3 讨论
2010~2017 年间,国内猪群中采集的样品总体平均阳性率为46.00%(2149/4672),期间的10个时间节点中样品累计阳性率始终在40%上下,期间PKV 在猪群中的感染状态较稳定。 因腹泻仔猪群样品在累积样品数量中所占比例较大(94.87%,3584/3778),推测国内猪群中 PKV 的实际感染率应低于46.00%。
姬郭彪等[7]发现病猪样品的阳性率(80.0%,120/150) 低于健康猪样品的阳性率(95.7%,22/23),但多数调查者的调查结论是腹泻猪样品阳性率高于健康猪样品阳性率,例如:王长松[5]发现腹泻仔猪样品阳性率为64.8%(59/91),而健康仔猪样品阳性率为19.8%(25/126),两者存在统计学差异;陈蕾[9]发现腹泻猪样品阳性率为53.4%(87/163),而无腹泻猪样品阳性率为 29.4%(15/51),两者存在极显著差异;梁丹洁[15]发现2012 年、2013 年间腹泻猪样品阳性率分别为83.5%和 81.25%,高于非腹泻猪的 17.3%和16.6%,但统计学差异不显著;单玉平[16]也发现腹泻猪样品阳性率(46.25%,296/640)高于非腹泻猪(22.5%,72/320)。本文汇总统计的结果发现:通过累加得到的腹泻猪样品阳性率为49.33%(1768/3594),健 康 猪 的 样 品 阳 率 为 39.69%(77/194),阳性率相差9.6%,统计学差异极显著。多数研究结果认为PKV 与新生仔猪腹泻相关,但国内关于PKV 的调查较零散、省份范围和样品数量偏少,期望今后能有大样本横断面调查结果,以指导养殖实践。